36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1722 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1722  metallo-beta-lactamase family protein  100 
 
 
382 aa  795    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0918  metallo-beta-lactamase family protein  65 
 
 
384 aa  548  1e-155  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2136  metallo-beta-lactamase family protein  64.38 
 
 
386 aa  530  1e-149  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3149  metallo-beta-lactamase family protein  64.21 
 
 
391 aa  526  1e-148  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0567281  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3609  metallo-beta-lactamase family protein  61.84 
 
 
391 aa  520  1e-146  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0862663 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0509  metallo-beta-lactamase family protein  57.11 
 
 
385 aa  473  1e-132  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.16796 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1616  metallo-beta-lactamase family protein  56.84 
 
 
385 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00374588  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2374  beta-lactamase-like  35.46 
 
 
320 aa  227  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.26413  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2076  beta-lactamase-like protein  29.74 
 
 
218 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1077  metallo-beta-lactamase superfamily protein  29.73 
 
 
220 aa  63.2  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1437  beta-lactamase domain protein  24.8 
 
 
304 aa  62  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.256229  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1890  beta-lactamase domain-containing protein  28.95 
 
 
218 aa  59.3  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1793  beta-lactamase domain protein  26.16 
 
 
274 aa  58.5  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000988324  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1774  beta-lactamase domain-containing protein  26.06 
 
 
221 aa  53.5  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0924  beta-lactamase-like protein  24.62 
 
 
276 aa  53.5  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.425794  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3320  beta-lactamase domain-containing protein  24.61 
 
 
277 aa  50.8  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0328164  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1569  beta-lactamase domain-containing protein  22.87 
 
 
312 aa  48.9  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0135813  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1945  beta-lactamase domain-containing protein  25.1 
 
 
278 aa  48.9  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2194  beta-lactamase domain-containing protein  25.37 
 
 
279 aa  48.5  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1155  beta-lactamase domain-containing protein  24.89 
 
 
282 aa  48.5  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0141595  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1529  beta-lactamase domain protein  23.39 
 
 
310 aa  48.5  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.823422 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1271  beta-lactamase domain-containing protein  24.58 
 
 
272 aa  47.8  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1455  hypothetical protein  25.1 
 
 
260 aa  47.4  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0495131  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2897  beta-lactamase domain-containing protein  23.68 
 
 
327 aa  47  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1391  beta-lactamase domain-containing protein  23.48 
 
 
295 aa  47.4  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00324967  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18400  beta-lactamase domain protein  23.85 
 
 
278 aa  46.6  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.03744e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0249  beta-lactamase domain protein  24.8 
 
 
280 aa  45.8  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000647283  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3463  beta-lactamase domain protein  23.16 
 
 
276 aa  45.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00409832  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1129  beta-lactamase domain-containing protein  23.45 
 
 
272 aa  44.7  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000396645  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1140  beta-lactamase domain protein  24.5 
 
 
229 aa  44.3  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.636062  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0880  beta-lactamase domain-containing protein  24.08 
 
 
322 aa  44.3  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0308  beta-lactamase domain-containing protein  22.78 
 
 
284 aa  43.9  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000646424  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1960  beta-lactamase-like  24.6 
 
 
312 aa  43.9  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1937  beta-lactamase domain-containing protein  23.15 
 
 
212 aa  43.1  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1080  beta-lactamase domain protein  23.4 
 
 
284 aa  43.1  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000140431  normal  0.247329 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5036  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase  30.95 
 
 
409 aa  43.1  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.29289  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>