108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2194 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_2194  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
279 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2374  beta-lactamase domain-containing protein  53.76 
 
 
280 aa  322  5e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.201878  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2125  metallo-beta-lactamase superfamily protein  55.56 
 
 
280 aa  318  9e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.539323 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1765  beta-lactamase domain protein  48.43 
 
 
285 aa  278  5e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1430  beta-lactamase domain protein  51.44 
 
 
276 aa  263  2e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.394554  normal  0.142096 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1912  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  40.22 
 
 
268 aa  204  2e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.385619  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1747  hypothetical protein  40.65 
 
 
271 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1747  beta-lactamase domain protein  33.96 
 
 
275 aa  145  9e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1793  beta-lactamase domain protein  36.1 
 
 
274 aa  141  9.999999999999999e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000988324  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1236  beta-lactamase domain-containing protein  36.49 
 
 
275 aa  140  3e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1434  beta-lactamase domain-containing protein  33.09 
 
 
276 aa  135  5e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1391  beta-lactamase domain-containing protein  35.84 
 
 
295 aa  135  9e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00324967  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1155  beta-lactamase domain-containing protein  34.72 
 
 
282 aa  134  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0141595  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3162  beta-lactamase domain protein  32.22 
 
 
265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.20789  normal  0.546421 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0515  beta-lactamase domain-containing protein  29.87 
 
 
284 aa  130  3e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0268037  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3081  beta-lactamase domain protein  32.22 
 
 
265 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000213505  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0149  hypothetical protein  32.46 
 
 
282 aa  129  6e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1952  beta-lactamase domain-containing protein  32.36 
 
 
304 aa  128  8.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3104  beta-lactamase domain protein  31.85 
 
 
265 aa  128  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000364883  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0561  beta-lactamase domain-containing protein  34.15 
 
 
294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.624713  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3263  beta-lactamase domain-containing protein  31.85 
 
 
265 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0656446  normal  0.191577 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3145  beta-lactamase domain-containing protein  31.85 
 
 
265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.398347 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1455  hypothetical protein  29.71 
 
 
260 aa  125  9e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0495131  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1430  Beta-lactamase-like  33.84 
 
 
280 aa  124  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000186428  normal  0.102633 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1818  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily II-like protein  35.71 
 
 
260 aa  123  3e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2299  beta-lactamase domain protein  33.2 
 
 
279 aa  123  3e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1589  beta-lactamase superfamily hydrolase  30.55 
 
 
278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0975  beta-lactamase domain-containing protein  33.98 
 
 
255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000479718  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1154  beta-lactamase domain-containing protein  33.98 
 
 
255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000123031  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0249  beta-lactamase domain protein  31.36 
 
 
280 aa  120  3e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000647283  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1026  beta-lactamase domain-containing protein  30.18 
 
 
260 aa  118  7.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0891988  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0312  beta-lactamase domain-containing protein  30.18 
 
 
260 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.688716  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18400  beta-lactamase domain protein  29.32 
 
 
278 aa  118  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.03744e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1602  hypothetical protein  31.27 
 
 
260 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.737502  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1960  beta-lactamase-like  33.1 
 
 
312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0924  beta-lactamase-like protein  29.43 
 
 
276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.425794  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1080  beta-lactamase domain protein  30.12 
 
 
284 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000140431  normal  0.247329 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0026  beta-lactamase domain-containing protein  30.15 
 
 
266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.21687 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1129  beta-lactamase domain-containing protein  28.06 
 
 
272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000396645  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0880  beta-lactamase domain-containing protein  32.55 
 
 
322 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2186  beta-lactamase domain-containing protein  32.33 
 
 
281 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1707  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.078929 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0535  beta-lactamase domain protein  29.63 
 
 
262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1937  hypothetical protein  32.83 
 
 
280 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.413348  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1168  metallo-beta-lactamase family protein  29.43 
 
 
276 aa  109  6e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.148902  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0308  beta-lactamase domain-containing protein  29.72 
 
 
284 aa  109  6e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000646424  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0023  metallo-beta-lactamase superfamily protein  30.37 
 
 
281 aa  109  6e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0397  metallo-beta-lactamase family protein  32.97 
 
 
276 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.257188  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1569  beta-lactamase domain-containing protein  32.71 
 
 
312 aa  108  9.000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0135813  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2078  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 
279 aa  107  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1437  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
304 aa  108  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.256229  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0999  metallo-beta-lactamase family protein  29.06 
 
 
276 aa  106  4e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0149338  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3123  Beta-lactamase-like  32.21 
 
