64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1616 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0509  metallo-beta-lactamase family protein  89.61 
 
 		 385 aa  738    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.16796 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1616  metallo-beta-lactamase family protein  100 
 
 		 385 aa  802    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00374588  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3149  metallo-beta-lactamase family protein  63.71 
 
 		 391 aa  525  1e-148  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0567281  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2136  metallo-beta-lactamase family protein  63.64 
 
 		 386 aa  515  1.0000000000000001e-145  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3609  metallo-beta-lactamase family protein  60.68 
 
 		 391 aa  503  1e-141  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0862663 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0918  metallo-beta-lactamase family protein  60.47 
 
 		 384 aa  498  1e-140  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1722  metallo-beta-lactamase family protein  56.84 
 
 		 382 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2374  beta-lactamase-like  35.46 
 
 		 320 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.26413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1569  beta-lactamase domain-containing protein  26.34 
 
 		 312 aa  76.3  0.0000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0135813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1529  beta-lactamase domain protein  25.74 
 
 		 310 aa  74.3  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.823422 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0880  beta-lactamase domain-containing protein  27.72 
 
 		 322 aa  72.4  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18400  beta-lactamase domain protein  25.88 
 
 		 278 aa  70.5  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.03744e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1271  beta-lactamase domain-containing protein  28.71 
 
 		 272 aa  69.7  0.00000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2076  beta-lactamase-like protein  25.86 
 
 		 218 aa  69.3  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1437  beta-lactamase domain protein  24.51 
 
 		 304 aa  67.8  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.256229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1077  metallo-beta-lactamase superfamily protein  27.71 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1960  beta-lactamase-like  26.38 
 
 		 312 aa  62.8  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0924  beta-lactamase-like protein  27.48 
 
 		 276 aa  61.6  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.425794  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0561  beta-lactamase domain-containing protein  24.79 
 
 		 294 aa  62  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.624713  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1391  beta-lactamase domain-containing protein  23.74 
 
 		 295 aa  61.6  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00324967  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1793  beta-lactamase domain protein  23.4 
 
 		 274 aa  61.2  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000988324  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0535  beta-lactamase domain protein  25.81 
 
 		 262 aa  58.5  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1890  beta-lactamase domain-containing protein  26.22 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1774  beta-lactamase domain-containing protein  27.03 
 
 		 221 aa  57  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1434  beta-lactamase domain-containing protein  24.29 
 
 		 276 aa  57  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2897  beta-lactamase domain-containing protein  21.92 
 
 		 327 aa  57  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1155  beta-lactamase domain-containing protein  21.51 
 
 		 282 aa  56.2  0.0000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0141595  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3463  beta-lactamase domain protein  21.37 
 
 		 276 aa  51.6  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00409832  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1375  beta-lactamase domain-containing protein  24.7 
 
 		 317 aa  50.8  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.825748  hitchhiker  0.000507675 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0249  beta-lactamase domain protein  25 
 
 		 280 aa  50.4  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000647283  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1818  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily II-like protein  25.38 
 
 		 260 aa  49.7  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0999  metallo-beta-lactamase family protein  27.86 
 
 		 276 aa  49.3  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0149338  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0023  metallo-beta-lactamase superfamily protein  20.77 
 
 		 281 aa  49.3  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0446  beta-lactamase domain-containing protein  23.21 
 
 		 267 aa  48.9  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.986653  hitchhiker  0.00213721 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5036  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase  29.17 
 
 		 409 aa  48.5  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.29289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1168  metallo-beta-lactamase family protein  27.86 
 
 		 276 aa  48.5  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.148902  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0149  hypothetical protein  22.38 
 
 		 282 aa  48.1  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1937  beta-lactamase domain-containing protein  25.52 
 
 		 212 aa  47.8  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1952  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 		 304 aa  47.4  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0906  hypothetical protein  22.17 
 
 		 285 aa  47  0.0006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.230913  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1945  beta-lactamase domain-containing protein  22.13 
 
 		 278 aa  47  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7304  beta-lactamase domain protein  30.95 
 
 		 403 aa  46.2  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1140  beta-lactamase domain protein  25.68 
 
 		 229 aa  45.8  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.636062  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1430  Beta-lactamase-like  23.65 
 
 		 280 aa  46.2  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000186428  normal  0.102633 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0782  beta-lactamase domain protein  30.59 
 
 		 380 aa  45.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0662639 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1747  beta-lactamase domain protein  21.4 
 
 		 275 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2078  beta-lactamase domain-containing protein  19.28 
 
 		 279 aa  45.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3320  beta-lactamase domain-containing protein  24 
 
 		 277 aa  45.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0328164  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1080  beta-lactamase domain protein  21.72 
 
 		 284 aa  45.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000140431  normal  0.247329 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0791  beta-lactamase domain-containing protein  25.81 
 
 		 330 aa  45.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00778966  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0397  metallo-beta-lactamase family protein  23.99 
 
 		 276 aa  45.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.257188  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5934  beta-lactamase domain-containing protein  32.94 
 
 		 372 aa  44.7  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.87219 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1937  hypothetical protein  28.57 
 
 		 280 aa  44.7  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.413348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1064  beta-lactamase domain protein  34.12 
 
 		 372 aa  44.7  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.393014  normal  0.0622516 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1455  hypothetical protein  27.02 
 
 		 260 aa  44.3  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0495131  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0186  beta-lactamase domain-containing protein  30.59 
 
 		 403 aa  44.3  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.69512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7499  beta-lactamase domain protein  29.81 
 
 		 356 aa  43.9  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0019  beta-lactamase-like protein  25.93 
 
 		 813 aa  43.5  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1050  beta-lactamase domain protein  28.74 
 
 		 255 aa  43.5  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2194  beta-lactamase domain-containing protein  24.24 
 
 		 279 aa  43.5  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1707  beta-lactamase domain protein  22.53 
 
 		 283 aa  43.5  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.078929 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3934  beta-lactamase domain-containing protein  34.12 
 
 		 372 aa  43.1  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  0.104471 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4302  beta-lactamase domain protein  34.12 
 
 		 372 aa  43.1  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.852512  normal  0.0730193 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2186  beta-lactamase domain-containing protein  21.74 
 
 		 281 aa  43.1  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>