96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0023 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0023  metallo-beta-lactamase superfamily protein  100 
 
 		 281 aa  577  1e-164  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2186  beta-lactamase domain-containing protein  82.56 
 
 		 281 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0149  hypothetical protein  69.4 
 
 		 282 aa  421  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0446  beta-lactamase domain-containing protein  36.23 
 
 		 278 aa  189  4e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000263498  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1129  beta-lactamase domain-containing protein  33.69 
 
 		 272 aa  172  5e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000396645  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1168  metallo-beta-lactamase family protein  33.69 
 
 		 276 aa  150  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.148902  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0999  metallo-beta-lactamase family protein  33.69 
 
 		 276 aa  149  4e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0149338  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0535  beta-lactamase domain protein  30.04 
 
 		 262 aa  122  9e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1793  beta-lactamase domain protein  27.72 
 
 		 274 aa  121  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000988324  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0924  beta-lactamase-like protein  30.39 
 
 		 276 aa  116  3.9999999999999997e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.425794  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1155  beta-lactamase domain-containing protein  27.56 
 
 		 282 aa  115  6.9999999999999995e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0141595  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2194  beta-lactamase domain-containing protein  30.37 
 
 		 279 aa  109  6e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1945  beta-lactamase domain-containing protein  26.79 
 
 		 278 aa  106  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0561  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 		 294 aa  105  9e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.624713  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1589  beta-lactamase superfamily hydrolase  28.19 
 
 		 278 aa  104  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1391  beta-lactamase domain-containing protein  25.69 
 
 		 295 aa  103  3e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00324967  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0397  metallo-beta-lactamase family protein  28.57 
 
 		 276 aa  102  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.257188  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1952  beta-lactamase domain-containing protein  27.21 
 
 		 304 aa  102  6e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3123  Beta-lactamase-like  27.8 
 
 		 276 aa  102  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0906  hypothetical protein  26.59 
 
 		 285 aa  100  3e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.230913  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1375  beta-lactamase domain-containing protein  25.67 
 
 		 317 aa  100  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.825748  hitchhiker  0.000507675 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1271  beta-lactamase domain-containing protein  27.17 
 
 		 272 aa  100  3e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1747  beta-lactamase domain protein  28.76 
 
 		 275 aa  99.8  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1154  beta-lactamase domain-containing protein  29.36 
 
 		 255 aa  98.6  9e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000123031  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0975  beta-lactamase domain-containing protein  29.36 
 
 		 255 aa  98.6  9e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000479718  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3463  beta-lactamase domain protein  28.03 
 
 		 276 aa  99  9e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00409832  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2078  beta-lactamase domain-containing protein  26.09 
 
 		 279 aa  98.2  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0026  beta-lactamase domain-containing protein  27.73 
 
 		 266 aa  97.8  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.21687 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0308  beta-lactamase domain-containing protein  27.07 
 
 		 284 aa  97.1  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000646424  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1937  hypothetical protein  24.91 
 
 		 280 aa  96.7  4e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.413348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4225  beta-lactamase domain-containing protein  26.97 
 
 		 276 aa  95.9  7e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.150926  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1080  beta-lactamase domain protein  27.48 
 
 		 284 aa  94.4  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000140431  normal  0.247329 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18400  beta-lactamase domain protein  25.68 
 
 		 278 aa  94  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.03744e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1707  beta-lactamase domain protein  26.42 
 
 		 283 aa  94  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.078929 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1138  hypothetical protein  25.44 
 
 		 276 aa  91.7  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0249  beta-lactamase domain protein  28.77 
 
 		 280 aa  89.7  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000647283  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3145  beta-lactamase domain-containing protein  28.28 
 
 		 265 aa  89.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.398347 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1430  Beta-lactamase-like  24.04 
 
 		 280 aa  89  8e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000186428  normal  0.102633 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1434  beta-lactamase domain-containing protein  28.68 
 
 		 276 aa  88.6  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3104  beta-lactamase domain protein  28.16 
 
 		 265 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000364883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3263  beta-lactamase domain-containing protein  28.69 
 
 		 265 aa  87.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0656446  normal  0.191577 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3081  beta-lactamase domain protein  28.69 
 
 		 265 aa  87.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000213505  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3162  beta-lactamase domain protein  28.69 
 
 		 265 aa  87  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.20789  normal  0.546421 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0500  beta-lactamase domain protein  29.39 
 
 		 264 aa  86.7  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.977246  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1437  beta-lactamase domain protein  27.24 
 
 		 304 aa  85.1  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.256229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7499  beta-lactamase domain protein  25.62 
 
 		 356 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1960  beta-lactamase-like  28.62 
 
