126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3118 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3118  hypothetical protein  100 
 
 		 267 aa  548  1e-155  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134685  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2719  putative hydrolase  86.14 
 
 		 266 aa  477  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0507266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2683  putative hydrolase  83.52 
 
 		 266 aa  457  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0797349  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2707  putative hydrolase  75.85 
 
 		 270 aa  418  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2006  hypothetical protein  74.34 
 
 		 267 aa  412  1e-114  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0556824  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1460  hypothetical protein  71.7 
 
 		 267 aa  397  9.999999999999999e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.349178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4098  hypothetical protein  72.08 
 
 		 265 aa  399  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230981 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1532  metal-dependent hydrolase  52.08 
 
 		 265 aa  290  1e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.494677 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6919  beta-lactamase domain protein  54.14 
 
 		 269 aa  289  4e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3594  beta-lactamase-like  56.92 
 
 		 265 aa  286  2e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.545282 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1274  beta-lactamase-like  53.26 
 
 		 265 aa  279  3e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.31947  normal  0.453666 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0539  beta-lactamase domain protein  52.47 
 
 		 265 aa  278  5e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1585  beta-lactamase-like  50.57 
 
 		 272 aa  278  9e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4701  beta-lactamase domain protein  53.85 
 
 		 268 aa  275  4e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0311936 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0554  beta-lactamase domain-containing protein  52.45 
 
 		 265 aa  275  6e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1516  beta-lactamase domain-containing protein  54.14 
 
 		 267 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0676  PhnP-like protein  52.83 
 
 		 265 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.136229  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2330  PhnP-like protein  52.83 
 
 		 265 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.500719 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3115  beta-lactamase-like protein  50 
 
 		 272 aa  271  8.000000000000001e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.402166  normal  0.647891 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4185  beta-lactamase-like protein  53.79 
 
 		 272 aa  269  4e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1288  beta-lactamase domain-containing protein  50.76 
 
 		 284 aa  266  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.263316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6466  beta-lactamase-like protein  53.18 
 
 		 269 aa  264  8.999999999999999e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4556  beta-lactamase-like protein  53.03 
 
 		 272 aa  264  1e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.305264 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2160  metal dependent hydrolase  50.19 
 
 		 272 aa  262  4e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1800  beta-lactamase domain protein  47.89 
 
 		 274 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0131454  normal  0.0301094 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0818  metallo-beta-lactamase family protein  49.43 
 
 		 271 aa  261  8.999999999999999e-69  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.274657  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1988  beta-lactamase domain protein  46.74 
 
 		 274 aa  257  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.885217  normal  0.0198893 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2081  beta-lactamase domain-containing protein  48.29 
 
 		 272 aa  255  5e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0997  hypothetical protein  48.48 
 
 		 272 aa  249  3e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0964  hypothetical protein  48.48 
 
 		 272 aa  249  3e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.347273  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4389  beta-lactamase domain-containing protein  48.29 
 
 		 269 aa  247  1e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2147  beta-lactamase domain-containing protein  50.76 
 
 		 266 aa  245  4.9999999999999997e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2696  hypothetical protein  46.64 
 
 		 268 aa  241  7.999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0186749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0919  beta-lactamase domain protein  50.57 
 
 		 268 aa  239  5e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1451  beta-lactamase-like protein  44.81 
 
 		 284 aa  238  9e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.935768  hitchhiker  0.000511853 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1699  Beta-lactamase-like  42.7 
 
 		 267 aa  199  3e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133966  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3413  beta-lactamase domain-containing protein  40.3 
 
 		 255 aa  186  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615146  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0993  metallo-beta-lactamase family protein  39.02 
 
 		 252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.364222  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1107  beta-lactamase domain protein  39.02 
 
 		 252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0765  Beta-lactamase-like  38.4 
 
 		 264 aa  178  8e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2465  metallo-beta-lactamase family protein  41.67 
 
 		 251 aa  178  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0488  beta-lactamase domain-containing protein  37.22 
 
 		 254 aa  176  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.932747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0031  beta-lactamase domain protein  36.57 
 
 		 262 aa  173  1.9999999999999998e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.208776  normal  0.175633 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0553  beta-lactamase domain-containing protein  38.78 
 
 		 251 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0907  beta-lactamase domain-containing protein  37.87 
 
 		 267 aa  170  3e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0676243  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1261  beta-lactamase-like protein  37.83 
 
 		 254 aa  167  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.181589  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2290  beta-lactamase domain protein  37.79 
 
