106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1569 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1569  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
312 aa  642    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0135813  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1529  beta-lactamase domain protein  67.1 
 
 
310 aa  424  1e-117  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.823422 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0880  beta-lactamase domain-containing protein  66.34 
 
 
322 aa  400  9.999999999999999e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1437  beta-lactamase domain protein  52.6 
 
 
304 aa  315  8e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.256229  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1960  beta-lactamase-like  44.92 
 
 
312 aa  271  8.000000000000001e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2897  beta-lactamase domain-containing protein  43.91 
 
 
327 aa  239  4e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0561  beta-lactamase domain-containing protein  37.79 
 
 
294 aa  169  4e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.624713  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1747  beta-lactamase domain protein  38.4 
 
 
275 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7304  beta-lactamase domain protein  34.47 
 
 
403 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1155  beta-lactamase domain-containing protein  33.67 
 
 
282 aa  149  5e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0141595  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0072  beta-lactamase-like protein  35.37 
 
 
347 aa  149  8e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7499  beta-lactamase domain protein  33.67 
 
 
356 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5036  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase  33.33 
 
 
409 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.29289  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1793  beta-lactamase domain protein  37.6 
 
 
274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000988324  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4302  beta-lactamase domain protein  32.26 
 
 
372 aa  146  3e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.852512  normal  0.0730193 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1434  beta-lactamase domain-containing protein  34.21 
 
 
276 aa  146  5e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3934  beta-lactamase domain-containing protein  31.96 
 
 
372 aa  145  9e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  0.104471 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0186  beta-lactamase domain-containing protein  33.67 
 
 
403 aa  145  9e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.69512  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0782  beta-lactamase domain protein  32.02 
 
 
380 aa  145  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0662639 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0397  metallo-beta-lactamase family protein  35.37 
 
 
276 aa  142  7e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.257188  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0924  beta-lactamase-like protein  33.82 
 
 
276 aa  140  3e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.425794  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1064  beta-lactamase domain protein  31.75 
 
 
372 aa  137  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.393014  normal  0.0622516 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3123  Beta-lactamase-like  34.15 
 
 
276 aa  135  9e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0249  beta-lactamase domain protein  37.6 
 
 
280 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000647283  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1080  beta-lactamase domain protein  36.14 
 
 
284 aa  132  7.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000140431  normal  0.247329 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18400  beta-lactamase domain protein  31.87 
 
 
278 aa  132  7.999999999999999e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.03744e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2078  beta-lactamase domain-containing protein  34.08 
 
 
279 aa  132  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1952  beta-lactamase domain-containing protein  34.55 
 
 
304 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0308  beta-lactamase domain-containing protein  35.69 
 
 
284 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000646424  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2299  beta-lactamase domain protein  35.13 
 
 
279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1589  beta-lactamase superfamily hydrolase  31.92 
 
 
278 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5934  beta-lactamase domain-containing protein  29.91 
 
 
372 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.87219 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4116  beta-lactamase-like protein  32.63 
 
 
369 aa  129  7.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.712365  normal  0.318917 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1430  Beta-lactamase-like  32.34 
 
 
280 aa  128  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000186428  normal  0.102633 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1391  beta-lactamase domain-containing protein  33.09 
 
 
295 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00324967  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1945  beta-lactamase domain-containing protein  33.21 
 
 
278 aa  125  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44454  predicted protein  32.73 
 
 
447 aa  124  3e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1937  hypothetical protein  37.6 
 
 
280 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.413348  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3320  beta-lactamase domain-containing protein  35.46 
 
 
277 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0328164  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3463  beta-lactamase domain protein  34.62 
 
 
276 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00409832  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2374  beta-lactamase domain-containing protein  33.92 
 
 
280 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.201878  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4225  beta-lactamase domain-containing protein  32.18 
 
 
276 aa  117  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.150926  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0515  beta-lactamase domain-containing protein  30.43 
 
 
284 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0268037  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1765  beta-lactamase domain protein  32.01 
 
 
285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0535  beta-lactamase domain protein  29.51 
 
 
262 aa  112  6e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1912  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  29.56 
 
 
268 aa  112  8.000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.385619  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2125  metallo-beta-lactamase superfamily protein  31.58 
 
 
280 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.539323 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2194  beta-lactamase domain-containing protein  32.71 
 
 
279 aa  108  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0446  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 
267 aa  106  6e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.986653  hitchhiker  0.00213721 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3848  beta-lactamase domain protein  37.55 
 
 
276 aa  106  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.5057  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1375  beta-lactamase domain-containing protein  29.78 
 
 
317 aa  105  8e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.825748  hitchhiker  0.000507675 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3932  beta-lactamase domain protein  36.43 
 
