196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2088 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2088  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 242 aa  503  9.999999999999999e-143  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2582  beta-lactamase domain protein  57.68 
 
 		 239 aa  295  3e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0485  beta-lactamase domain-containing protein  56.49 
 
 		 240 aa  272  4.0000000000000004e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.300873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2337  beta-lactamase-like  50 
 
 		 240 aa  260  1e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1016  hypothetical protein  48.96 
 
 		 239 aa  239  2e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0528  ATP-binding protein PhnP  47.15 
 
 		 246 aa  223  2e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0189  beta-lactamase domain-containing protein  48.25 
 
 		 245 aa  223  3e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0908747  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1954  beta-lactamase-like protein  45.02 
 
 		 248 aa  204  7e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3434  beta-lactamase domain protein  35.27 
 
 		 274 aa  125  6e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3330  beta-lactamase domain protein  35.27 
 
 		 253 aa  107  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0878  beta-lactamase domain protein  33.47 
 
 		 261 aa  106  4e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3277  beta-lactamase domain protein  33.19 
 
 		 253 aa  102  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0332  beta-lactamase domain protein  30.96 
 
 		 251 aa  102  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0199  phosphonate metabolism  31.68 
 
 		 286 aa  102  7e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0038087  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2213  beta-lactamase domain protein  32.56 
 
 		 292 aa  102  8e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.104031  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0314  beta-lactamase domain protein  32.22 
 
 		 251 aa  101  9e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0765  Beta-lactamase-like  30.17 
 
 		 264 aa  100  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0734  beta-lactamase domain protein  33.61 
 
 		 278 aa  99.8  4e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2465  metallo-beta-lactamase family protein  34.57 
 
 		 251 aa  97.8  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0205  beta-lactamase domain protein  33.2 
 
 		 270 aa  97.8  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0553  beta-lactamase domain-containing protein  30.33 
 
 		 251 aa  97.4  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2630  beta-lactamase-like  31.4 
 
 		 260 aa  95.5  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.521897  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0540  PhnP protein  29.36 
 
 		 253 aa  93.6  3e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.14987  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0013  beta-lactamase domain protein  35.19 
 
 		 253 aa  92.8  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.173708 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11000  beta-lactamase domain protein  30.34 
 
 		 252 aa  92  8e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00714887  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3063  beta-lactamase domain protein  30.04 
 
 		 254 aa  91.3  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00796605 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1107  beta-lactamase domain protein  32.33 
 
 		 252 aa  87.8  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1876  beta-lactamase domain protein  33.76 
 
 		 261 aa  87.8  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0135  beta-lactamase domain protein  27.85 
 
 		 252 aa  87.8  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0993  metallo-beta-lactamase family protein  32.33 
 
 		 252 aa  87.8  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.364222  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0580  metallo-beta-lactamase family protein  24.9 
 
 		 264 aa  87  2e-16  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3413  beta-lactamase domain-containing protein  29.22 
 
 		 255 aa  87.8  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615146  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09578  hydrolase, metal-dependent  29.92 
 
 		 253 aa  87  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.513248  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0921  beta-lactamase domain protein  29.52 
 
 		 270 aa  87.4  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  28.68 
 
 		 492 aa  86.3  4e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1298  PhnP-like protein  30.58 
 
 		 274 aa  86.3  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.127042  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1261  beta-lactamase-like protein  29.9 
 
 		 254 aa  83.2  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.181589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0488  beta-lactamase domain-containing protein  31.21 
 
 		 254 aa  83.6  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.932747  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2544  PhnP-like protein  31.25 
 
 		 275 aa  82.8  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.797723 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0150  beta-lactamase domain protein  27 
 
 		 253 aa  82.8  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2787  metal-dependent hydrolase  27 
 
 		 254 aa  82.4  0.000000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.145562 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0280  metallo-beta-lactamase domain protein  28.81 
 
 		 253 aa  79  0.00000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000676724  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2010  beta-lactamase domain protein  41.51 
 
 		 257 aa  77.4  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1496  putative hydrolase protein  41.38 
 
 		 100 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.51917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2057  beta-lactamase domain-containing protein  25.51 
 