 		 312 aa  84  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2374  beta-lactamase domain-containing protein  25.18 
 
 		 280 aa  82.8  0.000000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.201878  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0186  beta-lactamase domain-containing protein  27.46 
 
 		 403 aa  82  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.69512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0880  beta-lactamase domain-containing protein  29.53 
 
 		 322 aa  80.5  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2125  metallo-beta-lactamase superfamily protein  24.57 
 
 		 280 aa  79.7  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.539323 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0515  beta-lactamase domain-containing protein  26.74 
 
 		 284 aa  79.3  0.00000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0268037  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7304  beta-lactamase domain protein  27.56 
 
 		 403 aa  79.3  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1430  beta-lactamase domain protein  26.16 
 
 		 276 aa  79.3  0.00000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.394554  normal  0.142096 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3320  beta-lactamase domain-containing protein  24.15 
 
 		 277 aa  79  0.00000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0328164  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1227  beta-lactamase domain-containing protein  27.73 
 
 		 247 aa  77.8  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3932  beta-lactamase domain protein  28.22 
 
 		 276 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0238376 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1765  beta-lactamase domain protein  25.42 
 
 		 285 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1236  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 		 275 aa  78.2  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1569  beta-lactamase domain-containing protein  26.5 
 
 		 312 aa  77.8  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0135813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0446  beta-lactamase domain-containing protein  25.45 
 
 		 267 aa  77.8  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.986653  hitchhiker  0.00213721 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3934  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 		 372 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  0.104471 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0312  beta-lactamase domain-containing protein  27.01 
 
 		 260 aa  76.6  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.688716  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4302  beta-lactamase domain protein  27.27 
 
 		 372 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.852512  normal  0.0730193 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1064  beta-lactamase domain protein  27.64 
 
 		 372 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.393014  normal  0.0622516 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0782  beta-lactamase domain protein  25.26 
 
 		 380 aa  74.7  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0662639 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2897  beta-lactamase domain-containing protein  25.7 
 
 		 327 aa  74.7  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5934  beta-lactamase domain-containing protein  27.88 
 
 		 372 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.87219 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0773  beta-lactamase domain protein  24.44 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3848  beta-lactamase domain protein  28.63 
 
 		 276 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.5057  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1026  beta-lactamase domain-containing protein  24.82 
 
 		 260 aa  72.4  0.000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0891988  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1529  beta-lactamase domain protein  26.84 
 
 		 310 aa  71.6  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.823422 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1912  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  25.57 
 
 		 268 aa  71.2  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.385619  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1602  hypothetical protein  24.45 
 
 		 260 aa  70.5  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.737502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1747  hypothetical protein  24.15 
 
 		 271 aa  70.1  0.00000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1455  hypothetical protein  26.24 
 
 		 260 aa  69.3  0.00000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0495131  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1818  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily II-like protein  25.61 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4116  beta-lactamase-like protein  27 
 
 		 369 aa  65.5  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.712365  normal  0.318917 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2299  beta-lactamase domain protein  22.63 
 
 		 279 aa  64.7  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5036  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase  24.52 
 
 		 409 aa  63.2  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.29289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0072  beta-lactamase-like protein  27.01 
 
 		 347 aa  62.8  0.000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44454  predicted protein  22.86 
 
 		 447 aa  61.2  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1937  beta-lactamase domain-containing protein  26.73 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1077  metallo-beta-lactamase superfamily protein  25.13 
 
 		 220 aa  58.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2076  beta-lactamase-like protein  24.88 
 
 		 218 aa  58.5  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1890  beta-lactamase domain-containing protein  27.19 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1774  beta-lactamase domain-containing protein  22.44 
 
 		 221 aa  53.1  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10608  metallo-beta-lactamase superfamily protein (AFU_orthologue; AFUA_3G07630)  34.12 
 
 		 212 aa  50.4  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1616  metallo-beta-lactamase family protein  20.77 
 
 		 385 aa  49.3  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00374588  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1140  beta-lactamase domain protein  24.71 
 
 		 229 aa  48.9  0.00009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.636062  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0509  metallo-beta-lactamase family protein  21.85 
 
 		 385 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.16796 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0970  beta-lactamase domain-containing protein  23.04 
 
 		 228 aa  45.4  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000889609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0918  metallo-beta-lactamase family protein  22.94 
 
 		 384 aa  45.4  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0455  beta-lactamase domain-containing protein  37.14 
 
 		 636 aa  44.7  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.263173 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0791  beta-lactamase domain-containing protein  22.4 
 
 		 330 aa  44.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00778966  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02038  beta-lactamase domain protein  23.72 
 
 		 454 aa  44.3  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>