101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0782 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0782  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 380 aa  785    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0662639 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0186  beta-lactamase domain-containing protein  59.73 
 
 		 403 aa  479  1e-134  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.69512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7304  beta-lactamase domain protein  57.72 
 
 		 403 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7499  beta-lactamase domain protein  50 
 
 		 356 aa  377  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5036  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase  43.65 
 
 		 409 aa  360  3e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.29289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3934  beta-lactamase domain-containing protein  41.78 
 
 		 372 aa  288  1e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  0.104471 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4302  beta-lactamase domain protein  41.78 
 
 		 372 aa  288  1e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.852512  normal  0.0730193 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4116  beta-lactamase-like protein  42.74 
 
 		 369 aa  281  1e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.712365  normal  0.318917 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5934  beta-lactamase domain-containing protein  41 
 
 		 372 aa  280  3e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.87219 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0072  beta-lactamase-like protein  42.98 
 
 		 347 aa  278  1e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1064  beta-lactamase domain protein  42.2 
 
 		 372 aa  278  1e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.393014  normal  0.0622516 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1529  beta-lactamase domain protein  32.34 
 
 		 310 aa  150  4e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.823422 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0880  beta-lactamase domain-containing protein  30.24 
 
 		 322 aa  146  8.000000000000001e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1569  beta-lactamase domain-containing protein  32.02 
 
 		 312 aa  145  1e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0135813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1437  beta-lactamase domain protein  30.03 
 
 		 304 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.256229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1960  beta-lactamase-like  30.24 
 
 		 312 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0561  beta-lactamase domain-containing protein  31.94 
 
 		 294 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.624713  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2897  beta-lactamase domain-containing protein  28.48 
 
 		 327 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1952  beta-lactamase domain-containing protein  28.24 
 
 		 304 aa  99.8  7e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1793  beta-lactamase domain protein  28.91 
 
 		 274 aa  97.8  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000988324  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0924  beta-lactamase-like protein  27.15 
 
 		 276 aa  93.2  6e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.425794  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1155  beta-lactamase domain-containing protein  28.12 
 
 		 282 aa  92.4  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0141595  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1765  beta-lactamase domain protein  31.15 
 
 		 285 aa  92.4  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0906  hypothetical protein  28.14 
 
 		 285 aa  92.4  1e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.230913  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0975  beta-lactamase domain-containing protein  27.57 
 
 		 255 aa  90.9  3e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000479718  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1154  beta-lactamase domain-containing protein  27.57 
 
 		 255 aa  90.9  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000123031  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0249  beta-lactamase domain protein  26.46 
 
 		 280 aa  90.1  6e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000647283  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1589  beta-lactamase superfamily hydrolase  26.87 
 
 		 278 aa  89.7  8e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0026  beta-lactamase domain-containing protein  30.65 
 
 		 266 aa  87.4  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.21687 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2125  metallo-beta-lactamase superfamily protein  31.28 
 
 		 280 aa  87  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.539323 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18400  beta-lactamase domain protein  27.43 
 
 		 278 aa  87  5e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.03744e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2299  beta-lactamase domain protein  28.62 
 
 		 279 aa  86.3  8e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0515  beta-lactamase domain-containing protein  23.71 
 
 		 284 aa  84.3  0.000000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0268037  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1080  beta-lactamase domain protein  26.64 
 
 		 284 aa  83.6  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000140431  normal  0.247329 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1434  beta-lactamase domain-containing protein  30.3 
 
 		 276 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1937  hypothetical protein  26.46 
 
 		 280 aa  82.4  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.413348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3162  beta-lactamase domain protein  27.24 
 
 		 265 aa  81.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.20789  normal  0.546421 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1138  hypothetical protein  26.13 
 
 		 276 aa  81.3  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3123  Beta-lactamase-like  26.84 
 
 		 276 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3145  beta-lactamase domain-containing protein  26.85 
 
 		 265 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.398347 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3081  beta-lactamase domain protein  26.85 
 
 		 265 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000213505  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3263  beta-lactamase domain-containing protein  26.85 
 
 		 265 aa  77.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0656446  normal  0.191577 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0446  beta-lactamase domain-containing protein  27.8 
 
 		 267 aa  77  0.0000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.986653  hitchhiker  0.00213721 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44454  predicted protein  26.49 
 
 		 447 aa  77  0.0000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0308  beta-lactamase domain-containing protein  26.82 
 
 		 284 aa  76.3  0.0000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000646424  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2078  beta-lactamase domain-containing protein  26.12 
 
 		 279 aa  75.5  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3104  beta-lactamase domain protein  26.07 
 
 		 265 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000364883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1430  Beta-lactamase-like  24.92 
 
 		 280 aa  74.7  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000186428  normal  0.102633 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1602  hypothetical protein  25.5 
 
