156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2544 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2544  PhnP-like protein  100 
 
 
275 aa  548  1e-155  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.797723 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3434  beta-lactamase domain protein  72.73 
 
 
274 aa  401  1e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1298  PhnP-like protein  73.09 
 
 
274 aa  355  5e-97  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.127042  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2213  beta-lactamase domain protein  58.91 
 
 
292 aa  321  9.000000000000001e-87  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.104031  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0734  beta-lactamase domain protein  61.87 
 
 
278 aa  297  1e-79  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0528  ATP-binding protein PhnP  36.2 
 
 
246 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0189  beta-lactamase domain-containing protein  37.5 
 
 
245 aa  154  1e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0908747  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2337  beta-lactamase-like  34.55 
 
 
240 aa  143  3e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462445  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2582  beta-lactamase domain protein  35.87 
 
 
239 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0485  beta-lactamase domain-containing protein  35.14 
 
 
240 aa  132  6e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.300873  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1954  beta-lactamase-like protein  31.65 
 
 
248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2088  beta-lactamase domain-containing protein  35 
 
 
242 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1016  hypothetical protein  36.02 
 
 
239 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0332  beta-lactamase domain protein  30.35 
 
 
251 aa  88.2  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3277  beta-lactamase domain protein  29.7 
 
 
253 aa  88.2  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0314  beta-lactamase domain protein  28.77 
 
 
251 aa  87.8  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0765  Beta-lactamase-like  28.89 
 
 
264 aa  86.7  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0205  beta-lactamase domain protein  28.94 
 
 
270 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0135  beta-lactamase domain protein  28.94 
 
 
252 aa  83.6  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0553  beta-lactamase domain-containing protein  27.4 
 
 
251 aa  82.4  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11000  beta-lactamase domain protein  26.25 
 
 
252 aa  82  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00714887  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3330  beta-lactamase domain protein  30.89 
 
 
253 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0659  hydrolase, metal-dependent, putative  27.27 
 
 
266 aa  79.7  0.00000000000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0143  Beta-lactamase-like  38.53 
 
 
264 aa  79.7  0.00000000000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0878  beta-lactamase domain protein  27.92 
 
 
261 aa  79.3  0.00000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0013  beta-lactamase domain protein  27.17 
 
 
253 aa  79.3  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.173708 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2057  beta-lactamase domain-containing protein  29 
 
 
259 aa  78.2  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2630  beta-lactamase-like  29 
 
 
260 aa  78.2  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.521897  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0150  beta-lactamase domain protein  30.54 
 
 
253 aa  76.6  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2787  metal-dependent hydrolase  26.25 
 
 
254 aa  76.3  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.145562 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0985  metallo-beta-lactamase family protein  32 
 
 
263 aa  75.5  0.0000000000009  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2465  metallo-beta-lactamase family protein  28.68 
 
 
251 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  25.36 
 
 
492 aa  73.6  0.000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0199  phosphonate metabolism  28.14 
 
 
286 aa  72.8  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0038087  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2290  beta-lactamase domain protein  28.17 
 
 
255 aa  72.4  0.000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.466086  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0540  PhnP protein  28.02 
 
 
253 aa  72.4  0.000000000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.14987  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2496  beta-lactamase domain protein  29.03 
 
 
252 aa  72  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00269298  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3063  beta-lactamase domain protein  24.18 
 
 
254 aa  70.9  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00796605 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1586  beta-lactamase-like protein  38.1 
 
 
267 aa  70.5  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1876  beta-lactamase domain protein  25.29 
 
 
261 aa  70.5  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1284  beta-lactamase domain protein  30.33 
 
 
254 aa  68.9  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105861  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1107  beta-lactamase domain protein  26.64 
 
 
252 aa  68.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0993  metallo-beta-lactamase family protein  26.64 
 
 
252 aa  68.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.364222  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09578  hydrolase, metal-dependent  22.81 
 
 
253 aa  68.2  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.513248  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0580  metallo-beta-lactamase family protein  35.2 
 
 
264 aa  68.2  0.0000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1496  putative hydrolase protein  40.7 
 
 
100 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.51917  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3413  beta-lactamase domain-containing protein  27.1 
 
 
255 aa  67.8  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615146  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0316  beta-lactamase domain-containing protein  25.57 
 
