110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2125 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2125  metallo-beta-lactamase superfamily protein  100 
 
 
280 aa  569  1e-161  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.539323 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2374  beta-lactamase domain-containing protein  62.5 
 
 
280 aa  356  2.9999999999999997e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.201878  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2194  beta-lactamase domain-containing protein  55.56 
 
 
279 aa  318  9e-86  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1430  beta-lactamase domain protein  54.84 
 
 
276 aa  311  1e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.394554  normal  0.142096 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1765  beta-lactamase domain protein  52.78 
 
 
285 aa  296  2e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1912  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  41.28 
 
 
268 aa  219  5e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.385619  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1747  hypothetical protein  43.01 
 
 
271 aa  219  5e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1434  beta-lactamase domain-containing protein  36.9 
 
 
276 aa  160  3e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1080  beta-lactamase domain protein  33.45 
 
 
284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000140431  normal  0.247329 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1747  beta-lactamase domain protein  35.34 
 
 
275 aa  147  3e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1589  beta-lactamase superfamily hydrolase  33.46 
 
 
278 aa  141  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1793  beta-lactamase domain protein  34.7 
 
 
274 aa  141  9.999999999999999e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000988324  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1155  beta-lactamase domain-containing protein  32.28 
 
 
282 aa  140  3e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0141595  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0249  beta-lactamase domain protein  31.94 
 
 
280 aa  138  8.999999999999999e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000647283  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3104  beta-lactamase domain protein  31.99 
 
 
265 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000364883  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0308  beta-lactamase domain-containing protein  31.83 
 
 
284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000646424  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0924  beta-lactamase-like protein  34.57 
 
 
276 aa  131  1.0000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.425794  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3081  beta-lactamase domain protein  31.99 
 
 
265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000213505  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3162  beta-lactamase domain protein  31.99 
 
 
265 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.20789  normal  0.546421 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3263  beta-lactamase domain-containing protein  31.62 
 
 
265 aa  129  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0656446  normal  0.191577 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1236  beta-lactamase domain-containing protein  35.23 
 
 
275 aa  128  1.0000000000000001e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3145  beta-lactamase domain-containing protein  31.62 
 
 
265 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.398347 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4225  beta-lactamase domain-containing protein  32.08 
 
 
276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.150926  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1937  hypothetical protein  34.48 
 
 
280 aa  126  3e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.413348  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1952  beta-lactamase domain-containing protein  33.58 
 
 
304 aa  125  5e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0561  beta-lactamase domain-containing protein  33.81 
 
 
294 aa  125  6e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.624713  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1960  beta-lactamase-like  32.08 
 
 
312 aa  123  4e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0397  metallo-beta-lactamase family protein  30.6 
 
 
276 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.257188  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1602  hypothetical protein  31.64 
 
 
260 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.737502  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0026  beta-lactamase domain-containing protein  30.51 
 
 
266 aa  121  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.21687 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3320  beta-lactamase domain-containing protein  32.96 
 
 
277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0328164  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2299  beta-lactamase domain protein  31.44 
 
 
279 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1529  beta-lactamase domain protein  33.92 
 
 
310 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.823422 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1391  beta-lactamase domain-containing protein  35.14 
 
 
295 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00324967  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1818  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily II-like protein  32.04 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1430  Beta-lactamase-like  30.94 
 
 
280 aa  116  3.9999999999999997e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000186428  normal  0.102633 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1455  hypothetical protein  29.64 
 
 
260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0495131  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0446  beta-lactamase domain-containing protein  32.41 
 
 
267 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.986653  hitchhiker  0.00213721 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2078  beta-lactamase domain-containing protein  33.46 
 
 
279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1026  beta-lactamase domain-containing protein  30.18 
 
 
260 aa  113  3e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0891988  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3123  Beta-lactamase-like  29.64 
 
 
276 aa  112  5e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1569  beta-lactamase domain-containing protein  31.58 
 
 
312 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0135813  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0312  beta-lactamase domain-containing protein  29.82 
 
 
260 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.688716  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1437  beta-lactamase domain protein  30.36 
 
 
304 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.256229  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0515  beta-lactamase domain-containing protein  29.89 
 
 
284 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0268037  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18400  beta-lactamase domain protein  27.47 
 
 
278 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.03744e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1129  beta-lactamase domain-containing protein  32.08 
 
 
272 aa  109  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000396645  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0906  hypothetical protein  32.37 
 
 
285 aa  107  2e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.230913  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1945  beta-lactamase domain-containing protein  30.82 
 
 
278 aa  107  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0880  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
322 aa  106  5e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1138  hypothetical protein  29.34 
 
