127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7304 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_7304  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 403 aa  813    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0186  beta-lactamase domain-containing protein  74.29 
 
 		 403 aa  615  1e-175  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.69512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0782  beta-lactamase domain protein  57.72 
 
 		 380 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0662639 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7499  beta-lactamase domain protein  49.3 
 
 		 356 aa  379  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5036  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase  44.09 
 
 		 409 aa  373  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.29289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3934  beta-lactamase domain-containing protein  43.45 
 
 		 372 aa  294  2e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  0.104471 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4302  beta-lactamase domain protein  43.45 
 
 		 372 aa  293  3e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.852512  normal  0.0730193 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5934  beta-lactamase domain-containing protein  42.86 
 
 		 372 aa  289  7e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.87219 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1064  beta-lactamase domain protein  42.26 
 
 		 372 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.393014  normal  0.0622516 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4116  beta-lactamase-like protein  44.33 
 
 		 369 aa  278  1e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.712365  normal  0.318917 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0072  beta-lactamase-like protein  45.17 
 
 		 347 aa  276  4e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1529  beta-lactamase domain protein  33.67 
 
 		 310 aa  153  7e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.823422 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1569  beta-lactamase domain-containing protein  34.47 
 
 		 312 aa  152  8e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0135813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1437  beta-lactamase domain protein  34.26 
 
 		 304 aa  152  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.256229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0880  beta-lactamase domain-containing protein  30.68 
 
 		 322 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1960  beta-lactamase-like  30.95 
 
 		 312 aa  144  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2897  beta-lactamase domain-containing protein  30.56 
 
 		 327 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0561  beta-lactamase domain-containing protein  28.39 
 
 		 294 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.624713  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0249  beta-lactamase domain protein  27.56 
 
 		 280 aa  103  7e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000647283  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1952  beta-lactamase domain-containing protein  31.33 
 
 		 304 aa  100  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0515  beta-lactamase domain-containing protein  25.17 
 
 		 284 aa  97.1  4e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0268037  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1080  beta-lactamase domain protein  27.88 
 
 		 284 aa  95.9  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000140431  normal  0.247329 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0924  beta-lactamase-like protein  29.39 
 
 		 276 aa  94.4  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.425794  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0308  beta-lactamase domain-containing protein  30.82 
 
 		 284 aa  94.7  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000646424  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0026  beta-lactamase domain-containing protein  30.04 
 
 		 266 aa  94.4  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.21687 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2299  beta-lactamase domain protein  30.74 
 
 		 279 aa  94  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1155  beta-lactamase domain-containing protein  31.62 
 
 		 282 aa  92.8  9e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0141595  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0535  beta-lactamase domain protein  27.54 
 
 		 262 aa  89.7  8e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1589  beta-lactamase superfamily hydrolase  28.1 
 
 		 278 aa  89.4  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1765  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 		 285 aa  89  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3104  beta-lactamase domain protein  27.97 
 
 		 265 aa  89.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000364883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3081  beta-lactamase domain protein  28.35 
 
 		 265 aa  87.8  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000213505  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3263  beta-lactamase domain-containing protein  28.35 
 
 		 265 aa  87.8  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0656446  normal  0.191577 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3145  beta-lactamase domain-containing protein  28.35 
 
 		 265 aa  87.4  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.398347 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3162  beta-lactamase domain protein  28.35 
 
 		 265 aa  87  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.20789  normal  0.546421 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0975  beta-lactamase domain-containing protein  27.53 
 
 		 255 aa  86.3  8e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000479718  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1154  beta-lactamase domain-containing protein  27.53 
 
 		 255 aa  86.3  8e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000123031  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1793  beta-lactamase domain protein  29.39 
 
 		 274 aa  83.6  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000988324  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1937  hypothetical protein  26.42 
 
 		 280 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.413348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1430  Beta-lactamase-like  28.03 
 
 		 280 aa  81.3  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000186428  normal  0.102633 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0446  beta-lactamase domain-containing protein  27.57 
 
 		 267 aa  80.9  0.00000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.986653  hitchhiker  0.00213721 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2186  beta-lactamase domain-containing protein  29.12 
 
 		 281 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0500  beta-lactamase domain protein  27.62 
 
 		 264 aa  79.7  0.00000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.977246  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1271  beta-lactamase domain-containing protein  30.92 
 
 		 272 aa  79  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0023  metallo-beta-lactamase superfamily protein  27.56 
 
 		 281 aa  79.3  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18400  beta-lactamase domain protein  25.78 
 
 		 278 aa  78.6  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.03744e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0446  beta-lactamase domain-containing protein  26.19 
 
 		 278 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000263498  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1138  hypothetical protein  24.91 
 
 		 276 aa  77.4  0.0000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2194  beta-lactamase domain-containing protein  26.69 
 