 
255 aa  66.6  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0921  beta-lactamase domain protein  24.11 
 
 
270 aa  65.5  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0488  beta-lactamase domain-containing protein  36.29 
 
 
254 aa  64.7  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.932747  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1274  beta-lactamase-like  35.16 
 
 
265 aa  63.5  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.31947  normal  0.453666 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2010  beta-lactamase domain protein  40.7 
 
 
257 aa  63.9  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0280  metallo-beta-lactamase domain protein  26.22 
 
 
253 aa  63.5  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000676724  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0907  beta-lactamase domain-containing protein  32.34 
 
 
267 aa  63.2  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0676243  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1261  beta-lactamase-like protein  30.24 
 
 
254 aa  62.4  0.000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.181589  normal 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4141  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  28.8 
 
 
251 aa  60.8  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0861  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  26.43 
 
 
305 aa  58.5  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5605  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  25.47 
 
 
252 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0432  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  38.39 
 
 
260 aa  58.5  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0467  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  38.39 
 
 
260 aa  58.5  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.169568  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3702  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  26.42 
 
 
250 aa  58.5  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0997  hypothetical protein  27.31 
 
 
272 aa  58.2  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0676  PhnP-like protein  29.94 
 
 
265 aa  57.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.136229  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2090  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  25.19 
 
 
255 aa  58.2  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1937  beta-lactamase-like  28.83 
 
 
255 aa  57.4  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4045  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  25.58 
 
 
261 aa  57.4  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0225  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  25.58 
 
 
261 aa  57.4  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2330  PhnP-like protein  29.94 
 
 
265 aa  57.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.500719 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0964  hypothetical protein  27.31 
 
 
272 aa  58.2  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.347273  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6466  beta-lactamase-like protein  34.45 
 
 
269 aa  57  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408114  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1532  metal-dependent hydrolase  30.71 
 
 
265 aa  57.4  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.494677 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4701  beta-lactamase domain protein  36.04 
 
 
268 aa  57  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0311936 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2442  beta-lactamase domain-containing protein  29.01 
 
 
254 aa  57  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123697  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2160  metal dependent hydrolase  24.91 
 
 
272 aa  57  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2288  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  26.92 
 
 
255 aa  56.6  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.52798  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2524  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  25.29 
 
 
258 aa  56.2  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.632538 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0539  beta-lactamase domain protein  27.57 
 
 
265 aa  56.2  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3568  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  26.69 
 
 
250 aa  56.2  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4023  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  26.69 
 
 
250 aa  56.2  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4556  beta-lactamase-like protein  33.91 
 
 
272 aa  55.8  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.305264 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0793  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  26.6 
 
 
300 aa  55.5  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.824687  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4185  beta-lactamase-like protein  33.91 
 
 
272 aa  55.5  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1757  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  36.61 
 
 
256 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0735161  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0512  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  25.29 
 
 
260 aa  55.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3594  beta-lactamase-like  33.64 
 
 
265 aa  54.7  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.545282 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20450  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  37.17 
 
 
256 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.214049  normal  0.511622 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5968  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  27.23 
 
 
307 aa  53.5  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0824566  normal  0.0122877 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2567  phosphonate metabolism protein, PhnP  34.82 
 
 
249 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0979832  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6919  beta-lactamase domain protein  33.63 
 
 
269 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2081  beta-lactamase domain-containing protein  28.9 
 
 
272 aa  53.5  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4098  hypothetical protein  23.89 
 
 
265 aa  52.4  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0230981 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2297  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  27.75 
 
 
251 aa  52.4  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2147  beta-lactamase domain-containing protein  26.51 
 
 
266 aa  51.6  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1699  Beta-lactamase-like  34.44 
 
 
267 aa  51.6  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133966  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1451  beta-lactamase-like protein  31.97 
 
 
284 aa  50.8  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.935768  hitchhiker  0.000511853 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6165  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  27.07 
 
 
307 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.494701  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2449  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  26.32 
 
 
300 aa  50.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0422366 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5898  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  27.07 
 
 
307 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.323021 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2696  hypothetical protein  27.19 
 
 
268 aa  51.2  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0186749  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0919  beta-lactamase domain protein  27.06 
 
 
268 aa  50.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>