72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0509 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0509  metallo-beta-lactamase family protein  100 
 
 		 385 aa  803    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.16796 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1616  metallo-beta-lactamase family protein  89.61 
 
 		 385 aa  738    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00374588  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3149  metallo-beta-lactamase family protein  63.28 
 
 		 391 aa  527  1e-148  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0567281  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2136  metallo-beta-lactamase family protein  64.16 
 
 		 386 aa  522  1e-147  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3609  metallo-beta-lactamase family protein  63.52 
 
 		 391 aa  521  1e-147  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0862663 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0918  metallo-beta-lactamase family protein  62.63 
 
 		 384 aa  513  1e-144  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1722  metallo-beta-lactamase family protein  57.11 
 
 		 382 aa  473  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2374  beta-lactamase-like  34.38 
 
 		 320 aa  222  7e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.26413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2076  beta-lactamase-like protein  29.74 
 
 		 218 aa  80.9  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1569  beta-lactamase domain-containing protein  26.75 
 
 		 312 aa  75.9  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0135813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1529  beta-lactamase domain protein  26.1 
 
 		 310 aa  75.9  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.823422 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18400  beta-lactamase domain protein  27.82 
 
 		 278 aa  75.1  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.03744e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1271  beta-lactamase domain-containing protein  29.9 
 
 		 272 aa  73.2  0.000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0880  beta-lactamase domain-containing protein  26.53 
 
 		 322 aa  72  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0924  beta-lactamase-like protein  27.59 
 
 		 276 aa  70.1  0.00000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.425794  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0561  beta-lactamase domain-containing protein  25.1 
 
 		 294 aa  68.9  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.624713  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1391  beta-lactamase domain-containing protein  24.9 
 
 		 295 aa  69.3  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00324967  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1437  beta-lactamase domain protein  24.51 
 
 		 304 aa  68.9  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.256229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1077  metallo-beta-lactamase superfamily protein  30.32 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1890  beta-lactamase domain-containing protein  28.89 
 
 		 218 aa  64.7  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1960  beta-lactamase-like  25.51 
 
 		 312 aa  63.5  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1774  beta-lactamase domain-containing protein  27.83 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1793  beta-lactamase domain protein  24.26 
 
 		 274 aa  63.2  0.000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000988324  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2897  beta-lactamase domain-containing protein  22.55 
 
 		 327 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0446  beta-lactamase domain-containing protein  26.07 
 
 		 267 aa  62  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.986653  hitchhiker  0.00213721 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1155  beta-lactamase domain-containing protein  22.94 
 
 		 282 aa  60.8  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0141595  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0535  beta-lactamase domain protein  25.61 
 
 		 262 aa  57.8  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3463  beta-lactamase domain protein  23.33 
 
 		 276 aa  57  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00409832  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1434  beta-lactamase domain-containing protein  23.97 
 
 		 276 aa  55.8  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0249  beta-lactamase domain protein  26.02 
 
 		 280 aa  54.7  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000647283  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1747  beta-lactamase domain protein  23.36 
 
 		 275 aa  53.5  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3320  beta-lactamase domain-containing protein  24 
 
 		 277 aa  52.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0328164  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1818  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily II-like protein  25.38 
 
 		 260 aa  52.4  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0149  hypothetical protein  22.38 
 
 		 282 aa  52  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1140  beta-lactamase domain protein  23.79 
 
 		 229 aa  51.2  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.636062  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1937  beta-lactamase domain-containing protein  25.52 
 
 		 212 aa  50.8  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0999  metallo-beta-lactamase family protein  27.86 
 
 		 276 aa  51.2  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0149338  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1168  metallo-beta-lactamase family protein  27.86 
 
 		 276 aa  50.4  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.148902  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1945  beta-lactamase domain-containing protein  22.83 
 
 		 278 aa  50.4  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1952  beta-lactamase domain-containing protein  29.09 
 
 		 304 aa  50.4  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0906  hypothetical protein  23.11 
 
 		 285 aa  49.3  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.230913  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1375  beta-lactamase domain-containing protein  25.4 
 
 		 317 aa  48.9  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.825748  hitchhiker  0.000507675 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1937  hypothetical protein  22.34 
 
 		 280 aa  48.5  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.413348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1430  Beta-lactamase-like  22.91 
 
 		 280 aa  48.5  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000186428  normal  0.102633 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1080  beta-lactamase domain protein  24.18 
 
 		 284 aa  47.8  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000140431  normal  0.247329 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1455  hypothetical protein  27.64 
 
 		 260 aa  47.8  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0495131  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0397  metallo-beta-lactamase family protein  23.62 
 
 		 276 aa  47.4  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.257188  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0068  beta-lactamase superfamily hydrolase  30.51 
 
 		 265 aa  47.4  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2078  beta-lactamase domain-containing protein  21.29 
 
 		 279 aa  47.4  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0023  metallo-beta-lactamase superfamily protein  21.85 
 
 		 281 aa  47.4  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5036  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase  28.12 
 
 		 409 aa  47.4  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.29289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2374  beta-lactamase domain-containing protein  26.69 
 
 		 280 aa  46.6  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.201878  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1430  beta-lactamase domain protein  24.29 
 
 		 276 aa  45.8  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.394554  normal  0.142096 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0312  beta-lactamase domain-containing protein  27.02 
 
 		 260 aa  46.2  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.688716  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02038  beta-lactamase domain protein  24.21 
 
 		 454 aa  45.1  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3123  Beta-lactamase-like  23.6 
 
 		 276 aa  45.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0975  beta-lactamase domain-containing protein  26.86 
 
 		 255 aa  44.7  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000479718  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1050  beta-lactamase domain protein  29.89 
 
 		 255 aa  44.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1154  beta-lactamase domain-containing protein  26.86 
 
 		 255 aa  44.7  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000123031  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0970  beta-lactamase domain-containing protein  25.11 
 
 		 228 aa  44.7  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000889609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1747  hypothetical protein  26.09 
 
 		 271 aa  44.3  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0408  hypothetical protein  25.33 
 
 		 254 aa  44.3  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0791  beta-lactamase domain-containing protein  25.57 
 
 		 330 aa  44.3  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00778966  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0446  beta-lactamase domain-containing protein  25.64 
 
 		 278 aa  43.5  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000263498  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7304  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 		 403 aa  43.5  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2194  beta-lactamase domain-containing protein  23 
 
 		 279 aa  43.5  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1602  hypothetical protein  25.79 
 
 		 260 aa  43.5  0.006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.737502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4225  beta-lactamase domain-containing protein  21.34 
 
 		 276 aa  43.5  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.150926  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1908  metallo-beta-lactamase family protein  33.33 
 
 		 258 aa  43.1  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.952512  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5934  beta-lactamase domain-containing protein  31.76 
 
 		 372 aa  43.1  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.87219 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3934  beta-lactamase domain-containing protein  34.12 
 
 		 372 aa  42.7  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  0.104471 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4302  beta-lactamase domain protein  34.12 
 
 		 372 aa  42.7  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.852512  normal  0.0730193 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>