131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4389 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4389  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 269 aa  552  1e-156  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1516  beta-lactamase domain-containing protein  62.36 
 
 		 267 aa  318  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4701  beta-lactamase domain protein  61.92 
 
 		 268 aa  317  9e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0311936 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0539  beta-lactamase domain protein  61.45 
 
 		 265 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1532  metal-dependent hydrolase  57.92 
 
 		 265 aa  311  5.999999999999999e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.494677 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6919  beta-lactamase domain protein  57.58 
 
 		 269 aa  300  2e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4556  beta-lactamase-like protein  58.71 
 
 		 272 aa  298  5e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.305264 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4185  beta-lactamase-like protein  59.09 
 
 		 272 aa  298  7e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4098  hypothetical protein  52.67 
 
 		 265 aa  295  7e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230981 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6466  beta-lactamase-like protein  57.25 
 
 		 269 aa  287  1e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2683  putative hydrolase  52.67 
 
 		 266 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0797349  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1274  beta-lactamase-like  53.82 
 
 		 265 aa  283  2.0000000000000002e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.31947  normal  0.453666 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2006  hypothetical protein  49.62 
 
 		 267 aa  281  7.000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0556824  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1460  hypothetical protein  49.43 
 
 		 267 aa  278  7e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.349178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3594  beta-lactamase-like  53.44 
 
 		 265 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.545282 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2719  putative hydrolase  50 
 
 		 266 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0507266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3115  beta-lactamase-like protein  51.14 
 
 		 272 aa  267  1e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.402166  normal  0.647891 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0554  beta-lactamase domain-containing protein  51.72 
 
 		 265 aa  266  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0676  PhnP-like protein  51.72 
 
 		 265 aa  263  2e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.136229  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2330  PhnP-like protein  51.72 
 
 		 265 aa  263  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.500719 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2707  putative hydrolase  49.43 
 
 		 270 aa  261  8e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3118  hypothetical protein  48.29 
 
 		 267 aa  258  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134685  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2081  beta-lactamase domain-containing protein  48.85 
 
 		 272 aa  256  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1800  beta-lactamase domain protein  49.62 
 
 		 274 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0131454  normal  0.0301094 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1585  beta-lactamase-like  47.92 
 
 		 272 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2160  metal dependent hydrolase  49.04 
 
 		 272 aa  252  4.0000000000000004e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0818  metallo-beta-lactamase family protein  48.46 
 
 		 271 aa  252  5.000000000000001e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.274657  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1988  beta-lactamase domain protein  48.85 
 
 		 274 aa  250  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.885217  normal  0.0198893 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0919  beta-lactamase domain protein  52.33 
 
 		 268 aa  250  2e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0997  hypothetical protein  48.09 
 
 		 272 aa  249  4e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0964  hypothetical protein  48.09 
 
 		 272 aa  249  4e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.347273  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2696  hypothetical protein  50.57 
 
 		 268 aa  249  4e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0186749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1288  beta-lactamase domain-containing protein  47.13 
 
 		 284 aa  241  7e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.263316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1451  beta-lactamase-like protein  45.15 
 
 		 284 aa  236  2e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.935768  hitchhiker  0.000511853 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2147  beta-lactamase domain-containing protein  48.08 
 
 		 266 aa  224  1e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1699  Beta-lactamase-like  40.81 
 
 		 267 aa  198  9e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133966  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0488  beta-lactamase domain-containing protein  41.54 
 
 		 254 aa  193  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.932747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1261  beta-lactamase-like protein  41.25 
 
 		 254 aa  181  1e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.181589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3413  beta-lactamase domain-containing protein  42.23 
 
 		 255 aa  181  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615146  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0205  beta-lactamase domain protein  37.97 
 
 		 270 aa  178  9e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0553  beta-lactamase domain-containing protein  41.41 
 
 		 251 aa  178  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1937  beta-lactamase-like  39.53 
 
 		 255 aa  173  2.9999999999999996e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3330  beta-lactamase domain protein  40.62 
 
 		 253 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0993  metallo-beta-lactamase family protein  40 
 
 		 252 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.364222  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1107  beta-lactamase domain protein  40 
 
 		 252 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2465  metallo-beta-lactamase family protein  43.25 
 
