98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7499 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_7499  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 356 aa  734    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0186  beta-lactamase domain-containing protein  51.68 
 
 		 403 aa  378  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.69512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0782  beta-lactamase domain protein  50 
 
 		 380 aa  377  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0662639 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7304  beta-lactamase domain protein  50.44 
 
 		 403 aa  375  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5036  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase  44.35 
 
 		 409 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.29289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4116  beta-lactamase-like protein  44.54 
 
 		 369 aa  290  2e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.712365  normal  0.318917 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3934  beta-lactamase domain-containing protein  42.6 
 
 		 372 aa  290  3e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  0.104471 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4302  beta-lactamase domain protein  42.6 
 
 		 372 aa  290  4e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.852512  normal  0.0730193 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5934  beta-lactamase domain-containing protein  40.24 
 
 		 372 aa  278  1e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.87219 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1064  beta-lactamase domain protein  41.12 
 
 		 372 aa  277  2e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.393014  normal  0.0622516 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0072  beta-lactamase-like protein  42.6 
 
 		 347 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1437  beta-lactamase domain protein  34.6 
 
 		 304 aa  157  2e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.256229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0880  beta-lactamase domain-containing protein  31.94 
 
 		 322 aa  156  5.0000000000000005e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1569  beta-lactamase domain-containing protein  33.67 
 
 		 312 aa  148  1.0000000000000001e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0135813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1529  beta-lactamase domain protein  30.36 
 
 		 310 aa  144  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.823422 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2897  beta-lactamase domain-containing protein  28.74 
 
 		 327 aa  127  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1960  beta-lactamase-like  29.17 
 
 		 312 aa  123  5e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0561  beta-lactamase domain-containing protein  30.24 
 
 		 294 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.624713  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1589  beta-lactamase superfamily hydrolase  29.86 
 
 		 278 aa  96.7  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0026  beta-lactamase domain-containing protein  29.31 
 
 		 266 aa  94.4  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.21687 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1375  beta-lactamase domain-containing protein  25.54 
 
 		 317 aa  92  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.825748  hitchhiker  0.000507675 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1952  beta-lactamase domain-containing protein  27.6 
 
 		 304 aa  91.3  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18400  beta-lactamase domain protein  26.97 
 
 		 278 aa  90.9  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.03744e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0515  beta-lactamase domain-containing protein  26.83 
 
 		 284 aa  90.1  6e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0268037  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0906  hypothetical protein  28.67 
 
 		 285 aa  89  1e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.230913  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0446  beta-lactamase domain-containing protein  27.8 
 
 		 267 aa  87  4e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.986653  hitchhiker  0.00213721 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0249  beta-lactamase domain protein  26.09 
 
 		 280 aa  87  5e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000647283  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3104  beta-lactamase domain protein  25.78 
 
 		 265 aa  87  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000364883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3162  beta-lactamase domain protein  25.78 
 
 		 265 aa  86.7  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.20789  normal  0.546421 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1154  beta-lactamase domain-containing protein  28.95 
 
 		 255 aa  86.3  7e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000123031  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0975  beta-lactamase domain-containing protein  28.95 
 
 		 255 aa  86.3  7e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000479718  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0999  metallo-beta-lactamase family protein  26.35 
 
 		 276 aa  86.3  8e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0149338  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1168  metallo-beta-lactamase family protein  26.01 
 
 		 276 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.148902  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0023  metallo-beta-lactamase superfamily protein  25.62 
 
 		 281 aa  85.5  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0446  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 		 278 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000263498  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1236  beta-lactamase domain-containing protein  25.55 
 
 		 275 aa  84.3  0.000000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3145  beta-lactamase domain-containing protein  25.88 
 
 		 265 aa  84  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.398347 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0149  hypothetical protein  27.81 
 
 		 282 aa  84  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1765  beta-lactamase domain protein  26.97 
 
 		 285 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3081  beta-lactamase domain protein  25.44 
 
 		 265 aa  84  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000213505  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44454  predicted protein  26.24 
 
 		 447 aa  83.6  0.000000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3263  beta-lactamase domain-containing protein  25.44 
 
 		 265 aa  82.8  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0656446  normal  0.191577 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0535  beta-lactamase domain protein  27.17 
 
 		 262 aa  82.8  0.000000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2186  beta-lactamase domain-containing protein  26.39 
 
 		 281 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0924  beta-lactamase-like protein  26.69 
 
 		 276 aa  82.4  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.425794  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0308  beta-lactamase domain-containing protein  27.78 
 
 		 284 aa  80.5  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000646424  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1080  beta-lactamase domain protein  25.72 
 
 		 284 aa  79.3  0.00000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000140431  normal  0.247329 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1271  beta-lactamase domain-containing protein  28.91 
 
 		 272 aa  79.3  0.00000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2299  beta-lactamase domain protein  28.41 
 
