212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0332 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0332  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 251 aa  514  1.0000000000000001e-145  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0314  beta-lactamase domain protein  95.22 
 
 		 251 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0553  beta-lactamase domain-containing protein  70.12 
 
 		 251 aa  374  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0765  Beta-lactamase-like  66.93 
 
 		 264 aa  359  2e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2465  metallo-beta-lactamase family protein  69.72 
 
 		 251 aa  355  3.9999999999999996e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3413  beta-lactamase domain-containing protein  61.75 
 
 		 255 aa  334  7e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615146  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3330  beta-lactamase domain protein  60.16 
 
 		 253 aa  322  4e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0199  phosphonate metabolism  55.16 
 
 		 286 aa  288  7e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0038087  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11000  beta-lactamase domain protein  47.6 
 
 		 252 aa  250  1e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00714887  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0205  beta-lactamase domain protein  49.8 
 
 		 270 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2630  beta-lactamase-like  45.31 
 
 		 260 aa  234  9e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.521897  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2496  beta-lactamase domain protein  44.05 
 
 		 252 aa  232  3e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00269298  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1107  beta-lactamase domain protein  45.24 
 
 		 252 aa  227  1e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0993  metallo-beta-lactamase family protein  45.24 
 
 		 252 aa  227  1e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.364222  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0135  beta-lactamase domain protein  44.05 
 
 		 252 aa  221  8e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0150  beta-lactamase domain protein  40.48 
 
 		 253 aa  221  9.999999999999999e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2010  beta-lactamase domain protein  43.03 
 
 		 257 aa  212  3.9999999999999995e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09578  hydrolase, metal-dependent  39.76 
 
 		 253 aa  204  1e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.513248  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2290  beta-lactamase domain protein  43.53 
 
 		 255 aa  204  1e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.466086  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0878  beta-lactamase domain protein  42.25 
 
 		 261 aa  202  4e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0316  beta-lactamase domain-containing protein  39.53 
 
 		 255 aa  197  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2787  metal-dependent hydrolase  35.83 
 
 		 254 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.145562 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3277  beta-lactamase domain protein  37.94 
 
 		 253 aa  196  3e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0554  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 		 265 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6919  beta-lactamase domain protein  42.75 
 
 		 269 aa  191  9e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3594  beta-lactamase-like  39.92 
 
 		 265 aa  191  1e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.545282 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1585  beta-lactamase-like  38.64 
 
 		 272 aa  189  5e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1274  beta-lactamase-like  39.15 
 
 		 265 aa  188  7e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.31947  normal  0.453666 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3063  beta-lactamase domain protein  35.97 
 
 		 254 aa  187  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00796605 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0676  PhnP-like protein  38.08 
 
 		 265 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.136229  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1516  beta-lactamase domain-containing protein  42.37 
 
 		 267 aa  186  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2330  PhnP-like protein  38.08 
 
 		 265 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.500719 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1532  metal-dependent hydrolase  38.85 
 
 		 265 aa  185  5e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.494677 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0540  PhnP protein  38.98 
 
 		 253 aa  185  5e-46  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.14987  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0488  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 		 254 aa  185  6e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.932747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2696  hypothetical protein  40.6 
 
 		 268 aa  184  9e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0186749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1284  beta-lactamase domain protein  36.22 
 
 		 254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2160  metal dependent hydrolase  37.26 
 
 		 272 aa  181  8.000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2707  putative hydrolase  39.85 
 
 		 270 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2006  hypothetical protein  36.26 
 
 		 267 aa  179  4.999999999999999e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0556824  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2683  putative hydrolase  38.85 
 
 		 266 aa  176  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0797349  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1288  beta-lactamase domain-containing protein  36.64 
 
 		 284 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.263316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0013  beta-lactamase domain protein  35.83 
 
 		 253 aa  176  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.173708 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3118  hypothetical protein  38.4 
 
 		 267 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134685  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4098  hypothetical protein  37.4 
 
 		 265 aa  176  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230981 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2081  beta-lactamase domain-containing protein  37.26 
 
 		 272 aa  175  6e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2442  beta-lactamase domain-containing protein  34.9 
 
 		 254 aa  174  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123697  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4701  beta-lactamase domain protein  38.26 
 
 		 268 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0311936 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0280  metallo-beta-lactamase domain protein  37.15 
 
 		 253 aa  172  3.9999999999999995e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000676724  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1460  hypothetical protein  35.88 
 