 		 251 aa  170  3e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2630  beta-lactamase-like  39.53 
 
 		 260 aa  168  9e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.521897  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0135  beta-lactamase domain protein  39.45 
 
 		 252 aa  168  9e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2290  beta-lactamase domain protein  39.84 
 
 		 255 aa  167  2e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.466086  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0199  phosphonate metabolism  36.86 
 
 		 286 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0038087  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0765  Beta-lactamase-like  38.58 
 
 		 264 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0314  beta-lactamase domain protein  40 
 
 		 251 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0907  beta-lactamase domain-containing protein  38.38 
 
 		 267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0676243  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0878  beta-lactamase domain protein  36.68 
 
 		 261 aa  163  2.0000000000000002e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0332  beta-lactamase domain protein  39.22 
 
 		 251 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0031  beta-lactamase domain protein  36.33 
 
 		 262 aa  164  2.0000000000000002e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.208776  normal  0.175633 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11000  beta-lactamase domain protein  35.69 
 
 		 252 aa  160  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00714887  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09578  hydrolase, metal-dependent  35.69 
 
 		 253 aa  157  1e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.513248  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0316  beta-lactamase domain-containing protein  35.18 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2496  beta-lactamase domain protein  32.94 
 
 		 252 aa  152  5e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00269298  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0280  metallo-beta-lactamase domain protein  33.46 
 
 		 253 aa  144  2e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000676724  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0985  metallo-beta-lactamase family protein  36.84 
 
 		 263 aa  143  3e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0540  PhnP protein  34.78 
 
 		 253 aa  142  6e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.14987  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3063  beta-lactamase domain protein  31.91 
 
 		 254 aa  141  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00796605 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0150  beta-lactamase domain protein  32.55 
 
 		 253 aa  141  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2442  beta-lactamase domain-containing protein  31.75 
 
 		 254 aa  139  3.9999999999999997e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123697  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1284  beta-lactamase domain protein  33.46 
 
 		 254 aa  139  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2010  beta-lactamase domain protein  35.16 
 
 		 257 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2787  metal-dependent hydrolase  29.3 
 
 		 254 aa  132  6e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.145562 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0143  Beta-lactamase-like  34.83 
 
 		 264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3277  beta-lactamase domain protein  31.5 
 
 		 253 aa  129  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0013  beta-lactamase domain protein  33.59 
 
 		 253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.173708 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0580  metallo-beta-lactamase family protein  29.56 
 
 		 264 aa  119  6e-26  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  30.74 
 
 		 492 aa  110  2.0000000000000002e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2057  beta-lactamase domain-containing protein  32.33 
 
 		 259 aa  110  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1496  putative hydrolase protein  50.5 
 
 		 100 aa  103  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.51917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0189  beta-lactamase domain-containing protein  31.49 
 
 		 245 aa  80.9  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0908747  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1954  beta-lactamase-like protein  27.47 
 
 		 248 aa  78.6  0.00000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0528  ATP-binding protein PhnP  28.46 
 
 		 246 aa  77.4  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1487  putative hydrolase protein  33.57 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010251  normal  0.184019 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1876  beta-lactamase domain protein  29 
 
 		 261 aa  70.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3568  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  29.3 
 
 		 250 aa  67  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4023  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  29.3 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0659  hydrolase, metal-dependent, putative  27.16 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0432  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  28.41 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0467  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  28.41 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.169568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3702  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  28.57 
 
 		 250 aa  64.3  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0485  beta-lactamase domain-containing protein  40.66 
 
 		 240 aa  63.5  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.300873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1757  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  28.95 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0735161  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0921  beta-lactamase domain protein  26.5 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2088  beta-lactamase domain-containing protein  38.46 
 
 		 242 aa  62  0.000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0512  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  28 
 
 		 260 aa  62  0.000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47617  predicted protein  24.49 
 
 		 372 aa  62  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.261739  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2582  beta-lactamase domain protein  32.23 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1586  beta-lactamase-like protein  31.32 
 
 		 267 aa  60.5  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01800  conserved hypothetical protein  33.05 
 
 		 480 aa  60.1  0.00000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00595341  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20450  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  29.63 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.214049  normal  0.511622 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1016  hypothetical protein  33.33 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4141  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  27.55 
 
 		 251 aa  57  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2297  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  26.72 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>