248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1876 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1876  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
261 aa  544  1e-154  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0921  beta-lactamase domain protein  54.65 
 
 
270 aa  308  5.9999999999999995e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0878  beta-lactamase domain protein  32.34 
 
 
261 aa  124  2e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0135  beta-lactamase domain protein  30.11 
 
 
252 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11000  beta-lactamase domain protein  30.48 
 
 
252 aa  118  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00714887  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0205  beta-lactamase domain protein  30.4 
 
 
270 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0765  Beta-lactamase-like  31.39 
 
 
264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0528  ATP-binding protein PhnP  32.48 
 
 
246 aa  113  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0199  phosphonate metabolism  28.73 
 
 
286 aa  112  8.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0038087  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0553  beta-lactamase domain-containing protein  30.37 
 
 
251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0540  PhnP protein  29.78 
 
 
253 aa  109  4.0000000000000004e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.14987  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3330  beta-lactamase domain protein  28.9 
 
 
253 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0189  beta-lactamase domain-containing protein  32.63 
 
 
245 aa  107  1e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0908747  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3413  beta-lactamase domain-containing protein  30.71 
 
 
255 aa  106  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615146  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0332  beta-lactamase domain protein  32.09 
 
 
251 aa  105  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2337  beta-lactamase-like  29.44 
 
 
240 aa  105  7e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462445  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1954  beta-lactamase-like protein  28.63 
 
 
248 aa  103  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0316  beta-lactamase domain-containing protein  29.63 
 
 
255 aa  102  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2057  beta-lactamase domain-containing protein  28.06 
 
 
259 aa  102  7e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5605  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  30.8 
 
 
252 aa  102  7e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20450  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  32.21 
 
 
256 aa  102  8e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.214049  normal  0.511622 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0314  beta-lactamase domain protein  29.67 
 
 
251 aa  101  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2630  beta-lactamase-like  27.76 
 
 
260 aa  100  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.521897  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2465  metallo-beta-lactamase family protein  29.1 
 
 
251 aa  99.4  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2290  beta-lactamase domain protein  30.51 
 
 
255 aa  99  6e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.466086  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1107  beta-lactamase domain protein  29.14 
 
 
252 aa  98.2  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0993  metallo-beta-lactamase family protein  29.14 
 
 
252 aa  98.2  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.364222  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3702  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  31 
 
 
250 aa  97.1  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1757  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  31.46 
 
 
256 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0735161  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3568  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  30.97 
 
 
250 aa  97.4  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4023  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  31.37 
 
 
250 aa  97.8  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1016  hypothetical protein  30.87 
 
 
239 aa  96.7  4e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0296  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  28.84 
 
 
252 aa  96.3  5e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.236011 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3934  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  28.57 
 
 
252 aa  95.5  8e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2496  beta-lactamase domain protein  24.81 
 
 
252 aa  94.7  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00269298  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2582  beta-lactamase domain protein  30.57 
 
 
239 aa  94.7  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.401562 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03964  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  28.17 
 
 
252 aa  94  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3899  phosphonate metabolism protein PhnP  28.17 
 
 
252 aa  94  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03924  hypothetical protein  28.17 
 
 
252 aa  94  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3063  beta-lactamase domain protein  27.47 
 
 
254 aa  94.4  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00796605 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2297  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  27.24 
 
 
251 aa  94  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0432  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  29.66 
 
 
260 aa  94.4  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0467  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  29.66 
 
 
260 aa  94.4  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.169568  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0150  beta-lactamase domain protein  24.91 
 
 
253 aa  92.4  6e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2567  phosphonate metabolism protein, PhnP  29.62 
 
 
249 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0979832  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0512  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  28.57 
 
 
260 aa  91.3  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0580  metallo-beta-lactamase family protein  27.11 
 
 
264 aa  90.1  3e-17  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4558  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  29.6 
 
 
252 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4333  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  28.06 
 
 
252 aa  89  7e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0487  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  29.74 
 
 
265 aa  89  7e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4646  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  27.67 
 
 
252 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2088  beta-lactamase domain-containing protein  33.76 
 
 
242 aa  87.8  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0659  hydrolase, metal-dependent, putative  28.83 
 
