97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3320 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_3320  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
277 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0328164  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3463  beta-lactamase domain protein  61.01 
 
 
276 aa  339  2.9999999999999998e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00409832  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4225  beta-lactamase domain-containing protein  59.93 
 
 
276 aa  338  5.9999999999999996e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.150926  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3123  Beta-lactamase-like  57.76 
 
 
276 aa  321  7e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0397  metallo-beta-lactamase family protein  56.32 
 
 
276 aa  317  2e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.257188  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3932  beta-lactamase domain protein  56.32 
 
 
276 aa  271  6e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0238376 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3848  beta-lactamase domain protein  55.96 
 
 
276 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.5057  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2078  beta-lactamase domain-containing protein  48.23 
 
 
279 aa  232  6e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1945  beta-lactamase domain-containing protein  46.59 
 
 
278 aa  227  2e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1434  beta-lactamase domain-containing protein  39.49 
 
 
276 aa  207  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1793  beta-lactamase domain protein  44.04 
 
 
274 aa  204  2e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000988324  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1430  Beta-lactamase-like  43.82 
 
 
280 aa  199  3.9999999999999996e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000186428  normal  0.102633 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1155  beta-lactamase domain-containing protein  42.39 
 
 
282 aa  196  4.0000000000000005e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0141595  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0924  beta-lactamase-like protein  39.21 
 
 
276 aa  192  5e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.425794  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1747  beta-lactamase domain protein  39.05 
 
 
275 aa  188  9e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1937  hypothetical protein  40 
 
 
280 aa  169  4e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.413348  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0308  beta-lactamase domain-containing protein  37.63 
 
 
284 aa  161  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000646424  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1952  beta-lactamase domain-containing protein  35.51 
 
 
304 aa  159  4e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0249  beta-lactamase domain protein  38.16 
 
 
280 aa  158  8e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000647283  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2299  beta-lactamase domain protein  38.18 
 
 
279 aa  158  1e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1080  beta-lactamase domain protein  36.14 
 
 
284 aa  154  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000140431  normal  0.247329 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0561  beta-lactamase domain-containing protein  37.69 
 
 
294 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.624713  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1589  beta-lactamase superfamily hydrolase  35.71 
 
 
278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0906  hypothetical protein  31.1 
 
 
285 aa  142  4e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.230913  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18400  beta-lactamase domain protein  34.67 
 
 
278 aa  142  5e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.03744e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1375  beta-lactamase domain-containing protein  37.96 
 
 
317 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.825748  hitchhiker  0.000507675 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1236  beta-lactamase domain-containing protein  35.79 
 
 
275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1437  beta-lactamase domain protein  38.14 
 
 
304 aa  140  3e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.256229  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1960  beta-lactamase-like  35.82 
 
 
312 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1707  beta-lactamase domain protein  32.26 
 
 
283 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.078929 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1391  beta-lactamase domain-containing protein  32.13 
 
 
295 aa  133  3e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00324967  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1430  beta-lactamase domain protein  35.29 
 
 
276 aa  128  8.000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.394554  normal  0.142096 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0535  beta-lactamase domain protein  28.92 
 
 
262 aa  125  7e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1818  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily II-like protein  34.3 
 
 
260 aa  124  1e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1912  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  31.54 
 
 
268 aa  122  7e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.385619  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1569  beta-lactamase domain-containing protein  35.46 
 
 
312 aa  121  9.999999999999999e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0135813  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2125  metallo-beta-lactamase superfamily protein  32.96 
 
 
280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.539323 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2897  beta-lactamase domain-containing protein  35.53 
 
 
327 aa  120  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1529  beta-lactamase domain protein  34.96 
 
 
310 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.823422 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0880  beta-lactamase domain-containing protein  35.85 
 
 
322 aa  118  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1747  hypothetical protein  30.74 
 
 
271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3104  beta-lactamase domain protein  32.43 
 
 
265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000364883  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3263  beta-lactamase domain-containing protein  32.21 
 
 
265 aa  113  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0656446  normal  0.191577 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3162  beta-lactamase domain protein  32.21 
 
 
265 aa  113  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.20789  normal  0.546421 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0446  beta-lactamase domain-containing protein  31.56 
 
 
267 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.986653  hitchhiker  0.00213721 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3081  beta-lactamase domain protein  32.21 
 
 
265 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000213505  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1138  hypothetical protein  27.76 
 
 
276 aa  112  6e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3145  beta-lactamase domain-containing protein  32.21 
 
 
265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.398347 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2374  beta-lactamase domain-containing protein  30.48 
 
