150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6466 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_6466  beta-lactamase-like protein  100 
 
 
269 aa  535  1e-151  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408114  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6919  beta-lactamase domain protein  86.25 
 
 
269 aa  470  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4701  beta-lactamase domain protein  76.87 
 
 
268 aa  407  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0311936 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4556  beta-lactamase-like protein  74.17 
 
 
272 aa  396  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.305264 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4185  beta-lactamase-like protein  74.54 
 
 
272 aa  396  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1516  beta-lactamase domain-containing protein  73.98 
 
 
267 aa  384  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4098  hypothetical protein  58.11 
 
 
265 aa  319  3e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0230981 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1274  beta-lactamase-like  58.58 
 
 
265 aa  317  2e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.31947  normal  0.453666 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0539  beta-lactamase domain protein  60.75 
 
 
265 aa  312  2.9999999999999996e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1460  hypothetical protein  56.02 
 
 
267 aa  312  4.999999999999999e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.349178  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1532  metal-dependent hydrolase  56.11 
 
 
265 aa  308  8e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.494677 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2683  putative hydrolase  55.81 
 
 
266 aa  303  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0797349  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2006  hypothetical protein  53.38 
 
 
267 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0556824  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2719  putative hydrolase  55.81 
 
 
266 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0507266  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3594  beta-lactamase-like  56.23 
 
 
265 aa  298  7e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.545282 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0676  PhnP-like protein  57.95 
 
 
265 aa  298  9e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.136229  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2330  PhnP-like protein  57.95 
 
 
265 aa  298  9e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.500719 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4389  beta-lactamase domain-containing protein  57.25 
 
 
269 aa  295  4e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0554  beta-lactamase domain-containing protein  57.2 
 
 
265 aa  291  9e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2707  putative hydrolase  53.93 
 
 
270 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3118  hypothetical protein  53.18 
 
 
267 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134685  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0919  beta-lactamase domain protein  56.98 
 
 
268 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2081  beta-lactamase domain-containing protein  50.76 
 
 
272 aa  278  5e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0997  hypothetical protein  49.24 
 
 
272 aa  271  1e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0964  hypothetical protein  49.24 
 
 
272 aa  271  1e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.347273  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3115  beta-lactamase-like protein  51.32 
 
 
272 aa  270  1e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.402166  normal  0.647891 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2696  hypothetical protein  52.99 
 
 
268 aa  266  2e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0186749  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1451  beta-lactamase-like protein  50 
 
 
284 aa  262  4.999999999999999e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.935768  hitchhiker  0.000511853 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2147  beta-lactamase domain-containing protein  51.52 
 
 
266 aa  255  4e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0818  metallo-beta-lactamase family protein  46.59 
 
 
271 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.274657  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1288  beta-lactamase domain-containing protein  48.84 
 
 
284 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.263316  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1585  beta-lactamase-like  49.25 
 
 
272 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2160  metal dependent hydrolase  47.89 
 
 
272 aa  248  5e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1988  beta-lactamase domain protein  46.24 
 
 
274 aa  248  6e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.885217  normal  0.0198893 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1800  beta-lactamase domain protein  46.24 
 
 
274 aa  247  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0131454  normal  0.0301094 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1699  Beta-lactamase-like  44.81 
 
 
267 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133966  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1261  beta-lactamase-like protein  42.96 
 
 
254 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.181589  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0488  beta-lactamase domain-containing protein  42.11 
 
 
254 aa  190  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.932747  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3413  beta-lactamase domain-containing protein  41.76 
 
 
255 aa  185  6e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615146  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0553  beta-lactamase domain-containing protein  40.46 
 
 
251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0199  phosphonate metabolism  39.46 
 
 
286 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0038087  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0316  beta-lactamase domain-containing protein  39.39 
 
 
255 aa  182  5.0000000000000004e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2290  beta-lactamase domain protein  39.46 
 
 
255 aa  181  1e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.466086  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1937  beta-lactamase-like  40.37 
 
 
255 aa  180  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0993  metallo-beta-lactamase family protein  39.69 
 
 
252 aa  180  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.364222  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1107  beta-lactamase domain protein  39.69 
 
 
252 aa  180  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11000  beta-lactamase domain protein  36.6 
 
 
252 aa  180  2.9999999999999997e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00714887  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2465  metallo-beta-lactamase family protein  42.42 
 
 
251 aa  179  4e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0765  Beta-lactamase-like  39.02 
 
 
264 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3330  beta-lactamase domain protein  40 
 