 		 279 aa  79.3  0.00000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1138  hypothetical protein  26.8 
 
 		 276 aa  79  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1747  beta-lactamase domain protein  26.47 
 
 		 275 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1602  hypothetical protein  26.45 
 
 		 260 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.737502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1793  beta-lactamase domain protein  28.46 
 
 		 274 aa  78.6  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000988324  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1155  beta-lactamase domain-containing protein  26.55 
 
 		 282 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0141595  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1430  Beta-lactamase-like  25.91 
 
 		 280 aa  76.3  0.0000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000186428  normal  0.102633 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0312  beta-lactamase domain-containing protein  26.58 
 
 		 260 aa  75.9  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.688716  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1434  beta-lactamase domain-containing protein  26.72 
 
 		 276 aa  75.9  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3123  Beta-lactamase-like  27.3 
 
 		 276 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2078  beta-lactamase domain-containing protein  27.96 
 
 		 279 aa  74.7  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4225  beta-lactamase domain-containing protein  27.99 
 
 		 276 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.150926  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2125  metallo-beta-lactamase superfamily protein  26.34 
 
 		 280 aa  74.7  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.539323 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2194  beta-lactamase domain-containing protein  27.07 
 
 		 279 aa  74.7  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1026  beta-lactamase domain-containing protein  25.82 
 
 		 260 aa  73.9  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0891988  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1391  beta-lactamase domain-containing protein  27.44 
 
 		 295 aa  73.6  0.000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00324967  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1937  hypothetical protein  25.74 
 
 		 280 aa  72.8  0.000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.413348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0970  beta-lactamase domain-containing protein  25.77 
 
 		 228 aa  71.6  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000889609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1912  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  24.71 
 
 		 268 aa  72  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.385619  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1129  beta-lactamase domain-containing protein  23.78 
 
 		 272 aa  71.2  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000396645  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2374  beta-lactamase domain-containing protein  27.2 
 
 		 280 aa  69.7  0.00000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.201878  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10608  metallo-beta-lactamase superfamily protein (AFU_orthologue; AFUA_3G07630)  37.11 
 
 		 212 aa  68.9  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0397  metallo-beta-lactamase family protein  27.72 
 
 		 276 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.257188  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1890  beta-lactamase domain-containing protein  27.07 
 
 		 218 aa  68.2  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0500  beta-lactamase domain protein  29.02 
 
 		 264 aa  65.9  0.0000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.977246  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1945  beta-lactamase domain-containing protein  26.19 
 
 		 278 aa  65.1  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3463  beta-lactamase domain protein  27.17 
 
 		 276 aa  64.3  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00409832  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3320  beta-lactamase domain-containing protein  26.94 
 
 		 277 aa  63.2  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0328164  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1430  beta-lactamase domain protein  26.61 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.394554  normal  0.142096 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1747  hypothetical protein  24.02 
 
 		 271 aa  62  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1077  metallo-beta-lactamase superfamily protein  41.43 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3932  beta-lactamase domain protein  30.45 
 
 		 276 aa  60.1  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0238376 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0773  beta-lactamase domain protein  23.85 
 
 		 237 aa  58.5  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1455  hypothetical protein  22.26 
 
 		 260 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0495131  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1937  beta-lactamase domain-containing protein  44.78 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3848  beta-lactamase domain protein  30.83 
 
 		 276 aa  54.3  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.5057  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1774  beta-lactamase domain-containing protein  38.46 
 
 		 221 aa  53.9  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2076  beta-lactamase-like protein  39.39 
 
 		 218 aa  52.8  0.000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1818  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily II-like protein  25.19 
 
 		 260 aa  48.9  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0791  beta-lactamase domain-containing protein  25.23 
 
 		 330 aa  48.9  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00778966  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1227  beta-lactamase domain-containing protein  22.52 
 
 		 247 aa  48.1  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1140  beta-lactamase domain protein  21.99 
 
 		 229 aa  47.8  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.636062  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1707  beta-lactamase domain protein  44.44 
 
 		 283 aa  45.8  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.078929 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1616  metallo-beta-lactamase family protein  29.81 
 
 		 385 aa  43.9  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00374588  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2983  beta-lactamase domain-containing protein  50 
 
 		 304 aa  43.5  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.518136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2136  metallo-beta-lactamase family protein  32.98 
 
 		 386 aa  43.1  0.007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5688  beta-lactamase-like  42 
 
 		 281 aa  42.7  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6052  beta-lactamase domain-containing protein  42 
 
 		 281 aa  42.7  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.825618 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4916  beta-lactamase domain protein  36.17 
 
 		 270 aa  42.7  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000121988  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2546  beta-lactamase domain protein  22.18 
 
 		 257 aa  42.7  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0102753  normal  0.0179239 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>