195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3702 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_3702  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  100 
 
 		 250 aa  514  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4023  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  98.8 
 
 		 250 aa  506  9.999999999999999e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3568  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  98.4 
 
 		 250 aa  505  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0512  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  65.18 
 
 		 260 aa  343  1e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0583  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  56.5 
 
 		 257 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0487  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  56.67 
 
 		 265 aa  285  4e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0296  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  52.61 
 
 		 252 aa  276  2e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.236011 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2686  phosphonate metabolism protein PhnP  54.22 
 
 		 249 aa  274  1.0000000000000001e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188088  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5605  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  49.2 
 
 		 252 aa  265  7e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1757  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  54.3 
 
 		 256 aa  262  4e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0735161  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03964  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  50 
 
 		 252 aa  259  2e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3899  phosphonate metabolism protein PhnP  50 
 
 		 252 aa  259  2e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03924  hypothetical protein  50 
 
 		 252 aa  259  2e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3934  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  50 
 
 		 252 aa  259  2e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1316  phosphonate metabolism protein PhnP  52.21 
 
 		 249 aa  259  2e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121557  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20450  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  54.3 
 
 		 256 aa  259  3e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.214049  normal  0.511622 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4558  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  49.17 
 
 		 252 aa  258  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4333  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  49.58 
 
 		 252 aa  258  9e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4646  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  49.17 
 
 		 252 aa  257  1e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2288  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  51 
 
 		 255 aa  255  4e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.52798  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2567  phosphonate metabolism protein, PhnP  51.41 
 
 		 249 aa  247  1e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0979832  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2878  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  52.99 
 
 		 254 aa  246  4e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3684  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  46.67 
 
 		 255 aa  245  4.9999999999999997e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0432  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  49.6 
 
 		 260 aa  245  6e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0467  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  49.6 
 
 		 260 aa  245  6e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.169568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2090  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  45.42 
 
 		 255 aa  241  9e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2524  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  49.8 
 
 		 258 aa  238  5.999999999999999e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.632538 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4141  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  48.15 
 
 		 251 aa  235  6e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2259  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  52 
 
 		 250 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.373165  normal  0.710906 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2297  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  47.33 
 
 		 251 aa  231  7.000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4045  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  50 
 
 		 261 aa  229  4e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0225  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  50 
 
 		 261 aa  229  4e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1173  beta-lactamase domain protein  34.23 
 
 		 246 aa  133  3e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.15164  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0878  beta-lactamase domain protein  30.42 
 
 		 261 aa  107  1e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2630  beta-lactamase-like  30.53 
 
 		 260 aa  102  8e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.521897  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0921  beta-lactamase domain protein  30.86 
 
 		 270 aa  99.4  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0199  phosphonate metabolism  30.8 
 
 		 286 aa  99  7e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0038087  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1876  beta-lactamase domain protein  31 
 
 		 261 aa  97.1  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2010  beta-lactamase domain protein  31.56 
 
 		 257 aa  94  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0553  beta-lactamase domain-containing protein  28.52 
 
 		 251 aa  93.2  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0150  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 		 253 aa  92.8  5e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0332  beta-lactamase domain protein  30.19 
 
 		 251 aa  92.4  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0205  beta-lactamase domain protein  29.3 
 
 		 270 aa  92.4  6e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0314  beta-lactamase domain protein  29.28 
 
 		 251 aa  91.3  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0765  Beta-lactamase-like  29.55 
 
 		 264 aa  90.5  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0013  beta-lactamase domain protein  28.3 
 
 		 253 aa  88.6  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.173708 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0993  metallo-beta-lactamase family protein  29.66 
 
 		 252 aa  87  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.364222  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1107  beta-lactamase domain protein  29.66 
 
 		 252 aa  87  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2442  beta-lactamase domain-containing protein  29.1 
 
 		 254 aa  87  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123697  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2465  metallo-beta-lactamase family protein  30.04 
 
 		 251 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1016  hypothetical protein  29.25 
 
 		 239 aa  84.7  0.000000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3413  beta-lactamase domain-containing protein  28.52 
 
 		 255 aa  84  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615146  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3330  beta-lactamase domain protein  30.45 
 
 		 253 aa  84  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3277  beta-lactamase domain protein  28.68 
 