 
276 aa  103  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0238376 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0906  hypothetical protein  29.69 
 
 
285 aa  100  2e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.230913  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1602  hypothetical protein  27.6 
 
 
260 aa  100  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.737502  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1818  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily II-like protein  30.98 
 
 
260 aa  99.8  6e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1707  beta-lactamase domain protein  28.29 
 
 
283 aa  96.7  4e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.078929 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1227  beta-lactamase domain-containing protein  29 
 
 
247 aa  95.9  8e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10608  metallo-beta-lactamase superfamily protein (AFU_orthologue; AFUA_3G07630)  33.33 
 
 
212 aa  95.5  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0026  beta-lactamase domain-containing protein  31.23 
 
 
266 aa  95.5  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.21687 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1026  beta-lactamase domain-containing protein  27.02 
 
 
260 aa  94.4  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0891988  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3162  beta-lactamase domain protein  31.43 
 
 
265 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.20789  normal  0.546421 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0312  beta-lactamase domain-containing protein  27.13 
 
 
260 aa  94.4  3e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.688716  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1129  beta-lactamase domain-containing protein  28.02 
 
 
272 aa  94  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000396645  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3104  beta-lactamase domain protein  31.02 
 
 
265 aa  94  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000364883  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3263  beta-lactamase domain-containing protein  31.71 
 
 
265 aa  92.4  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0656446  normal  0.191577 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3081  beta-lactamase domain protein  31.02 
 
 
265 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000213505  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1747  hypothetical protein  28.57 
 
 
271 aa  91.3  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3145  beta-lactamase domain-containing protein  30.61 
 
 
265 aa  90.1  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.398347 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1430  beta-lactamase domain protein  30.25 
 
 
276 aa  88.6  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.394554  normal  0.142096 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1236  beta-lactamase domain-containing protein  30.32 
 
 
275 aa  87  4e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0975  beta-lactamase domain-containing protein  30.36 
 
 
255 aa  85.9  8e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000479718  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1154  beta-lactamase domain-containing protein  30.36 
 
 
255 aa  85.9  8e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000123031  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1455  hypothetical protein  22.75 
 
 
260 aa  85.5  9e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0495131  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0446  beta-lactamase domain-containing protein  28.46 
 
 
278 aa  82.4  0.000000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000263498  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2186  beta-lactamase domain-containing protein  27.49 
 
 
281 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0500  beta-lactamase domain protein  26.34 
 
 
264 aa  81.3  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.977246  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0023  metallo-beta-lactamase superfamily protein  26.5 
 
 
281 aa  77.8  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0149  hypothetical protein  27.46 
 
 
282 aa  77  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1616  metallo-beta-lactamase family protein  26.34 
 
 
385 aa  76.3  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00374588  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0509  metallo-beta-lactamase family protein  26.75 
 
 
385 aa  75.9  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.16796 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1168  metallo-beta-lactamase family protein  25.38 
 
 
276 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.148902  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0999  metallo-beta-lactamase family protein  25.38 
 
 
276 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0149338  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1271  beta-lactamase domain-containing protein  29.39 
 
 
272 aa  73.9  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1138  hypothetical protein  25.31 
 
 
276 aa  68.9  0.00000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2136  metallo-beta-lactamase family protein  26.77 
 
 
386 aa  68.6  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2459  dihydropteroate synthase  50.82 
 
 
78 aa  65.9  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000366314  normal  0.040304 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0773  beta-lactamase domain protein  24.29 
 
 
237 aa  64.3  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2374  beta-lactamase-like  28.51 
 
 
320 aa  63.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.26413  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3149  metallo-beta-lactamase family protein  26.46 
 
 
391 aa  62.4  0.000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0567281  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1140  beta-lactamase domain protein  25 
 
 
229 aa  62  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.636062  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0918  metallo-beta-lactamase family protein  25.58 
 
 
384 aa  62  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06610  hypothetical protein  24.21 
 
 
256 aa  60.5  0.00000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.211154  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1890  beta-lactamase domain-containing protein  25.51 
 
 
218 aa  59.3  0.00000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0791  beta-lactamase domain-containing protein  24.09 
 
 
330 aa  58.5  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00778966  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3609  metallo-beta-lactamase family protein  22.39 
 
 
391 aa  58.2  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0862663 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0970  beta-lactamase domain-containing protein  25.55 
 
 
228 aa  57.8  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000889609  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1937  beta-lactamase domain-containing protein  26.42 
 
 
212 aa  56.2  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2076  beta-lactamase-like protein  26.02 
 
 
218 aa  55.5  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1077  metallo-beta-lactamase superfamily protein  26.14 
 
 
220 aa  52.4  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1774  beta-lactamase domain-containing protein  29.11 
 
 
221 aa  52.4  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>