101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0397 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0397  metallo-beta-lactamase family protein  100 
 
 
276 aa  557  1e-158  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.257188  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3123  Beta-lactamase-like  74.64 
 
 
276 aa  426  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4225  beta-lactamase domain-containing protein  67.03 
 
 
276 aa  389  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.150926  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3463  beta-lactamase domain protein  60.87 
 
 
276 aa  361  6e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00409832  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3320  beta-lactamase domain-containing protein  56.32 
 
 
277 aa  317  2e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0328164  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3932  beta-lactamase domain protein  61.59 
 
 
276 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0238376 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3848  beta-lactamase domain protein  61.96 
 
 
276 aa  293  2e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.5057  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2078  beta-lactamase domain-containing protein  46.43 
 
 
279 aa  241  1e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1945  beta-lactamase domain-containing protein  45.99 
 
 
278 aa  230  2e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1793  beta-lactamase domain protein  45.09 
 
 
274 aa  218  6e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000988324  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1155  beta-lactamase domain-containing protein  45.99 
 
 
282 aa  214  9e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0141595  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0924  beta-lactamase-like protein  38.91 
 
 
276 aa  202  4e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.425794  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1434  beta-lactamase domain-containing protein  37.82 
 
 
276 aa  200  3e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1747  beta-lactamase domain protein  39.56 
 
 
275 aa  194  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0308  beta-lactamase domain-containing protein  38.98 
 
 
284 aa  179  4.999999999999999e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000646424  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0249  beta-lactamase domain protein  37.87 
 
 
280 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000647283  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1430  Beta-lactamase-like  38.11 
 
 
280 aa  170  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000186428  normal  0.102633 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1080  beta-lactamase domain protein  37.32 
 
 
284 aa  170  3e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000140431  normal  0.247329 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1937  hypothetical protein  37.01 
 
 
280 aa  163  3e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.413348  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2299  beta-lactamase domain protein  36.36 
 
 
279 aa  162  6e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1589  beta-lactamase superfamily hydrolase  36.59 
 
 
278 aa  161  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1952  beta-lactamase domain-containing protein  35.16 
 
 
304 aa  161  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1707  beta-lactamase domain protein  34.78 
 
 
283 aa  149  6e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.078929 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0561  beta-lactamase domain-containing protein  36.75 
 
 
294 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.624713  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1391  beta-lactamase domain-containing protein  36.46 
 
 
295 aa  144  1e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00324967  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1437  beta-lactamase domain protein  37.06 
 
 
304 aa  144  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.256229  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1569  beta-lactamase domain-containing protein  35.37 
 
 
312 aa  142  6e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0135813  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1375  beta-lactamase domain-containing protein  38.02 
 
 
317 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.825748  hitchhiker  0.000507675 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1529  beta-lactamase domain protein  35.93 
 
 
310 aa  138  7.999999999999999e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.823422 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0535  beta-lactamase domain protein  29.72 
 
 
262 aa  137  2e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0906  hypothetical protein  31.69 
 
 
285 aa  137  2e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.230913  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0975  beta-lactamase domain-containing protein  35.4 
 
 
255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000479718  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1154  beta-lactamase domain-containing protein  35.4 
 
 
255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000123031  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1236  beta-lactamase domain-containing protein  39.69 
 
 
275 aa  133  3e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0880  beta-lactamase domain-containing protein  38.1 
 
 
322 aa  132  3.9999999999999996e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1747  hypothetical protein  32.36 
 
 
271 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18400  beta-lactamase domain protein  32.47 
 
 
278 aa  129  5.0000000000000004e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.03744e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2897  beta-lactamase domain-containing protein  35.32 
 
 
327 aa  129  6e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1960  beta-lactamase-like  32.58 
 
 
312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1912  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  31.01 
 
 
268 aa  126  4.0000000000000003e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.385619  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1818  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily II-like protein  34.91 
 
 
260 aa  125  6e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0446  beta-lactamase domain-containing protein  33.69 
 
 
267 aa  124  2e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.986653  hitchhiker  0.00213721 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2125  metallo-beta-lactamase superfamily protein  30.6 
 
 
280 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.539323 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1138  hypothetical protein  28.23 
 
 
276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1430  beta-lactamase domain protein  32.97 
 
 
276 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.394554  normal  0.142096 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2374  beta-lactamase domain-containing protein  30.63 
 
 
280 aa  116  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.201878  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1129  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 
272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000396645  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2194  beta-lactamase domain-containing protein  32.97 
 
 
279 aa  108  6e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1765  beta-lactamase domain protein  29.06 
 
 
285 aa  105  9e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3104  beta-lactamase domain protein  31.15 
 
 
265 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000364883  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0500  beta-lactamase domain protein  27.31 
 