 		 259 aa  77  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1284  beta-lactamase domain protein  25.42 
 
 		 254 aa  76.3  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105861  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2290  beta-lactamase domain protein  27.8 
 
 		 255 aa  75.9  0.0000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.466086  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0143  Beta-lactamase-like  37.93 
 
 		 264 aa  75.5  0.0000000000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1274  beta-lactamase-like  32.24 
 
 		 265 aa  74.7  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.31947  normal  0.453666 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1800  beta-lactamase domain protein  27.62 
 
 		 274 aa  73.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0131454  normal  0.0301094 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0985  metallo-beta-lactamase family protein  37.93 
 
 		 263 aa  73.2  0.000000000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2496  beta-lactamase domain protein  39.29 
 
 		 252 aa  73.2  0.000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00269298  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2442  beta-lactamase domain-containing protein  28.03 
 
 		 254 aa  72.8  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123697  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6919  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 		 269 aa  72  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0659  hydrolase, metal-dependent, putative  36.07 
 
 		 266 aa  71.2  0.00000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0316  beta-lactamase domain-containing protein  37.04 
 
 		 255 aa  70.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1937  beta-lactamase-like  25.44 
 
 		 255 aa  70.9  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4023  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  31.76 
 
 		 250 aa  70.5  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3702  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  31.76 
 
 		 250 aa  70.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3568  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  31.76 
 
 		 250 aa  70.5  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2567  phosphonate metabolism protein, PhnP  30.94 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0979832  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0676  PhnP-like protein  27.54 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.136229  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2330  PhnP-like protein  27.54 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.500719 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3594  beta-lactamase-like  26.97 
 
 		 265 aa  67  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.545282 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0432  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  28.26 
 
 		 260 aa  67  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0467  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  28.26 
 
 		 260 aa  67  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.169568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2160  metal dependent hydrolase  26.78 
 
 		 272 aa  67  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1316  phosphonate metabolism protein PhnP  29.9 
 
 		 249 aa  64.7  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121557  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5898  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  29 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323021 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6165  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  29 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.494701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4141  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  27.9 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1173  beta-lactamase domain protein  27.32 
 
 		 246 aa  63.9  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.15164  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4098  hypothetical protein  27.92 
 
 		 265 aa  63.9  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230981 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5968  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  28.12 
 
 		 307 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0824566  normal  0.0122877 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2707  putative hydrolase  28.75 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3246  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  27.55 
 
 		 307 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5122  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  27.55 
 
 		 307 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.1765  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1988  beta-lactamase domain protein  25.1 
 
 		 274 aa  63.5  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.885217  normal  0.0198893 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0512  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  26.64 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1586  beta-lactamase-like protein  27.64 
 
 		 267 aa  62.8  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1516  beta-lactamase domain-containing protein  27.16 
 
 		 267 aa  62.8  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1699  Beta-lactamase-like  27.9 
 
 		 267 aa  62.8  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133966  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4701  beta-lactamase domain protein  26.74 
 
 		 268 aa  62.8  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0311936 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20450  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  31.14 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.214049  normal  0.511622 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1532  metal-dependent hydrolase  25.52 
 
 		 265 aa  62.4  0.000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.494677 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2090  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  27.71 
 
 		 255 aa  62  0.000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2524  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  26.75 
 
 		 258 aa  62  0.000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.632538 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0487  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  28.07 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1460  hypothetical protein  26.05 
 
 		 267 aa  61.6  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.349178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2719  putative hydrolase  25.6 
 
 		 266 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0507266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2006  hypothetical protein  27.31 
 
 		 267 aa  61.6  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0556824  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5159  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  30.18 
 
 		 307 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.673339 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2878  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  29.49 
 
 		 254 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4185  beta-lactamase-like protein  25.83 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0919  beta-lactamase domain protein  28.04 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0554  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0031  beta-lactamase domain protein  32.48 
 
 		 262 aa  61.2  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.208776  normal  0.175633 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1288  beta-lactamase domain-containing protein  26.05 
 
 		 284 aa  60.5  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.263316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4556  beta-lactamase-like protein  25.83 
 
 		 272 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.305264 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6466  beta-lactamase-like protein  37.78 
 
 		 269 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408114  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>