 		 253 aa  82.4  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3063  beta-lactamase domain protein  26.72 
 
 		 254 aa  81.6  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00796605 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09578  hydrolase, metal-dependent  28.3 
 
 		 253 aa  81.3  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.513248  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2057  beta-lactamase domain-containing protein  27.88 
 
 		 259 aa  80.5  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0540  PhnP protein  26.49 
 
 		 253 aa  80.5  0.00000000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.14987  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2290  beta-lactamase domain protein  28.47 
 
 		 255 aa  79.7  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.466086  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0031  beta-lactamase domain protein  29.86 
 
 		 262 aa  79.7  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.208776  normal  0.175633 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2496  beta-lactamase domain protein  25.1 
 
 		 252 aa  79.7  0.00000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00269298  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0135  beta-lactamase domain protein  29.3 
 
 		 252 aa  79  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0316  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 		 255 aa  77.8  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2787  metal-dependent hydrolase  24.72 
 
 		 254 aa  76.3  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.145562 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11000  beta-lactamase domain protein  25.45 
 
 		 252 aa  75.5  0.0000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00714887  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1274  beta-lactamase-like  29.3 
 
 		 265 aa  73.9  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.31947  normal  0.453666 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1586  beta-lactamase-like protein  30.77 
 
 		 267 aa  71.6  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2088  beta-lactamase domain-containing protein  31.76 
 
 		 242 aa  70.9  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0985  metallo-beta-lactamase family protein  24.91 
 
 		 263 aa  68.9  0.00000000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0580  metallo-beta-lactamase family protein  26.94 
 
 		 264 aa  67.4  0.0000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4701  beta-lactamase domain protein  28.68 
 
 		 268 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0311936 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0280  metallo-beta-lactamase domain protein  25.28 
 
 		 253 aa  66.6  0.0000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000676724  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  27.8 
 
 		 492 aa  65.9  0.0000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1460  hypothetical protein  27.74 
 
 		 267 aa  65.1  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.349178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1699  Beta-lactamase-like  27.47 
 
 		 267 aa  64.3  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133966  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1937  beta-lactamase-like  29.1 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0488  beta-lactamase domain-containing protein  28.46 
 
 		 254 aa  63.9  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.932747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0143  Beta-lactamase-like  25.84 
 
 		 264 aa  63.5  0.000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2337  beta-lactamase-like  28.63 
 
 		 240 aa  63.5  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0528  ATP-binding protein PhnP  27.07 
 
 		 246 aa  62.4  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1516  beta-lactamase domain-containing protein  29.18 
 
 		 267 aa  62  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6919  beta-lactamase domain protein  28.42 
 
 		 269 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1284  beta-lactamase domain protein  24.16 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1496  putative hydrolase protein  37.63 
 
 		 100 aa  60.8  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.51917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1261  beta-lactamase-like protein  25.75 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.181589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0676  PhnP-like protein  26.91 
 
 		 265 aa  58.9  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.136229  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2330  PhnP-like protein  26.91 
 
 		 265 aa  58.9  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.500719 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4556  beta-lactamase-like protein  27.01 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.305264 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1451  beta-lactamase-like protein  27.44 
 
 		 284 aa  57.8  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.935768  hitchhiker  0.000511853 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0485  beta-lactamase domain-containing protein  31.36 
 
 		 240 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.300873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1954  beta-lactamase-like protein  27.31 
 
 		 248 aa  57  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0189  beta-lactamase domain-containing protein  26.96 
 
 		 245 aa  57  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0908747  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4185  beta-lactamase-like protein  27.01 
 
 		 272 aa  57  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2582  beta-lactamase domain protein  28.21 
 
 		 239 aa  57  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4389  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 		 269 aa  57  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2881  beta-lactamase-like  31.14 
 
 		 285 aa  55.8  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.252377  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1860  beta-lactamase domain protein  30 
 
 		 297 aa  55.5  0.0000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.150092 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0907  beta-lactamase domain-containing protein  25.47 
 
 		 267 aa  54.7  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0676243  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4098  hypothetical protein  26.39 
 
 		 265 aa  54.3  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230981 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2921  beta-lactamase domain protein  31.58 
 
 		 251 aa  53.9  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0261886  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>