 
276 aa  105  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0535  beta-lactamase domain protein  29.92 
 
 
262 aa  103  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1707  beta-lactamase domain protein  30.9 
 
 
283 aa  102  5e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.078929 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0149  hypothetical protein  31.09 
 
 
282 aa  102  6e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0975  beta-lactamase domain-containing protein  31.27 
 
 
255 aa  101  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000479718  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1154  beta-lactamase domain-containing protein  31.27 
 
 
255 aa  101  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000123031  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1375  beta-lactamase domain-containing protein  28.47 
 
 
317 aa  101  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.825748  hitchhiker  0.000507675 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3463  beta-lactamase domain protein  27.46 
 
 
276 aa  102  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00409832  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0500  beta-lactamase domain protein  29.43 
 
 
264 aa  95.5  8e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.977246  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0446  beta-lactamase domain-containing protein  30.8 
 
 
278 aa  94.4  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000263498  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2897  beta-lactamase domain-containing protein  29.43 
 
 
327 aa  92.8  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3848  beta-lactamase domain protein  33.09 
 
 
276 aa  90.1  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.5057  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3932  beta-lactamase domain protein  30.11 
 
 
276 aa  90.5  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0238376 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0072  beta-lactamase-like protein  29.43 
 
 
347 aa  90.1  4e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0782  beta-lactamase domain protein  31.28 
 
 
380 aa  87  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0662639 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1168  metallo-beta-lactamase family protein  26.12 
 
 
276 aa  86.7  4e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.148902  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0999  metallo-beta-lactamase family protein  26.12 
 
 
276 aa  85.5  9e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0149338  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2186  beta-lactamase domain-containing protein  28.18 
 
 
281 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1227  beta-lactamase domain-containing protein  29.03 
 
 
247 aa  84  0.000000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0023  metallo-beta-lactamase superfamily protein  24.57 
 
 
281 aa  79.7  0.00000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0186  beta-lactamase domain-containing protein  26.44 
 
 
403 aa  79.3  0.00000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.69512  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3934  beta-lactamase domain-containing protein  29.17 
 
 
372 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  0.104471 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4302  beta-lactamase domain protein  29.17 
 
 
372 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.852512  normal  0.0730193 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5036  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase  28.62 
 
 
409 aa  77  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.29289  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4116  beta-lactamase-like protein  28.96 
 
 
369 aa  76.3  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.712365  normal  0.318917 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7499  beta-lactamase domain protein  26.34 
 
 
356 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10608  metallo-beta-lactamase superfamily protein (AFU_orthologue; AFUA_3G07630)  32.58 
 
 
212 aa  71.6  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5934  beta-lactamase domain-containing protein  27.24 
 
 
372 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.87219 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1064  beta-lactamase domain protein  27.34 
 
 
372 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.393014  normal  0.0622516 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44454  predicted protein  24.76 
 
 
447 aa  69.3  0.00000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7304  beta-lactamase domain protein  27.71 
 
 
403 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1077  metallo-beta-lactamase superfamily protein  25.9 
 
 
220 aa  66.6  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1890  beta-lactamase domain-containing protein  29.17 
 
 
218 aa  65.5  0.0000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2076  beta-lactamase-like protein  27.13 
 
 
218 aa  63.2  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1937  beta-lactamase domain-containing protein  24.81 
 
 
212 aa  62.4  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0773  beta-lactamase domain protein  24.91 
 
 
237 aa  62  0.000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1140  beta-lactamase domain protein  26.54 
 
 
229 aa  59.3  0.00000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.636062  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1271  beta-lactamase domain-containing protein  40.23 
 
 
272 aa  57.8  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1774  beta-lactamase domain-containing protein  24.16 
 
 
221 aa  57.8  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0791  beta-lactamase domain-containing protein  23.94 
 
 
330 aa  53.5  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00778966  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1105  beta-lactamase domain-containing protein  33.73 
 
 
454 aa  47  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5891  beta-lactamase domain-containing protein  37.35 
 
 
467 aa  46.6  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273287  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1013  metallo-beta-lactamase family protein  34.94 
 
 
603 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2025  hypothetical protein  50 
 
 
78 aa  45.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.494899  normal  0.229701 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09800  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  25.56 
 
 
266 aa  43.9  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.559051 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0168  metallo-beta-lactamase family protein  34.94 
 
 
459 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1339  metallo-beta-lactamase family protein  34.94 
 
 
472 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2742  metallo-beta-lactamase family protein  34.94 
 
 
472 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.213611  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2599  metallo-beta-lactamase family protein  34.94 
 
 
472 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1708  beta-lactamase domain protein  35.14 
 
 
454 aa  43.5  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354041  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>