 		 279 aa  77.4  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1602  hypothetical protein  25.41 
 
 		 260 aa  77.4  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.737502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3123  Beta-lactamase-like  30.22 
 
 		 276 aa  76.3  0.0000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0149  hypothetical protein  26.37 
 
 		 282 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1375  beta-lactamase domain-containing protein  26.03 
 
 		 317 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.825748  hitchhiker  0.000507675 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1129  beta-lactamase domain-containing protein  24.65 
 
 		 272 aa  75.5  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000396645  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44454  predicted protein  26.49 
 
 		 447 aa  74.7  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1945  beta-lactamase domain-containing protein  27.13 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1455  hypothetical protein  23.98 
 
 		 260 aa  74.3  0.000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0495131  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1391  beta-lactamase domain-containing protein  28.15 
 
 		 295 aa  74.3  0.000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00324967  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0906  hypothetical protein  25.66 
 
 		 285 aa  74.3  0.000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.230913  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1747  beta-lactamase domain protein  26.12 
 
 		 275 aa  73.9  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2078  beta-lactamase domain-containing protein  27.35 
 
 		 279 aa  73.6  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0312  beta-lactamase domain-containing protein  22.13 
 
 		 260 aa  72.8  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.688716  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1236  beta-lactamase domain-containing protein  24.83 
 
 		 275 aa  72.4  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1434  beta-lactamase domain-containing protein  26.06 
 
 		 276 aa  72  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0999  metallo-beta-lactamase family protein  24.22 
 
 		 276 aa  70.1  0.00000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0149338  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1026  beta-lactamase domain-containing protein  21.72 
 
 		 260 aa  70.1  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0891988  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1168  metallo-beta-lactamase family protein  23.88 
 
 		 276 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.148902  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2374  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 280 aa  68.6  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.201878  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2125  metallo-beta-lactamase superfamily protein  27.71 
 
 		 280 aa  67.8  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.539323 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1430  beta-lactamase domain protein  25.91 
 
 		 276 aa  67.8  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.394554  normal  0.142096 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0970  beta-lactamase domain-containing protein  24.05 
 
 		 228 aa  67.8  0.0000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000889609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4225  beta-lactamase domain-containing protein  27.86 
 
 		 276 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.150926  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1912  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  23.87 
 
 		 268 aa  67.4  0.0000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.385619  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0397  metallo-beta-lactamase family protein  28.26 
 
 		 276 aa  66.6  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.257188  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3320  beta-lactamase domain-containing protein  28.05 
 
 		 277 aa  66.6  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0328164  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10608  metallo-beta-lactamase superfamily protein (AFU_orthologue; AFUA_3G07630)  35.9 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3463  beta-lactamase domain protein  27.51 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00409832  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1707  beta-lactamase domain protein  27.96 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.078929 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1227  beta-lactamase domain-containing protein  23.96 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1890  beta-lactamase domain-containing protein  46 
 
 		 218 aa  54.7  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1747  hypothetical protein  23.17 
 
 		 271 aa  53.9  0.000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1818  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily II-like protein  26.92 
 
 		 260 aa  53.5  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1106  Beta-lactamase-like  44.62 
 
 		 262 aa  52.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0773  beta-lactamase domain protein  23.51 
 
 		 237 aa  52.4  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1140  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 229 aa  51.2  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.636062  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1937  beta-lactamase domain-containing protein  45.83 
 
 		 212 aa  51.2  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0791  beta-lactamase domain-containing protein  23.05 
 
 		 330 aa  49.3  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00778966  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3388  beta-lactamase domain protein  34.52 
 
 		 263 aa  48.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1774  beta-lactamase domain-containing protein  31.48 
 
 		 221 aa  48.1  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2136  metallo-beta-lactamase family protein  34.62 
 
 		 386 aa  48.1  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0829  beta-lactamase domain protein  38.89 
 
 		 260 aa  47.4  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.362759  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1070  beta-lactamase-like protein  38.16 
 
 		 262 aa  47.4  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.941364 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2076  beta-lactamase-like protein  32.47 
 
 		 218 aa  47  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2546  beta-lactamase domain protein  41.07 
 
 		 257 aa  47  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0102753  normal  0.0179239 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1587  putative metallo-beta-lactamase family protein  41.07 
 
 		 257 aa  46.6  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1616  metallo-beta-lactamase family protein  30.95 
 
 		 385 aa  46.6  0.0009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00374588  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0918  metallo-beta-lactamase family protein  32.14 
 
 		 384 aa  45.8  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1631  metallo-beta-lactamase family protein  41.94 
 
 		 256 aa  45.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0446531  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1335  beta-lactamase domain-containing protein  37.7 
 
 		 258 aa  45.8  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1425  beta-lactamase domain-containing protein  41.07 
 
 		 257 aa  46.2  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101426  normal  0.203136 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>