 
253 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0205  beta-lactamase domain protein  39.41 
 
 
270 aa  176  3e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0332  beta-lactamase domain protein  42.42 
 
 
251 aa  176  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0314  beta-lactamase domain protein  42.8 
 
 
251 aa  175  6e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2630  beta-lactamase-like  35.58 
 
 
260 aa  168  7e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.521897  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0878  beta-lactamase domain protein  37.78 
 
 
261 aa  167  2e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0280  metallo-beta-lactamase domain protein  35.74 
 
 
253 aa  167  2e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000676724  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0031  beta-lactamase domain protein  40 
 
 
262 aa  166  2.9999999999999998e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.208776  normal  0.175633 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0150  beta-lactamase domain protein  33.58 
 
 
253 aa  162  4.0000000000000004e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2442  beta-lactamase domain-containing protein  33.21 
 
 
254 aa  159  5e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123697  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0907  beta-lactamase domain-containing protein  38.24 
 
 
267 aa  157  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0676243  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0135  beta-lactamase domain protein  37.22 
 
 
252 aa  157  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0540  PhnP protein  32.44 
 
 
253 aa  153  2e-36  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.14987  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09578  hydrolase, metal-dependent  32.33 
 
 
253 aa  153  2.9999999999999998e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.513248  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1284  beta-lactamase domain protein  33.21 
 
 
254 aa  152  5e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105861  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3063  beta-lactamase domain protein  30.97 
 
 
254 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00796605 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0985  metallo-beta-lactamase family protein  36.16 
 
 
263 aa  145  8.000000000000001e-34  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2787  metal-dependent hydrolase  29.85 
 
 
254 aa  143  3e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.145562 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3277  beta-lactamase domain protein  32.71 
 
 
253 aa  143  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2010  beta-lactamase domain protein  36.23 
 
 
257 aa  143  4e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2496  beta-lactamase domain protein  29.81 
 
 
252 aa  142  7e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00269298  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0013  beta-lactamase domain protein  31.32 
 
 
253 aa  137  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.173708 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0143  Beta-lactamase-like  32.84 
 
 
264 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  31.97 
 
 
492 aa  118  9.999999999999999e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0580  metallo-beta-lactamase family protein  28.41 
 
 
264 aa  115  7.999999999999999e-25  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2057  beta-lactamase domain-containing protein  30.48 
 
 
259 aa  113  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1496  putative hydrolase protein  44.76 
 
 
100 aa  93.6  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.51917  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1586  beta-lactamase-like protein  36.33 
 
 
267 aa  92.8  6e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0189  beta-lactamase domain-containing protein  28.63 
 
 
245 aa  82  0.000000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0908747  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0528  ATP-binding protein PhnP  28.05 
 
 
246 aa  80.1  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2337  beta-lactamase-like  28.87 
 
 
240 aa  78.2  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462445  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0659  hydrolase, metal-dependent, putative  25.83 
 
 
266 aa  74.3  0.000000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1954  beta-lactamase-like protein  25.09 
 
 
248 aa  72.4  0.000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2088  beta-lactamase domain-containing protein  27.38 
 
 
242 aa  72  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1876  beta-lactamase domain protein  27.54 
 
 
261 aa  71.2  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1016  hypothetical protein  27.27 
 
 
239 aa  69.3  0.00000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4045  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  28.62 
 
 
261 aa  66.6  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0225  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  28.62 
 
 
261 aa  66.6  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2297  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  27.87 
 
 
251 aa  66.2  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47617  predicted protein  26.07 
 
 
372 aa  65.9  0.0000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.261739  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4141  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  28.22 
 
 
251 aa  65.5  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0485  beta-lactamase domain-containing protein  30.9 
 
 
240 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.300873  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1487  putative hydrolase protein  37.62 
 
 
150 aa  64.3  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010251  normal  0.184019 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2524  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  29.25 
 
 
258 aa  64.3  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.632538 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1757  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  30.45 
 
 
256 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0735161  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2582  beta-lactamase domain protein  27.83 
 
 
239 aa  63.5  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01800  conserved hypothetical protein  33.05 
 
 
480 aa  62.8  0.000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00595341  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20450  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  30.66 
 
 
256 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.214049  normal  0.511622 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0921  beta-lactamase domain protein  25.17 
 
 
270 aa  61.6  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0432  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  28.98 
 
 
260 aa  60.5  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0467  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  28.98 
 
 
260 aa  60.5  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.169568  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>