158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0487 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0487  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  100 
 
 		 265 aa  543  1e-154  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0583  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  90.23 
 
 		 257 aa  481  1e-135  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0512  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  58.3 
 
 		 260 aa  289  3e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3568  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  56.5 
 
 		 250 aa  289  4e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4023  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  56.1 
 
 		 250 aa  287  1e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3702  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  55.69 
 
 		 250 aa  285  5e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5605  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  50 
 
 		 252 aa  258  7e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03964  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  50.42 
 
 		 252 aa  255  5e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3899  phosphonate metabolism protein PhnP  50.42 
 
 		 252 aa  255  5e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03924  hypothetical protein  50.42 
 
 		 252 aa  255  5e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4558  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  50.42 
 
 		 252 aa  254  8e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0296  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  50.81 
 
 		 252 aa  253  2.0000000000000002e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.236011 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3934  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  50.42 
 
 		 252 aa  250  1e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2686  phosphonate metabolism protein PhnP  51.63 
 
 		 249 aa  249  3e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188088  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4333  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  49.58 
 
 		 252 aa  249  4e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4646  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  49.16 
 
 		 252 aa  248  5e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0432  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  50.2 
 
 		 260 aa  247  2e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0467  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  50.2 
 
 		 260 aa  247  2e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.169568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3684  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  49.01 
 
 		 255 aa  244  8e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2090  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  48.16 
 
 		 255 aa  243  3e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1757  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  50 
 
 		 256 aa  239  4e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0735161  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1316  phosphonate metabolism protein PhnP  49.59 
 
 		 249 aa  237  1e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121557  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20450  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  49.21 
 
 		 256 aa  236  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.214049  normal  0.511622 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4045  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  50.2 
 
 		 261 aa  231  7.000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0225  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  50.2 
 
 		 261 aa  231  7.000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2567  phosphonate metabolism protein, PhnP  48.98 
 
 		 249 aa  228  6e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0979832  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2288  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  49.17 
 
 		 255 aa  225  5.0000000000000005e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.52798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2297  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  46.37 
 
 		 251 aa  220  1.9999999999999999e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2524  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  46.15 
 
 		 258 aa  219  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.632538 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4141  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  45.97 
 
 		 251 aa  219  3e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2878  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  47.6 
 
 		 254 aa  218  6e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2259  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  48.57 
 
 		 250 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.373165  normal  0.710906 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1173  beta-lactamase domain protein  33.94 
 
 		 246 aa  132  6e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.15164  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0150  beta-lactamase domain protein  32.84 
 
 		 253 aa  108  8.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2787  metal-dependent hydrolase  29.32 
 
 		 254 aa  106  5e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.145562 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0921  beta-lactamase domain protein  31.2 
 
 		 270 aa  105  7e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3277  beta-lactamase domain protein  30.19 
 
 		 253 aa  101  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0013  beta-lactamase domain protein  30.27 
 
 		 253 aa  101  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.173708 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2290  beta-lactamase domain protein  32.36 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.466086  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0199  phosphonate metabolism  32.83 
 
 		 286 aa  100  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0038087  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0765  Beta-lactamase-like  32.06 
 
 		 264 aa  99  7e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0205  beta-lactamase domain protein  28.83 
 
 		 270 aa  95.9  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0135  beta-lactamase domain protein  29.34 
 
 		 252 aa  92.8  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0553  beta-lactamase domain-containing protein  28.3 
 
 		 251 aa  92.4  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2630  beta-lactamase-like  29.48 
 
 		 260 aa  92  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.521897  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1876  beta-lactamase domain protein  29.43 
 
 		 261 aa  91.7  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1016  hypothetical protein  29.02 
 
 		 239 aa  90.1  3e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2465  metallo-beta-lactamase family protein  32.95 
 
 		 251 aa  89.7  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2442  beta-lactamase domain-containing protein  30.08 
 
 		 254 aa  89  7e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123697  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3330  beta-lactamase domain protein  30.83 
 
 		 253 aa  88.6  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0540  PhnP protein  27.86 
 
 		 253 aa  88.6  1e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.14987  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0878  beta-lactamase domain protein  28.73 
 
 		 261 aa  88.2  1e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3413  beta-lactamase domain-containing protein  30.65 
 
