36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2374 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2374  beta-lactamase-like  100 
 
 		 320 aa  655    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.26413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3149  metallo-beta-lactamase family protein  33.52 
 
 		 391 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0567281  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0918  metallo-beta-lactamase family protein  34.19 
 
 		 384 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1722  metallo-beta-lactamase family protein  35.46 
 
 		 382 aa  227  2e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3609  metallo-beta-lactamase family protein  33.71 
 
 		 391 aa  227  2e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0862663 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2136  metallo-beta-lactamase family protein  32.87 
 
 		 386 aa  226  3e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1616  metallo-beta-lactamase family protein  35.46 
 
 		 385 aa  226  4e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00374588  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0509  metallo-beta-lactamase family protein  34.38 
 
 		 385 aa  222  4.9999999999999996e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.16796 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1890  beta-lactamase domain-containing protein  28.96 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2897  beta-lactamase domain-containing protein  29.69 
 
 		 327 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1569  beta-lactamase domain-containing protein  28.51 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0135813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1129  beta-lactamase domain-containing protein  24.34 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000396645  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1529  beta-lactamase domain protein  26.81 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.823422 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0308  beta-lactamase domain-containing protein  25.57 
 
 		 284 aa  56.6  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000646424  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0880  beta-lactamase domain-containing protein  25.93 
 
 		 322 aa  55.8  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1434  beta-lactamase domain-containing protein  25.81 
 
 		 276 aa  54.7  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0791  beta-lactamase domain-containing protein  25.67 
 
 		 330 aa  53.9  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00778966  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0773  beta-lactamase domain protein  25.24 
 
 		 237 aa  53.1  0.000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1391  beta-lactamase domain-containing protein  28.63 
 
 		 295 aa  52  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00324967  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18400  beta-lactamase domain protein  26.5 
 
 		 278 aa  52.4  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.03744e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1937  beta-lactamase domain-containing protein  27.17 
 
 		 212 aa  51.6  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0561  beta-lactamase domain-containing protein  27.96 
 
 		 294 aa  51.6  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.624713  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1437  beta-lactamase domain protein  24.51 
 
 		 304 aa  51.6  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.256229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2076  beta-lactamase-like protein  26.24 
 
 		 218 aa  50.4  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02038  beta-lactamase domain protein  25 
 
 		 454 aa  50.4  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1271  beta-lactamase domain-containing protein  25.75 
 
 		 272 aa  49.7  0.00006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1774  beta-lactamase domain-containing protein  28.49 
 
 		 221 aa  49.3  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1077  metallo-beta-lactamase superfamily protein  27.03 
 
 		 220 aa  46.2  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1080  beta-lactamase domain protein  24.23 
 
 		 284 aa  45.8  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000140431  normal  0.247329 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1793  beta-lactamase domain protein  28.5 
 
 		 274 aa  45.4  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000988324  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1155  beta-lactamase domain-containing protein  29.63 
 
 		 282 aa  45.4  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0141595  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1937  hypothetical protein  24.22 
 
 		 280 aa  44.7  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.413348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2782  beta-lactamase domain protein  36.92 
 
 		 258 aa  43.9  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.492368 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0446  beta-lactamase domain-containing protein  22.63 
 
 		 267 aa  44.3  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.986653  hitchhiker  0.00213721 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2916  beta-lactamase-like protein  34.44 
 
 		 239 aa  42.7  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1140  beta-lactamase domain protein  25 
 
 		 229 aa  42.4  0.01  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.636062  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>