 		 267 aa  172  5e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.349178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2719  putative hydrolase  37.02 
 
 		 266 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0507266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1261  beta-lactamase-like protein  39.53 
 
 		 254 aa  172  5e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.181589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4185  beta-lactamase-like protein  37.83 
 
 		 272 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4556  beta-lactamase-like protein  37.83 
 
 		 272 aa  171  6.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.305264 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0818  metallo-beta-lactamase family protein  35.74 
 
 		 271 aa  170  2e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.274657  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1800  beta-lactamase domain protein  34.73 
 
 		 274 aa  167  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0131454  normal  0.0301094 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1937  beta-lactamase-like  38.91 
 
 		 255 aa  167  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0997  hypothetical protein  35.36 
 
 		 272 aa  166  2.9999999999999998e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0964  hypothetical protein  35.36 
 
 		 272 aa  166  2.9999999999999998e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.347273  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1988  beta-lactamase domain protein  34.35 
 
 		 274 aa  166  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.885217  normal  0.0198893 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0539  beta-lactamase domain protein  40.68 
 
 		 265 aa  165  8e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  39.13 
 
 		 492 aa  163  2.0000000000000002e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0919  beta-lactamase domain protein  37.6 
 
 		 268 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6466  beta-lactamase-like protein  42.11 
 
 		 269 aa  162  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4389  beta-lactamase domain-containing protein  39.22 
 
 		 269 aa  162  5.0000000000000005e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3115  beta-lactamase-like protein  34.7 
 
 		 272 aa  157  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.402166  normal  0.647891 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1451  beta-lactamase-like protein  33.33 
 
 		 284 aa  157  1e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.935768  hitchhiker  0.000511853 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2057  beta-lactamase domain-containing protein  36.12 
 
 		 259 aa  157  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1699  Beta-lactamase-like  34.35 
 
 		 267 aa  157  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133966  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0580  metallo-beta-lactamase family protein  35.56 
 
 		 264 aa  153  2e-36  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0143  Beta-lactamase-like  36.06 
 
 		 264 aa  152  4e-36  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0985  metallo-beta-lactamase family protein  34.09 
 
 		 263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2147  beta-lactamase domain-containing protein  34.85 
 
 		 266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0031  beta-lactamase domain protein  33.2 
 
 		 262 aa  145  6e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.208776  normal  0.175633 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0907  beta-lactamase domain-containing protein  35.77 
 
 		 267 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0676243  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1016  hypothetical protein  34.6 
 
 		 239 aa  126  3e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1496  putative hydrolase protein  57.58 
 
 		 100 aa  123  3e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.51917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0528  ATP-binding protein PhnP  34.48 
 
 		 246 aa  122  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2337  beta-lactamase-like  34.04 
 
 		 240 aa  122  6e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1954  beta-lactamase-like protein  31.09 
 
 		 248 aa  115  5e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0659  hydrolase, metal-dependent, putative  33.21 
 
 		 266 aa  115  7.999999999999999e-25  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1876  beta-lactamase domain protein  32.09 
 
 		 261 aa  113  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1487  putative hydrolase protein  41.5 
 
 		 150 aa  110  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010251  normal  0.184019 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2088  beta-lactamase domain-containing protein  32.22 
 
 		 242 aa  110  3e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0189  beta-lactamase domain-containing protein  32.47 
 
 		 245 aa  108  1e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0908747  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3568  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  32.45 
 
 		 250 aa  104  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4023  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  32.45 
 
 		 250 aa  104  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0921  beta-lactamase domain protein  30.08 
 
 		 270 aa  100  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0485  beta-lactamase domain-containing protein  35.59 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.300873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0512  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  30.57 
 
 		 260 aa  99.8  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2582  beta-lactamase domain protein  30.54 
 
 		 239 aa  100  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1757  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  31.73 
 
 		 256 aa  99  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0735161  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3702  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  31.32 
 
 		 250 aa  98.6  8e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1586  beta-lactamase-like protein  32.84 
 
 		 267 aa  97.4  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20450  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  31.25 
 
 		 256 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.214049  normal  0.511622 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2686  phosphonate metabolism protein PhnP  30.42 
 
 		 249 aa  94.4  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188088  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2567  phosphonate metabolism protein, PhnP  30.45 
 
 		 249 aa  92  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0979832  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47617  predicted protein  25.76 
 
 		 372 aa  91.7  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.261739  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2297  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  28.78 
 
 		 251 aa  91.3  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5605  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  30.19 
 
 		 252 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>