 
266 aa  87  3e-16  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0583  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  29.85 
 
 
257 aa  87  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4141  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  26.12 
 
 
251 aa  86.7  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2288  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  28.46 
 
 
255 aa  85.9  5e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.52798  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2160  metal dependent hydrolase  25.55 
 
 
272 aa  85.5  7e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2878  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  27.99 
 
 
254 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2686  phosphonate metabolism protein PhnP  31.54 
 
 
249 aa  85.5  8e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188088  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2090  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  28.69 
 
 
255 aa  85.1  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1516  beta-lactamase domain-containing protein  32.35 
 
 
267 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2524  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  28.98 
 
 
258 aa  84  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.632538 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1173  beta-lactamase domain protein  27.47 
 
 
246 aa  84  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.15164  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2787  metal-dependent hydrolase  23.97 
 
 
254 aa  83.2  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.145562 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0485  beta-lactamase domain-containing protein  28.07 
 
 
240 aa  82.8  0.000000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.300873  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0013  beta-lactamase domain protein  24.81 
 
 
253 aa  82  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.173708 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2010  beta-lactamase domain protein  28.1 
 
 
257 aa  81.3  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1800  beta-lactamase domain protein  28.21 
 
 
274 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0131454  normal  0.0301094 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1274  beta-lactamase-like  28.83 
 
 
265 aa  80.5  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.31947  normal  0.453666 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1586  beta-lactamase-like protein  31.73 
 
 
267 aa  80.5  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3684  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  28.15 
 
 
255 aa  80.9  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3277  beta-lactamase domain protein  24.44 
 
 
253 aa  80.1  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1585  beta-lactamase-like  27.24 
 
 
272 aa  80.1  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  30.04 
 
 
492 aa  80.1  0.00000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1988  beta-lactamase domain protein  27.84 
 
 
274 aa  79  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.885217  normal  0.0198893 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6919  beta-lactamase domain protein  27.6 
 
 
269 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0143  Beta-lactamase-like  23.02 
 
 
264 aa  77.8  0.0000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4098  hypothetical protein  27.21 
 
 
265 aa  77.4  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0230981 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09578  hydrolase, metal-dependent  23.7 
 
 
253 aa  77.8  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.513248  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1532  metal-dependent hydrolase  27.82 
 
 
265 aa  77  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.494677 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1451  beta-lactamase-like protein  27.43 
 
 
284 aa  76.6  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.935768  hitchhiker  0.000511853 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1316  phosphonate metabolism protein PhnP  28.57 
 
 
249 aa  76.6  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121557  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0985  metallo-beta-lactamase family protein  22.91 
 
 
263 aa  76.3  0.0000000000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0280  metallo-beta-lactamase domain protein  24.06 
 
 
253 aa  75.9  0.0000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000676724  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3434  beta-lactamase domain protein  26.89 
 
 
274 aa  74.7  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4701  beta-lactamase domain protein  28.17 
 
 
268 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0311936 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3594  beta-lactamase-like  29.6 
 
 
265 aa  74.3  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.545282 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2006  hypothetical protein  27.21 
 
 
267 aa  73.6  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0556824  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4045  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  27.5 
 
 
261 aa  73.2  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0225  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  27.5 
 
 
261 aa  73.2  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1496  putative hydrolase protein  35.71 
 
 
100 aa  72  0.000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.51917  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1460  hypothetical protein  26.41 
 
 
267 aa  72  0.000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.349178  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2707  putative hydrolase  28.17 
 
 
270 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2259  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  31 
 
 
250 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.373165  normal  0.710906 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1288  beta-lactamase domain-containing protein  26.41 
 
 
284 aa  71.2  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.263316  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2683  putative hydrolase  27.97 
 
 
266 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0797349  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2719  putative hydrolase  29.08 
 
 
266 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0507266  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1937  beta-lactamase-like  26.3 
 
 
255 aa  69.7  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4556  beta-lactamase-like protein  27.61 
 
 
272 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.305264 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0907  beta-lactamase domain-containing protein  25.54 
 
 
267 aa  68.9  0.00000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0676243  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>