146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0186 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0186  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 403 aa  831    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.69512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7304  beta-lactamase domain protein  74.29 
 
 		 403 aa  600  1e-170  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0782  beta-lactamase domain protein  59.73 
 
 		 380 aa  479  1e-134  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0662639 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5036  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase  44.95 
 
 		 409 aa  385  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.29289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7499  beta-lactamase domain protein  51.68 
 
 		 356 aa  378  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3934  beta-lactamase domain-containing protein  44.02 
 
 		 372 aa  295  9e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  0.104471 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4302  beta-lactamase domain protein  44.02 
 
 		 372 aa  294  1e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.852512  normal  0.0730193 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5934  beta-lactamase domain-containing protein  41.42 
 
 		 372 aa  283  6.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.87219 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1064  beta-lactamase domain protein  41.4 
 
 		 372 aa  280  4e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.393014  normal  0.0622516 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4116  beta-lactamase-like protein  43.04 
 
 		 369 aa  277  2e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.712365  normal  0.318917 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0072  beta-lactamase-like protein  42.74 
 
 		 347 aa  268  1e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1437  beta-lactamase domain protein  32.6 
 
 		 304 aa  149  7e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.256229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0880  beta-lactamase domain-containing protein  30.56 
 
 		 322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1960  beta-lactamase-like  32.75 
 
 		 312 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1569  beta-lactamase domain-containing protein  33.67 
 
 		 312 aa  145  1e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0135813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1529  beta-lactamase domain protein  28.74 
 
 		 310 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.823422 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2897  beta-lactamase domain-containing protein  28.44 
 
 		 327 aa  120  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0561  beta-lactamase domain-containing protein  28.42 
 
 		 294 aa  110  3e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.624713  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1952  beta-lactamase domain-containing protein  30.24 
 
 		 304 aa  101  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0515  beta-lactamase domain-containing protein  27.05 
 
 		 284 aa  100  5e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0268037  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0924  beta-lactamase-like protein  29.49 
 
 		 276 aa  99  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.425794  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1793  beta-lactamase domain protein  32.06 
 
 		 274 aa  99  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000988324  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0249  beta-lactamase domain protein  26.77 
 
 		 280 aa  97.8  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000647283  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0535  beta-lactamase domain protein  29.04 
 
 		 262 aa  95.5  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1155  beta-lactamase domain-containing protein  29.41 
 
 		 282 aa  95.1  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0141595  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1765  beta-lactamase domain protein  28.41 
 
 		 285 aa  93.2  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1602  hypothetical protein  28.36 
 
 		 260 aa  91.7  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.737502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0975  beta-lactamase domain-containing protein  27.34 
 
 		 255 aa  90.1  7e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000479718  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1154  beta-lactamase domain-containing protein  27.34 
 
 		 255 aa  90.1  7e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000123031  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0026  beta-lactamase domain-containing protein  27.38 
 
 		 266 aa  89.4  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.21687 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0312  beta-lactamase domain-containing protein  25.56 
 
 		 260 aa  89.4  1e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.688716  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1080  beta-lactamase domain protein  26.3 
 
 		 284 aa  88.2  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000140431  normal  0.247329 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1589  beta-lactamase superfamily hydrolase  26 
 
 		 278 aa  87.8  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1138  hypothetical protein  27.15 
 
 		 276 aa  87.8  3e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0446  beta-lactamase domain-containing protein  29.27 
 
 		 267 aa  87.4  4e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.986653  hitchhiker  0.00213721 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18400  beta-lactamase domain protein  27.18 
 
 		 278 aa  86.7  6e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.03744e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0308  beta-lactamase domain-containing protein  28.05 
 
 		 284 aa  86.3  8e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000646424  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1026  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 260 aa  85.9  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0891988  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3081  beta-lactamase domain protein  28.09 
 
 		 265 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000213505  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3145  beta-lactamase domain-containing protein  28.35 
 
 		 265 aa  84  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.398347 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3263  beta-lactamase domain-containing protein  28.09 
 
 		 265 aa  84  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0656446  normal  0.191577 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3162  beta-lactamase domain protein  28.09 
 
 		 265 aa  84  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.20789  normal  0.546421 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3104  beta-lactamase domain protein  27.72 
 
 		 265 aa  83.6  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000364883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1937  hypothetical protein  28.36 
 
 		 280 aa  82.4  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.413348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2299  beta-lactamase domain protein  27.84 
 
 		 279 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1430  Beta-lactamase-like  27.59 
 
 		 280 aa  82  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000186428  normal  0.102633 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0023  metallo-beta-lactamase superfamily protein  27.46 
 
 		 281 aa  82  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0906  hypothetical protein  24.91 
 
