105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4225 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_4225  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 276 aa  567  1e-161  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.150926  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3123  Beta-lactamase-like  72.83 
 
 		 276 aa  424  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0397  metallo-beta-lactamase family protein  67.03 
 
 		 276 aa  389  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.257188  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3463  beta-lactamase domain protein  59.42 
 
 		 276 aa  350  1e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00409832  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3320  beta-lactamase domain-containing protein  59.93 
 
 		 277 aa  338  5.9999999999999996e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0328164  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3932  beta-lactamase domain protein  65.22 
 
 		 276 aa  337  9.999999999999999e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0238376 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3848  beta-lactamase domain protein  65.58 
 
 		 276 aa  325  7e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.5057  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2078  beta-lactamase domain-containing protein  47.86 
 
 		 279 aa  259  4e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1945  beta-lactamase domain-containing protein  42.81 
 
 		 278 aa  223  3e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1793  beta-lactamase domain protein  45.32 
 
 		 274 aa  215  5e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000988324  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1434  beta-lactamase domain-containing protein  42.64 
 
 		 276 aa  215  5.9999999999999996e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0924  beta-lactamase-like protein  39.64 
 
 		 276 aa  208  6e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.425794  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1155  beta-lactamase domain-containing protein  42.18 
 
 		 282 aa  197  1.0000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0141595  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1747  beta-lactamase domain protein  39.19 
 
 		 275 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0249  beta-lactamase domain protein  40 
 
 		 280 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000647283  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1952  beta-lactamase domain-containing protein  35.64 
 
 		 304 aa  180  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1430  Beta-lactamase-like  42.13 
 
 		 280 aa  179  4e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000186428  normal  0.102633 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0308  beta-lactamase domain-containing protein  38.18 
 
 		 284 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000646424  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1080  beta-lactamase domain protein  37.23 
 
 		 284 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000140431  normal  0.247329 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1937  hypothetical protein  36.96 
 
 		 280 aa  162  7e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.413348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2299  beta-lactamase domain protein  36.43 
 
 		 279 aa  160  3e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1236  beta-lactamase domain-containing protein  40.94 
 
 		 275 aa  156  4e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18400  beta-lactamase domain protein  33.93 
 
 		 278 aa  155  8e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.03744e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1707  beta-lactamase domain protein  35.64 
 
 		 283 aa  154  1e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.078929 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1589  beta-lactamase superfamily hydrolase  36.15 
 
 		 278 aa  152  5e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1375  beta-lactamase domain-containing protein  38.43 
 
 		 317 aa  149  7e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.825748  hitchhiker  0.000507675 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0906  hypothetical protein  34.51 
 
 		 285 aa  141  9.999999999999999e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.230913  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0561  beta-lactamase domain-containing protein  35.34 
 
 		 294 aa  138  8.999999999999999e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.624713  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1391  beta-lactamase domain-containing protein  36.1 
 
 		 295 aa  138  1e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00324967  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1529  beta-lactamase domain protein  36.26 
 
 		 310 aa  135  5e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.823422 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2897  beta-lactamase domain-containing protein  35.66 
 
 		 327 aa  134  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0880  beta-lactamase domain-containing protein  36.05 
 
 		 322 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1437  beta-lactamase domain protein  34.47 
 
 		 304 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.256229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1430  beta-lactamase domain protein  34.43 
 
 		 276 aa  132  5e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.394554  normal  0.142096 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1912  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  31.15 
 
 		 268 aa  132  6e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.385619  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0535  beta-lactamase domain protein  30.52 
 
 		 262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1747  hypothetical protein  32.13 
 
 		 271 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0446  beta-lactamase domain-containing protein  34.34 
 
 		 267 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.986653  hitchhiker  0.00213721 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1960  beta-lactamase-like  33.33 
 
 		 312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3104  beta-lactamase domain protein  32.95 
 
 		 265 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000364883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2125  metallo-beta-lactamase superfamily protein  32.08 
 
 		 280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.539323 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0975  beta-lactamase domain-containing protein  34.55 
 
 		 255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000479718  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1154  beta-lactamase domain-containing protein  34.55 
 
 		 255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000123031  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1129  beta-lactamase domain-containing protein  30.4 
 
 		 272 aa  126  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000396645  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3162  beta-lactamase domain protein  34.11 
 
 		 265 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.20789  normal  0.546421 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3081  beta-lactamase domain protein  34.11 
 
 		 265 aa  126  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000213505  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3145  beta-lactamase domain-containing protein  34.11 
 
 		 265 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.398347 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3263  beta-lactamase domain-containing protein  33.72 
 
 		 265 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0656446  normal  0.191577 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1818  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily II-like protein  34.89 
 