 		 255 aa  85.9  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615146  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11000  beta-lactamase domain protein  29.12 
 
 		 252 aa  85.5  8e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00714887  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0332  beta-lactamase domain protein  30.38 
 
 		 251 aa  85.5  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1586  beta-lactamase-like protein  29.78 
 
 		 267 aa  85.1  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3063  beta-lactamase domain protein  26.25 
 
 		 254 aa  85.1  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00796605 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09578  hydrolase, metal-dependent  28.52 
 
 		 253 aa  85.1  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.513248  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0314  beta-lactamase domain protein  29.89 
 
 		 251 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2496  beta-lactamase domain protein  26.82 
 
 		 252 aa  83.6  0.000000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00269298  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2057  beta-lactamase domain-containing protein  28.03 
 
 		 259 aa  81.6  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0031  beta-lactamase domain protein  28.62 
 
 		 262 aa  79.3  0.00000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.208776  normal  0.175633 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1284  beta-lactamase domain protein  24.52 
 
 		 254 aa  79.7  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2010  beta-lactamase domain protein  30.19 
 
 		 257 aa  78.2  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0280  metallo-beta-lactamase domain protein  28.84 
 
 		 253 aa  75.9  0.0000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000676724  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0993  metallo-beta-lactamase family protein  27.92 
 
 		 252 aa  74.7  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.364222  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1107  beta-lactamase domain protein  27.92 
 
 		 252 aa  74.7  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  27.34 
 
 		 492 aa  71.2  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1274  beta-lactamase-like  28.47 
 
 		 265 aa  70.9  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.31947  normal  0.453666 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1954  beta-lactamase-like protein  27.45 
 
 		 248 aa  68.2  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1487  putative hydrolase protein  36.72 
 
 		 150 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010251  normal  0.184019 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0316  beta-lactamase domain-containing protein  27.65 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2582  beta-lactamase domain protein  29.44 
 
 		 239 aa  65.5  0.0000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2337  beta-lactamase-like  27.11 
 
 		 240 aa  65.1  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0485  beta-lactamase domain-containing protein  30.7 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.300873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1585  beta-lactamase-like  27.24 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0580  metallo-beta-lactamase family protein  25.09 
 
 		 264 aa  62.4  0.000000008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1532  metal-dependent hydrolase  26.74 
 
 		 265 aa  62.4  0.000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.494677 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47617  predicted protein  28.78 
 
 		 372 aa  61.6  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.261739  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1699  Beta-lactamase-like  24.81 
 
 		 267 aa  60.8  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133966  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0985  metallo-beta-lactamase family protein  23.42 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2088  beta-lactamase domain-containing protein  28.07 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0143  Beta-lactamase-like  22.06 
 
 		 264 aa  60.5  0.00000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0528  ATP-binding protein PhnP  24.12 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0655  beta-lactamase domain protein  27.19 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000122219  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0189  beta-lactamase domain-containing protein  25.44 
 
 		 245 aa  58.2  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0908747  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1460  hypothetical protein  26.62 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.349178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0676  PhnP-like protein  26.39 
 
 		 265 aa  56.6  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.136229  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1937  beta-lactamase-like  26.62 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2330  PhnP-like protein  26.39 
 
 		 265 aa  56.6  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.500719 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0652  beta-lactamase domain-containing protein  27.8 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1451  beta-lactamase-like protein  27.14 
 
 		 284 aa  56.2  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.935768  hitchhiker  0.000511853 
 
 
-
 
NC_002620  TC0659  hydrolase, metal-dependent, putative  25.55 
 
 		 266 aa  55.5  0.0000009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0554  beta-lactamase domain-containing protein  29 
 
 		 265 aa  55.5  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1558  sulphohydrolase/glycosulfatase, Zn-dependent hydrolase  26.46 
 
 		 248 aa  54.7  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.136554  normal  0.849954 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0919  beta-lactamase domain protein  28.36 
 
 		 268 aa  55.1  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0997  hypothetical protein  25.78 
 
 		 272 aa  54.7  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0754  beta-lactamase-like  26.05 
 
 		 244 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0374984  normal  0.146735 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0964  hypothetical protein  25.78 
 
 		 272 aa  54.7  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.347273  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4701  beta-lactamase domain protein  26.92 
 
 		 268 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0311936 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>