 
276 aa  104  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4225  beta-lactamase domain-containing protein  32.46 
 
 
276 aa  104  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.150926  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1138  hypothetical protein  27.11 
 
 
276 aa  103  3e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1945  beta-lactamase domain-containing protein  31.03 
 
 
278 aa  102  9e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0500  beta-lactamase domain protein  29.06 
 
 
264 aa  101  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.977246  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3320  beta-lactamase domain-containing protein  31.12 
 
 
277 aa  100  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0328164  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1529  beta-lactamase domain protein  30.45 
 
 
310 aa  100  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.823422 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1375  beta-lactamase domain-containing protein  29.89 
 
 
317 aa  99.8  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.825748  hitchhiker  0.000507675 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0446  beta-lactamase domain-containing protein  31.49 
 
 
267 aa  99  8e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.986653  hitchhiker  0.00213721 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2897  beta-lactamase domain-containing protein  33.59 
 
 
327 aa  98.2  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0906  hypothetical protein  30.55 
 
 
285 aa  95.9  7e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.230913  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1271  beta-lactamase domain-containing protein  29.92 
 
 
272 aa  92.8  6e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1227  beta-lactamase domain-containing protein  30.17 
 
 
247 aa  89.7  4e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3848  beta-lactamase domain protein  29.6 
 
 
276 aa  88.2  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.5057  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3463  beta-lactamase domain protein  26.8 
 
 
276 aa  87  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00409832  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0446  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 
278 aa  86.3  5e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000263498  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3932  beta-lactamase domain protein  31.2 
 
 
276 aa  85.9  7e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0238376 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0773  beta-lactamase domain protein  27.21 
 
 
237 aa  83.6  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0072  beta-lactamase-like protein  30.18 
 
 
347 aa  79.7  0.00000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5934  beta-lactamase domain-containing protein  26.59 
 
 
372 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.87219 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7304  beta-lactamase domain protein  26.69 
 
 
403 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4116  beta-lactamase-like protein  30.15 
 
 
369 aa  76.6  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.712365  normal  0.318917 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3934  beta-lactamase domain-containing protein  27.38 
 
 
372 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  0.104471 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4302  beta-lactamase domain protein  27.38 
 
 
372 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.852512  normal  0.0730193 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1064  beta-lactamase domain protein  27.02 
 
 
372 aa  75.9  0.0000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.393014  normal  0.0622516 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0186  beta-lactamase domain-containing protein  25.95 
 
 
403 aa  75.5  0.0000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.69512  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1890  beta-lactamase domain-containing protein  27.85 
 
 
218 aa  74.3  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7499  beta-lactamase domain protein  27.07 
 
 
356 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5036  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase  26.38 
 
 
409 aa  70.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.29289  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0782  beta-lactamase domain protein  26.97 
 
 
380 aa  69.3  0.00000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0662639 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1937  beta-lactamase domain-containing protein  27.07 
 
 
212 aa  66.6  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10608  metallo-beta-lactamase superfamily protein (AFU_orthologue; AFUA_3G07630)  31.37 
 
 
212 aa  64.7  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1774  beta-lactamase domain-containing protein  28.09 
 
 
221 aa  63.2  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44454  predicted protein  27.73 
 
 
447 aa  62  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2076  beta-lactamase-like protein  24.55 
 
 
218 aa  59.3  0.00000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0791  beta-lactamase domain-containing protein  26.99 
 
 
330 aa  56.6  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00778966  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1140  beta-lactamase domain protein  26.34 
 
 
229 aa  55.8  0.0000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.636062  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1077  metallo-beta-lactamase superfamily protein  21.22 
 
 
220 aa  52.8  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2025  hypothetical protein  58.33 
 
 
78 aa  52  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.494899  normal  0.229701 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1722  metallo-beta-lactamase family protein  25.37 
 
 
382 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1013  metallo-beta-lactamase family protein  34.94 
 
 
603 aa  45.8  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2063  beta-lactamase domain-containing protein  42.37 
 
 
256 aa  45.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0168  metallo-beta-lactamase family protein  34.94 
 
 
459 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1339  metallo-beta-lactamase family protein  34.94 
 
 
472 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2742  metallo-beta-lactamase family protein  34.94 
 
 
472 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.213611  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2599  metallo-beta-lactamase family protein  34.94 
 
 
472 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0195  metallo-beta-lactamase family protein  34.94 
 
 
472 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1616  metallo-beta-lactamase family protein  24.24 
 
 
385 aa  43.5  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00374588  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>