 		 260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1602  hypothetical protein  28.68 
 
 		 260 aa  120  3e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.737502  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1138  hypothetical protein  29.44 
 
 		 276 aa  120  3e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1569  beta-lactamase domain-containing protein  32.18 
 
 		 312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0135813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0026  beta-lactamase domain-containing protein  31.4 
 
 		 266 aa  114  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.21687 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1765  beta-lactamase domain protein  29.56 
 
 		 285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0500  beta-lactamase domain protein  30.38 
 
 		 264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.977246  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1455  hypothetical protein  29.62 
 
 		 260 aa  110  3e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0495131  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0312  beta-lactamase domain-containing protein  26.64 
 
 		 260 aa  109  6e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.688716  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2374  beta-lactamase domain-containing protein  31.23 
 
 		 280 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.201878  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1026  beta-lactamase domain-containing protein  27.03 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0891988  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2194  beta-lactamase domain-containing protein  32.46 
 
 		 279 aa  104  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0446  beta-lactamase domain-containing protein  30.14 
 
 		 278 aa  104  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000263498  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2186  beta-lactamase domain-containing protein  28.51 
 
 		 281 aa  103  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0515  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 284 aa  102  9e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0268037  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1271  beta-lactamase domain-containing protein  30.66 
 
 		 272 aa  98.2  1e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1077  metallo-beta-lactamase superfamily protein  30.18 
 
 		 220 aa  97.1  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0023  metallo-beta-lactamase superfamily protein  26.97 
 
 		 281 aa  95.9  7e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0149  hypothetical protein  28.04 
 
 		 282 aa  94.7  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1168  metallo-beta-lactamase family protein  29.68 
 
 		 276 aa  93.6  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.148902  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0999  metallo-beta-lactamase family protein  29.43 
 
 		 276 aa  91.3  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0149338  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0773  beta-lactamase domain protein  27.9 
 
 		 237 aa  87.8  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1227  beta-lactamase domain-containing protein  27.52 
 
 		 247 aa  85.9  7e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1890  beta-lactamase domain-containing protein  27.08 
 
 		 218 aa  85.5  8e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10608  metallo-beta-lactamase superfamily protein (AFU_orthologue; AFUA_3G07630)  34.94 
 
 		 212 aa  82  0.000000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3934  beta-lactamase domain-containing protein  26.97 
 
 		 372 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  0.104471 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4302  beta-lactamase domain protein  26.97 
 
 		 372 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.852512  normal  0.0730193 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7499  beta-lactamase domain protein  27.99 
 
 		 356 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1140  beta-lactamase domain protein  25.63 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.636062  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44454  predicted protein  28.31 
 
 		 447 aa  74.7  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5036  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase  26.35 
 
 		 409 aa  73.6  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.29289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1064  beta-lactamase domain protein  25.93 
 
 		 372 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.393014  normal  0.0622516 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5934  beta-lactamase domain-containing protein  26.88 
 
 		 372 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.87219 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1937  beta-lactamase domain-containing protein  27.54 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2076  beta-lactamase-like protein  24.73 
 
 		 218 aa  68.2  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0782  beta-lactamase domain protein  26.27 
 
 		 380 aa  68.6  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0662639 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0072  beta-lactamase-like protein  27.34 
 
 		 347 aa  67.8  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7304  beta-lactamase domain protein  27.86 
 
 		 403 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0186  beta-lactamase domain-containing protein  26.47 
 
 		 403 aa  66.2  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.69512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1774  beta-lactamase domain-containing protein  26.89 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4116  beta-lactamase-like protein  28.35 
 
 		 369 aa  55.8  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.712365  normal  0.318917 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0918  metallo-beta-lactamase family protein  25.3 
 
 		 384 aa  53.5  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0970  beta-lactamase domain-containing protein  23.55 
 
 		 228 aa  48.9  0.00009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000889609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1423  beta-lactamase domain-containing protein  22.35 
 
 		 279 aa  48.1  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.408877  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02038  beta-lactamase domain protein  26.27 
 
 		 454 aa  48.1  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3609  metallo-beta-lactamase family protein  23.51 
 
 		 391 aa  47  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0862663 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1958  hypothetical protein  30.52 
 
 		 763 aa  45.8  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0001218  normal  0.195131 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0051  beta-lactamase domain-containing protein  39.73 
 
 		 334 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.361885 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2578  hypothetical protein  40.68 
 
 		 763 aa  44.3  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0251432  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2666  hypothetical protein  40.68 
 
 		 763 aa  44.3  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0619  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 273 aa  44.3  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2209  hypothetical protein  35.82 
 
 		 747 aa  44.3  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.785174  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>