108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0924 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0924  beta-lactamase-like protein  100 
 
 		 276 aa  561  1.0000000000000001e-159  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.425794  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3463  beta-lactamase domain protein  40.15 
 
 		 276 aa  211  1e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00409832  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4225  beta-lactamase domain-containing protein  39.64 
 
 		 276 aa  208  6e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.150926  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3123  Beta-lactamase-like  41.24 
 
 		 276 aa  208  7e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1747  beta-lactamase domain protein  41.33 
 
 		 275 aa  204  1e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0397  metallo-beta-lactamase family protein  38.91 
 
 		 276 aa  202  4e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.257188  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1434  beta-lactamase domain-containing protein  36.86 
 
 		 276 aa  202  7e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1155  beta-lactamase domain-containing protein  37.59 
 
 		 282 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0141595  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2078  beta-lactamase domain-containing protein  39.64 
 
 		 279 aa  200  1.9999999999999998e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1945  beta-lactamase domain-containing protein  38.79 
 
 		 278 aa  194  9e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1793  beta-lactamase domain protein  39.41 
 
 		 274 aa  193  3e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000988324  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3320  beta-lactamase domain-containing protein  39.21 
 
 		 277 aa  192  5e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0328164  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3932  beta-lactamase domain protein  40.46 
 
 		 276 aa  188  8e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0238376 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1080  beta-lactamase domain protein  39.05 
 
 		 284 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000140431  normal  0.247329 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3848  beta-lactamase domain protein  41.6 
 
 		 276 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.5057  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1430  Beta-lactamase-like  36.43 
 
 		 280 aa  182  4.0000000000000006e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000186428  normal  0.102633 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0249  beta-lactamase domain protein  38.85 
 
 		 280 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000647283  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1937  hypothetical protein  33.94 
 
 		 280 aa  177  2e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.413348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0308  beta-lactamase domain-containing protein  38.63 
 
 		 284 aa  176  4e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000646424  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1375  beta-lactamase domain-containing protein  37.6 
 
 		 317 aa  175  8e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.825748  hitchhiker  0.000507675 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1952  beta-lactamase domain-containing protein  38.32 
 
 		 304 aa  172  6.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1589  beta-lactamase superfamily hydrolase  36.5 
 
 		 278 aa  169  4e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18400  beta-lactamase domain protein  32.61 
 
 		 278 aa  168  9e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.03744e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0561  beta-lactamase domain-containing protein  36.59 
 
 		 294 aa  157  1e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.624713  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0446  beta-lactamase domain-containing protein  36.47 
 
 		 267 aa  156  4e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.986653  hitchhiker  0.00213721 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2299  beta-lactamase domain protein  35.27 
 
 		 279 aa  155  1e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1529  beta-lactamase domain protein  36.82 
 
 		 310 aa  144  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.823422 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1437  beta-lactamase domain protein  33.79 
 
 		 304 aa  143  3e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.256229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1569  beta-lactamase domain-containing protein  33.82 
 
 		 312 aa  140  3e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0135813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1391  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 		 295 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00324967  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0535  beta-lactamase domain protein  34.11 
 
 		 262 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1236  beta-lactamase domain-containing protein  31.7 
 
 		 275 aa  137  1e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0880  beta-lactamase domain-containing protein  35.69 
 
 		 322 aa  134  9.999999999999999e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1026  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 260 aa  133  3e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0891988  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1912  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  34.11 
 
 		 268 aa  132  5e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.385619  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1602  hypothetical protein  31.7 
 
 		 260 aa  132  6e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.737502  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0149  hypothetical protein  33.33 
 
 		 282 aa  132  9e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2125  metallo-beta-lactamase superfamily protein  34.57 
 
 		 280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.539323 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1129  beta-lactamase domain-containing protein  29.44 
 
 		 272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000396645  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0312  beta-lactamase domain-containing protein  32.56 
 
 		 260 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.688716  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0515  beta-lactamase domain-containing protein  32.36 
 
 		 284 aa  126  3e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0268037  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1138  hypothetical protein  27.68 
 
 		 276 aa  126  4.0000000000000003e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1960  beta-lactamase-like  31.11 
 
 		 312 aa  124  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2374  beta-lactamase domain-containing protein  30.57 
 
 		 280 aa  123  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.201878  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1765  beta-lactamase domain protein  29.12 
 
 		 285 aa  120  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1455  hypothetical protein  29.84 
 
 		 260 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0495131  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0906  hypothetical protein  30 
 
 		 285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.230913  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1707  beta-lactamase domain protein  27.37 
 
 		 283 aa  117  3e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.078929 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0023  metallo-beta-lactamase superfamily protein  30.39 
 