 
280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.201878  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1129  beta-lactamase domain-containing protein  28.8 
 
 
272 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000396645  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1602  hypothetical protein  27.76 
 
 
260 aa  109  5e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.737502  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0975  beta-lactamase domain-containing protein  29.71 
 
 
255 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000479718  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1154  beta-lactamase domain-containing protein  29.71 
 
 
255 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000123031  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0312  beta-lactamase domain-containing protein  26.69 
 
 
260 aa  102  6e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.688716  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1026  beta-lactamase domain-containing protein  26.52 
 
 
260 aa  102  7e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0891988  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1765  beta-lactamase domain protein  31.25 
 
 
285 aa  101  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0026  beta-lactamase domain-containing protein  29.57 
 
 
266 aa  100  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.21687 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2194  beta-lactamase domain-containing protein  31.12 
 
 
279 aa  100  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0500  beta-lactamase domain protein  27.31 
 
 
264 aa  99.4  5e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.977246  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0515  beta-lactamase domain-containing protein  24.58 
 
 
284 aa  97.1  3e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0268037  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0446  beta-lactamase domain-containing protein  31.36 
 
 
278 aa  93.6  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000263498  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1077  metallo-beta-lactamase superfamily protein  29.75 
 
 
220 aa  89.7  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10608  metallo-beta-lactamase superfamily protein (AFU_orthologue; AFUA_3G07630)  34.72 
 
 
212 aa  89.4  7e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1455  hypothetical protein  24.03 
 
 
260 aa  87.4  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0495131  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2186  beta-lactamase domain-containing protein  25.61 
 
 
281 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0149  hypothetical protein  25.62 
 
 
282 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1271  beta-lactamase domain-containing protein  28.69 
 
 
272 aa  79.3  0.00000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0023  metallo-beta-lactamase superfamily protein  24.15 
 
 
281 aa  79  0.00000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1168  metallo-beta-lactamase family protein  26.6 
 
 
276 aa  79  0.00000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.148902  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0999  metallo-beta-lactamase family protein  26.5 
 
 
276 aa  78.2  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0149338  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1890  beta-lactamase domain-containing protein  26.67 
 
 
218 aa  76.6  0.0000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44454  predicted protein  28.27 
 
 
447 aa  73.2  0.000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1227  beta-lactamase domain-containing protein  26.24 
 
 
247 aa  73.2  0.000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0773  beta-lactamase domain protein  24.51 
 
 
237 aa  70.9  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3934  beta-lactamase domain-containing protein  26.85 
 
 
372 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  0.104471 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4302  beta-lactamase domain protein  26.85 
 
 
372 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.852512  normal  0.0730193 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1064  beta-lactamase domain protein  26.55 
 
 
372 aa  69.3  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.393014  normal  0.0622516 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5036  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase  29.48 
 
 
409 aa  68.9  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.29289  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7304  beta-lactamase domain protein  28.05 
 
 
403 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0072  beta-lactamase-like protein  26.04 
 
 
347 aa  65.1  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0186  beta-lactamase domain-containing protein  28 
 
 
403 aa  63.5  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.69512  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7499  beta-lactamase domain protein  26.94 
 
 
356 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4116  beta-lactamase-like protein  27.06 
 
 
369 aa  61.6  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.712365  normal  0.318917 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1140  beta-lactamase domain protein  23.84 
 
 
229 aa  62  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.636062  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5934  beta-lactamase domain-containing protein  25.73 
 
 
372 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.87219 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1937  beta-lactamase domain-containing protein  28.87 
 
 
212 aa  59.7  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0782  beta-lactamase domain protein  25.37 
 
 
380 aa  59.7  0.00000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0662639 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2076  beta-lactamase-like protein  26.91 
 
 
218 aa  54.3  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1774  beta-lactamase domain-containing protein  26.07 
 
 
221 aa  53.9  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0918  metallo-beta-lactamase family protein  24.36 
 
 
384 aa  52.4  0.000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0509  metallo-beta-lactamase family protein  24 
 
 
385 aa  52.4  0.000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.16796 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1722  metallo-beta-lactamase family protein  24.61 
 
 
382 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2136  metallo-beta-lactamase family protein  24.41 
 
 
386 aa  50.1  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0791  beta-lactamase domain-containing protein  26.14 
 
 
330 aa  48.9  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00778966  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3609  metallo-beta-lactamase family protein  23.05 
 
 
391 aa  48.5  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0862663 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1616  metallo-beta-lactamase family protein  24 
 
 
385 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00374588  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1423  beta-lactamase domain-containing protein  26.52 
 
 
279 aa  42  0.01  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.408877  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>