 
264 aa  103  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.977246  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0023  metallo-beta-lactamase superfamily protein  28.57 
 
 
281 aa  102  5e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1602  hypothetical protein  29.07 
 
 
260 aa  102  6e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.737502  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3263  beta-lactamase domain-containing protein  31.54 
 
 
265 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0656446  normal  0.191577 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3081  beta-lactamase domain protein  31.54 
 
 
265 aa  102  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000213505  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3162  beta-lactamase domain protein  31.54 
 
 
265 aa  102  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.20789  normal  0.546421 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0446  beta-lactamase domain-containing protein  30.21 
 
 
278 aa  101  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000263498  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3145  beta-lactamase domain-containing protein  31.54 
 
 
265 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.398347 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2186  beta-lactamase domain-containing protein  28.96 
 
 
281 aa  100  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1271  beta-lactamase domain-containing protein  30.43 
 
 
272 aa  97.4  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0026  beta-lactamase domain-containing protein  30.9 
 
 
266 aa  97.4  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.21687 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0312  beta-lactamase domain-containing protein  26.82 
 
 
260 aa  96.7  4e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.688716  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0515  beta-lactamase domain-containing protein  23.47 
 
 
284 aa  93.6  3e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0268037  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0149  hypothetical protein  27.69 
 
 
282 aa  92.8  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1026  beta-lactamase domain-containing protein  26.44 
 
 
260 aa  92  9e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0891988  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1227  beta-lactamase domain-containing protein  29.92 
 
 
247 aa  89.7  4e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10608  metallo-beta-lactamase superfamily protein (AFU_orthologue; AFUA_3G07630)  32.69 
 
 
212 aa  88.6  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1168  metallo-beta-lactamase family protein  28.47 
 
 
276 aa  87.4  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.148902  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0999  metallo-beta-lactamase family protein  28.47 
 
 
276 aa  87.8  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0149338  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1455  hypothetical protein  26.24 
 
 
260 aa  85.9  6e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0495131  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1890  beta-lactamase domain-containing protein  28.26 
 
 
218 aa  80.1  0.00000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0773  beta-lactamase domain protein  27.54 
 
 
237 aa  78.2  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44454  predicted protein  28.15 
 
 
447 aa  77  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3934  beta-lactamase domain-containing protein  27.24 
 
 
372 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  0.104471 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4302  beta-lactamase domain protein  27.24 
 
 
372 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.852512  normal  0.0730193 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5036  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase  27.7 
 
 
409 aa  74.3  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.29289  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0072  beta-lactamase-like protein  27.87 
 
 
347 aa  73.6  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0186  beta-lactamase domain-containing protein  27.9 
 
 
403 aa  72  0.000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.69512  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1064  beta-lactamase domain protein  26.39 
 
 
372 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.393014  normal  0.0622516 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1937  beta-lactamase domain-containing protein  30.18 
 
 
212 aa  70.5  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1077  metallo-beta-lactamase superfamily protein  27.96 
 
 
220 aa  69.7  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1140  beta-lactamase domain protein  24.19 
 
 
229 aa  70.1  0.00000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.636062  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0782  beta-lactamase domain protein  27.37 
 
 
380 aa  69.7  0.00000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0662639 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7499  beta-lactamase domain protein  27.72 
 
 
356 aa  68.9  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7304  beta-lactamase domain protein  28.26 
 
 
403 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5934  beta-lactamase domain-containing protein  25.55 
 
 
372 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.87219 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1774  beta-lactamase domain-containing protein  27.38 
 
 
221 aa  58.2  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2076  beta-lactamase-like protein  26.09 
 
 
218 aa  57.8  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4116  beta-lactamase-like protein  28.63 
 
 
369 aa  54.7  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.712365  normal  0.318917 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0970  beta-lactamase domain-containing protein  23.11 
 
 
228 aa  50.4  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000889609  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02038  beta-lactamase domain protein  27.97 
 
 
454 aa  50.8  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0509  metallo-beta-lactamase family protein  23.62 
 
 
385 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.16796 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0054  beta-lactamase domain protein  40.74 
 
 
334 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2136  metallo-beta-lactamase family protein  23.81 
 
 
386 aa  46.6  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0918  metallo-beta-lactamase family protein  24.51 
 
 
384 aa  46.6  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0066  beta-lactamase domain protein  40.74 
 
 
334 aa  46.2  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391302  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1616  metallo-beta-lactamase family protein  23.99 
 
 
385 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00374588  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3609  metallo-beta-lactamase family protein  25.2 
 
 
391 aa  43.9  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0862663 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3149  metallo-beta-lactamase family protein  33.33 
 
 
391 aa  42.4  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0567281  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0050  Beta-lactamase-like  38.27 
 
 
334 aa  42.4  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>