 		 285 aa  80.1  0.00000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.230913  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1455  hypothetical protein  24.18 
 
 		 260 aa  80.1  0.00000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0495131  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1129  beta-lactamase domain-containing protein  25.59 
 
 		 272 aa  79.7  0.00000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000396645  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2125  metallo-beta-lactamase superfamily protein  26.44 
 
 		 280 aa  79.3  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.539323 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1236  beta-lactamase domain-containing protein  25.72 
 
 		 275 aa  79  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1747  beta-lactamase domain protein  28.74 
 
 		 275 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1391  beta-lactamase domain-containing protein  28 
 
 		 295 aa  77.8  0.0000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00324967  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2186  beta-lactamase domain-containing protein  26.5 
 
 		 281 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2078  beta-lactamase domain-containing protein  29.1 
 
 		 279 aa  77  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0500  beta-lactamase domain protein  27.37 
 
 		 264 aa  76.3  0.0000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.977246  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2194  beta-lactamase domain-containing protein  25.95 
 
 		 279 aa  75.5  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1375  beta-lactamase domain-containing protein  23.81 
 
 		 317 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.825748  hitchhiker  0.000507675 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1434  beta-lactamase domain-containing protein  25.66 
 
 		 276 aa  74.3  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44454  predicted protein  27.2 
 
 		 447 aa  73.6  0.000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0149  hypothetical protein  25.59 
 
 		 282 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3123  Beta-lactamase-like  28.57 
 
 		 276 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0397  metallo-beta-lactamase family protein  27.9 
 
 		 276 aa  72  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.257188  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0446  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 278 aa  72  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000263498  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2374  beta-lactamase domain-containing protein  26.52 
 
 		 280 aa  71.2  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.201878  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1945  beta-lactamase domain-containing protein  27.34 
 
 		 278 aa  69.3  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0970  beta-lactamase domain-containing protein  24.74 
 
 		 228 aa  68.2  0.0000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000889609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1430  beta-lactamase domain protein  25.81 
 
 		 276 aa  66.2  0.0000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.394554  normal  0.142096 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4225  beta-lactamase domain-containing protein  26.47 
 
 		 276 aa  66.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.150926  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10608  metallo-beta-lactamase superfamily protein (AFU_orthologue; AFUA_3G07630)  35.42 
 
 		 212 aa  65.1  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1912  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  23.44 
 
 		 268 aa  65.5  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.385619  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1271  beta-lactamase domain-containing protein  47.95 
 
 		 272 aa  65.1  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3320  beta-lactamase domain-containing protein  28 
 
 		 277 aa  63.5  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0328164  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0773  beta-lactamase domain protein  24.15 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1168  metallo-beta-lactamase family protein  23.36 
 
 		 276 aa  60.5  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.148902  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0999  metallo-beta-lactamase family protein  23.03 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0149338  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1890  beta-lactamase domain-containing protein  40.28 
 
 		 218 aa  58.5  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1937  beta-lactamase domain-containing protein  42.25 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3463  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 276 aa  57  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00409832  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1747  hypothetical protein  24.7 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1707  beta-lactamase domain protein  24.46 
 
 		 283 aa  54.3  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.078929 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1227  beta-lactamase domain-containing protein  22.42 
 
 		 247 aa  53.5  0.000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0648  beta-lactamase domain protein  40.68 
 
 		 259 aa  51.6  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1774  beta-lactamase domain-containing protein  32.17 
 
 		 221 aa  51.6  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2443  hypothetical protein  41.82 
 
 		 285 aa  50.8  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2063  beta-lactamase domain-containing protein  36.11 
 
 		 256 aa  50.4  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1077  metallo-beta-lactamase superfamily protein  33.71 
 
 		 220 aa  49.7  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1818  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily II-like protein  26.25 
 
 		 260 aa  49.3  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0829  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 260 aa  49.3  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.362759  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1140  beta-lactamase domain protein  30.43 
 
 		 229 aa  48.9  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.636062  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2076  beta-lactamase-like protein  34.09 
 
 		 218 aa  48.1  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1016  hypothetical protein  36.73 
 
 		 239 aa  48.1  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0791  beta-lactamase domain-containing protein  39.19 
 
 		 330 aa  48.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00778966  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0664  metal dependent hydrolase  49.06 
 
 		 238 aa  47.8  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1631  metallo-beta-lactamase family protein  43.64 
 
 		 256 aa  47.4  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0446531  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4916  beta-lactamase domain protein  32.26 
 
 		 270 aa  47  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000121988  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2615  metallo-beta-lactamase family protein  30.83 
 
 		 263 aa  46.6  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1070  beta-lactamase-like protein  31.82 
 
 		 262 aa  46.2  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.941364 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5688  beta-lactamase-like  45.28 
 
 		 281 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>