 		 255 aa  163  2.0000000000000002e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.466086  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11000  beta-lactamase domain protein  34.85 
 
 		 252 aa  162  5.0000000000000005e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00714887  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3330  beta-lactamase domain protein  35.74 
 
 		 253 aa  161  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0878  beta-lactamase domain protein  33.96 
 
 		 261 aa  159  4e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0332  beta-lactamase domain protein  38.4 
 
 		 251 aa  159  4e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0199  phosphonate metabolism  33.71 
 
 		 286 aa  159  6e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0038087  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0316  beta-lactamase domain-containing protein  36.5 
 
 		 255 aa  158  9e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0314  beta-lactamase domain protein  38.02 
 
 		 251 aa  157  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0205  beta-lactamase domain protein  34.96 
 
 		 270 aa  150  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0150  beta-lactamase domain protein  31.7 
 
 		 253 aa  148  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0135  beta-lactamase domain protein  33.96 
 
 		 252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1937  beta-lactamase-like  34.08 
 
 		 255 aa  147  3e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0540  PhnP protein  35.36 
 
 		 253 aa  145  6e-34  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.14987  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2630  beta-lactamase-like  32.46 
 
 		 260 aa  145  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.521897  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2496  beta-lactamase domain protein  30.19 
 
 		 252 aa  143  3e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00269298  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2442  beta-lactamase domain-containing protein  32.2 
 
 		 254 aa  143  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123697  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09578  hydrolase, metal-dependent  30.68 
 
 		 253 aa  139  3e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.513248  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  35.5 
 
 		 492 aa  138  8.999999999999999e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0280  metallo-beta-lactamase domain protein  32.33 
 
 		 253 aa  135  9.999999999999999e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000676724  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3063  beta-lactamase domain protein  29.7 
 
 		 254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00796605 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1284  beta-lactamase domain protein  29.81 
 
 		 254 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2787  metal-dependent hydrolase  28.73 
 
 		 254 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.145562 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0580  metallo-beta-lactamase family protein  32.48 
 
 		 264 aa  124  1e-27  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3277  beta-lactamase domain protein  27.65 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0985  metallo-beta-lactamase family protein  31.62 
 
 		 263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2010  beta-lactamase domain protein  31.82 
 
 		 257 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0013  beta-lactamase domain protein  29.1 
 
 		 253 aa  116  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.173708 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0143  Beta-lactamase-like  29.78 
 
 		 264 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2057  beta-lactamase domain-containing protein  28.26 
 
 		 259 aa  101  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1496  putative hydrolase protein  46.15 
 
 		 100 aa  88.6  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.51917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0189  beta-lactamase domain-containing protein  31.02 
 
 		 245 aa  81.3  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0908747  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0528  ATP-binding protein PhnP  28.05 
 
 		 246 aa  70.5  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1487  putative hydrolase protein  40.2 
 
 		 150 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010251  normal  0.184019 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47617  predicted protein  22.73 
 
 		 372 aa  70.1  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.261739  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2337  beta-lactamase-like  30.83 
 
 		 240 aa  69.3  0.00000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1586  beta-lactamase-like protein  29.23 
 
 		 267 aa  68.6  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1016  hypothetical protein  29.37 
 
 		 239 aa  67.4  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1876  beta-lactamase domain protein  28.72 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0659  hydrolase, metal-dependent, putative  26.28 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01800  conserved hypothetical protein  31.51 
 
 		 480 aa  66.2  0.0000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00595341  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1954  beta-lactamase-like protein  26.28 
 
 		 248 aa  66.2  0.0000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0921  beta-lactamase domain protein  26.16 
 
 		 270 aa  65.5  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2582  beta-lactamase domain protein  27.38 
 
 		 239 aa  63.9  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0485  beta-lactamase domain-containing protein  29.65 
 
 		 240 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.300873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2524  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  29.3 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.632538 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2878  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  28.72 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2567  phosphonate metabolism protein, PhnP  28.88 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0979832  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0432  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  26.95 
 
 		 260 aa  55.5  0.0000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0467  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  26.95 
 
 		 260 aa  55.5  0.0000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.169568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2088  beta-lactamase domain-containing protein  25.94 
 
 		 242 aa  53.9  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1757  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  29.62 
 
 		 256 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0735161  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4045  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  26.41 
 
 		 261 aa  52.8  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0225  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  26.41 
 
 		 261 aa  52.8  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1316  phosphonate metabolism protein PhnP  24.11 
 
 		 249 aa  51.6  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121557  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>