 		 260 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.737502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0023  metallo-beta-lactamase superfamily protein  25.26 
 
 		 281 aa  74.7  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0535  beta-lactamase domain protein  26.19 
 
 		 262 aa  74.7  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0312  beta-lactamase domain-containing protein  25.94 
 
 		 260 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.688716  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1375  beta-lactamase domain-containing protein  24.07 
 
 		 317 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.825748  hitchhiker  0.000507675 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1026  beta-lactamase domain-containing protein  25.21 
 
 		 260 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0891988  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2374  beta-lactamase domain-containing protein  25.1 
 
 		 280 aa  71.6  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.201878  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0446  beta-lactamase domain-containing protein  24.5 
 
 		 278 aa  70.9  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000263498  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1129  beta-lactamase domain-containing protein  24 
 
 		 272 aa  70.9  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000396645  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0397  metallo-beta-lactamase family protein  27.37 
 
 		 276 aa  69.7  0.00000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.257188  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1747  beta-lactamase domain protein  27.17 
 
 		 275 aa  69.3  0.00000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0149  hypothetical protein  25.85 
 
 		 282 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2194  beta-lactamase domain-containing protein  26.97 
 
 		 279 aa  69.3  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4225  beta-lactamase domain-containing protein  26.27 
 
 		 276 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.150926  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1912  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  26.67 
 
 		 268 aa  67.4  0.0000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.385619  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1236  beta-lactamase domain-containing protein  25.38 
 
 		 275 aa  67  0.0000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1430  beta-lactamase domain protein  29.77 
 
 		 276 aa  66.2  0.0000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.394554  normal  0.142096 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1168  metallo-beta-lactamase family protein  24.59 
 
 		 276 aa  65.9  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.148902  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2186  beta-lactamase domain-containing protein  24.2 
 
 		 281 aa  65.9  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0970  beta-lactamase domain-containing protein  22.45 
 
 		 228 aa  65.5  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000889609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0773  beta-lactamase domain protein  22.57 
 
 		 237 aa  65.9  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1455  hypothetical protein  22.36 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0495131  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0500  beta-lactamase domain protein  27.44 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.977246  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1391  beta-lactamase domain-containing protein  25.1 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00324967  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0999  metallo-beta-lactamase family protein  24.26 
 
 		 276 aa  63.5  0.000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0149338  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1945  beta-lactamase domain-containing protein  24.78 
 
 		 278 aa  62.8  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3463  beta-lactamase domain protein  25.47 
 
 		 276 aa  62.8  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00409832  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10608  metallo-beta-lactamase superfamily protein (AFU_orthologue; AFUA_3G07630)  26.67 
 
 		 212 aa  61.6  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1227  beta-lactamase domain-containing protein  26.36 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1890  beta-lactamase domain-containing protein  24.4 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3320  beta-lactamase domain-containing protein  25.37 
 
 		 277 aa  59.7  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0328164  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1271  beta-lactamase domain-containing protein  34.52 
 
 		 272 aa  57  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1707  beta-lactamase domain protein  25.43 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.078929 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1747  hypothetical protein  24.18 
 
 		 271 aa  56.2  0.0000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0791  beta-lactamase domain-containing protein  22.73 
 
 		 330 aa  53.5  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00778966  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1937  beta-lactamase domain-containing protein  48.98 
 
 		 212 aa  52.4  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1077  metallo-beta-lactamase superfamily protein  30.49 
 
 		 220 aa  48.1  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2136  metallo-beta-lactamase family protein  33.33 
 
 		 386 aa  47.4  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1818  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily II-like protein  24.91 
 
 		 260 aa  47  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2076  beta-lactamase-like protein  33.75 
 
 		 218 aa  46.6  0.0008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06610  hypothetical protein  35.94 
 
 		 256 aa  45.8  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.211154  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1616  metallo-beta-lactamase family protein  30.59 
 
 		 385 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00374588  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1140  beta-lactamase domain protein  23.27 
 
 		 229 aa  45.8  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.636062  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0648  beta-lactamase domain protein  39.29 
 
 		 259 aa  45.4  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2213  beta-lactamase domain protein  31.48 
 
 		 292 aa  45.1  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.104031  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3468  ComEC/Rec2-related protein  39.29 
 
 		 806 aa  44.7  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183145  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3932  beta-lactamase domain protein  29.63 
 
 		 276 aa  43.9  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0238376 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5688  beta-lactamase-like  43.4 
 
 		 281 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6052  beta-lactamase domain-containing protein  43.4 
 
 		 281 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.825618 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6536  beta-lactamase domain-containing protein  43.4 
 
 		 281 aa  43.5  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123702  normal  0.116325 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5891  beta-lactamase domain-containing protein  45.28 
 
 		 467 aa  43.1  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1774  beta-lactamase domain-containing protein  41.51 
 
 		 221 aa  43.1  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>