 		 281 aa  116  3.9999999999999997e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1430  beta-lactamase domain protein  29.45 
 
 		 276 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.394554  normal  0.142096 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2194  beta-lactamase domain-containing protein  29.43 
 
 		 279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0500  beta-lactamase domain protein  31.18 
 
 		 264 aa  113  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.977246  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1818  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily II-like protein  32.2 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3104  beta-lactamase domain protein  30.6 
 
 		 265 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000364883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1747  hypothetical protein  31.52 
 
 		 271 aa  112  5e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0446  beta-lactamase domain-containing protein  29.51 
 
 		 278 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000263498  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2897  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 327 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2186  beta-lactamase domain-containing protein  29.33 
 
 		 281 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3263  beta-lactamase domain-containing protein  30.6 
 
 		 265 aa  108  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0656446  normal  0.191577 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3081  beta-lactamase domain protein  30.6 
 
 		 265 aa  108  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000213505  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3162  beta-lactamase domain protein  30.6 
 
 		 265 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.20789  normal  0.546421 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0975  beta-lactamase domain-containing protein  28.52 
 
 		 255 aa  106  3e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000479718  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1154  beta-lactamase domain-containing protein  28.52 
 
 		 255 aa  106  3e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000123031  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3145  beta-lactamase domain-containing protein  30.6 
 
 		 265 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.398347 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0026  beta-lactamase domain-containing protein  30.11 
 
 		 266 aa  106  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.21687 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0186  beta-lactamase domain-containing protein  29.49 
 
 		 403 aa  99  7e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.69512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7304  beta-lactamase domain protein  29.39 
 
 		 403 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0782  beta-lactamase domain protein  27.15 
 
 		 380 aa  93.2  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0662639 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0999  metallo-beta-lactamase family protein  26.98 
 
 		 276 aa  90.5  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0149338  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1168  metallo-beta-lactamase family protein  26.91 
 
 		 276 aa  90.1  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.148902  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5934  beta-lactamase domain-containing protein  27.21 
 
 		 372 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.87219 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3934  beta-lactamase domain-containing protein  26.64 
 
 		 372 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  0.104471 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4302  beta-lactamase domain protein  26.64 
 
 		 372 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.852512  normal  0.0730193 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5036  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase  24.43 
 
 		 409 aa  85.9  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.29289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0072  beta-lactamase-like protein  26.64 
 
 		 347 aa  84.3  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1227  beta-lactamase domain-containing protein  28.84 
 
 		 247 aa  82.8  0.000000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7499  beta-lactamase domain protein  26.69 
 
 		 356 aa  82.4  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44454  predicted protein  26.32 
 
 		 447 aa  81.6  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1064  beta-lactamase domain protein  25.26 
 
 		 372 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.393014  normal  0.0622516 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1890  beta-lactamase domain-containing protein  27.94 
 
 		 218 aa  77.4  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1271  beta-lactamase domain-containing protein  26 
 
 		 272 aa  76.6  0.0000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0773  beta-lactamase domain protein  24.45 
 
 		 237 aa  76.3  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2076  beta-lactamase-like protein  29.61 
 
 		 218 aa  75.9  0.0000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1937  beta-lactamase domain-containing protein  24.8 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0509  metallo-beta-lactamase family protein  27.59 
 
 		 385 aa  70.1  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.16796 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10608  metallo-beta-lactamase superfamily protein (AFU_orthologue; AFUA_3G07630)  28.57 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1774  beta-lactamase domain-containing protein  22.83 
 
 		 221 aa  65.1  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4116  beta-lactamase-like protein  24.56 
 
 		 369 aa  63.9  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.712365  normal  0.318917 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1616  metallo-beta-lactamase family protein  27.48 
 
 		 385 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00374588  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2136  metallo-beta-lactamase family protein  25.38 
 
 		 386 aa  59.7  0.00000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1077  metallo-beta-lactamase superfamily protein  23.05 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3609  metallo-beta-lactamase family protein  27.24 
 
 		 391 aa  56.6  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0862663 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1140  beta-lactamase domain protein  26.1 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.636062  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0970  beta-lactamase domain-containing protein  22.79 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000889609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3149  metallo-beta-lactamase family protein  26.14 
 
 		 391 aa  55.8  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0567281  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0918  metallo-beta-lactamase family protein  25 
 
 		 384 aa  54.3  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1722  metallo-beta-lactamase family protein  24.62 
 
 		 382 aa  53.5  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02038  beta-lactamase domain protein  24.78 
 
 		 454 aa  53.1  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0791  beta-lactamase domain-containing protein  25.68 
 
 		 330 aa  52.4  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00778966  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1817  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  39.44 
 
 		 635 aa  45.8  0.0008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>