103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1437 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1437  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
304 aa  623  1e-177  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.256229  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0880  beta-lactamase domain-containing protein  51.6 
 
 
322 aa  317  2e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1569  beta-lactamase domain-containing protein  52.6 
 
 
312 aa  315  8e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0135813  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1529  beta-lactamase domain protein  50.97 
 
 
310 aa  315  8e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.823422 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1960  beta-lactamase-like  45.57 
 
 
312 aa  282  5.000000000000001e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2897  beta-lactamase domain-containing protein  38.85 
 
 
327 aa  213  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0561  beta-lactamase domain-containing protein  37.77 
 
 
294 aa  167  2e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.624713  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1747  beta-lactamase domain protein  38.06 
 
 
275 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1793  beta-lactamase domain protein  37.89 
 
 
274 aa  162  7e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000988324  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7499  beta-lactamase domain protein  34.6 
 
 
356 aa  157  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1434  beta-lactamase domain-containing protein  32.99 
 
 
276 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0072  beta-lactamase-like protein  34.64 
 
 
347 aa  154  2e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4116  beta-lactamase-like protein  33.13 
 
 
369 aa  153  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.712365  normal  0.318917 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7304  beta-lactamase domain protein  34.26 
 
 
403 aa  152  7e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0186  beta-lactamase domain-containing protein  32.6 
 
 
403 aa  149  5e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.69512  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5036  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase  32.99 
 
 
409 aa  147  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.29289  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1430  Beta-lactamase-like  36.39 
 
 
280 aa  146  5e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000186428  normal  0.102633 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0397  metallo-beta-lactamase family protein  37.06 
 
 
276 aa  144  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.257188  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1155  beta-lactamase domain-containing protein  34.47 
 
 
282 aa  144  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0141595  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1064  beta-lactamase domain protein  34.27 
 
 
372 aa  144  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.393014  normal  0.0622516 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0924  beta-lactamase-like protein  33.79 
 
 
276 aa  143  4e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.425794  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18400  beta-lactamase domain protein  31.88 
 
 
278 aa  142  5e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.03744e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0782  beta-lactamase domain protein  30.03 
 
 
380 aa  142  7e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0662639 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3123  Beta-lactamase-like  36.36 
 
 
276 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3934  beta-lactamase domain-containing protein  33.1 
 
 
372 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  0.104471 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4302  beta-lactamase domain protein  32.87 
 
 
372 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.852512  normal  0.0730193 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3320  beta-lactamase domain-containing protein  38.14 
 
 
277 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0328164  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0308  beta-lactamase domain-containing protein  36.04 
 
 
284 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000646424  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2078  beta-lactamase domain-containing protein  34.15 
 
 
279 aa  136  5e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44454  predicted protein  29.82 
 
 
447 aa  136  5e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5934  beta-lactamase domain-containing protein  30.7 
 
 
372 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.87219 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0249  beta-lactamase domain protein  35.74 
 
 
280 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000647283  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4225  beta-lactamase domain-containing protein  34.47 
 
 
276 aa  132  5e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.150926  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1945  beta-lactamase domain-containing protein  33.22 
 
 
278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3463  beta-lactamase domain protein  35.31 
 
 
276 aa  124  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00409832  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1765  beta-lactamase domain protein  30.77 
 
 
285 aa  123  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1080  beta-lactamase domain protein  35.16 
 
 
284 aa  122  6e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000140431  normal  0.247329 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0515  beta-lactamase domain-containing protein  27.12 
 
 
284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0268037  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0906  hypothetical protein  30.42 
 
 
285 aa  120  3e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.230913  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1236  beta-lactamase domain-containing protein  32.09 
 
 
275 aa  118  9.999999999999999e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1602  hypothetical protein  27.4 
 
 
260 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.737502  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1589  beta-lactamase superfamily hydrolase  33 
 
 
278 aa  117  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1747  hypothetical protein  29.39 
 
 
271 aa  116  5e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0535  beta-lactamase domain protein  29.01 
 
 
262 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2299  beta-lactamase domain protein  34.31 
 
 
279 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1952  beta-lactamase domain-containing protein  32.76 
 
 
304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1391  beta-lactamase domain-containing protein  32.61 
 
 
295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00324967  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3162  beta-lactamase domain protein  30.83 
 
 
265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.20789  normal  0.546421 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3932  beta-lactamase domain protein  35.34 
 
 
276 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0238376 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2125  metallo-beta-lactamase superfamily protein  30.36 
 
 
280 aa  110  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.539323 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1937  hypothetical protein  32.27 
 
 
280 aa  110  3e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.413348  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3104  beta-lactamase domain protein  30.45 
 
 
265 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000364883  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3081  beta-lactamase domain protein  30.45 
 
 
265 aa  108  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000213505  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2194  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
279 aa  108  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3263  beta-lactamase domain-containing protein  30.45 
 
 
265 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0656446  normal  0.191577 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1375  beta-lactamase domain-containing protein  30.91 
 
 
317 aa  108  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.825748  hitchhiker  0.000507675 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3145  beta-lactamase domain-containing protein  30.08 
 
 
265 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.398347 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1026  beta-lactamase domain-containing protein  26.28 
 
 
260 aa  106  5e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0891988  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0312  beta-lactamase domain-containing protein  25.55 
 
 
260 aa  104  1e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.688716  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3848  beta-lactamase domain protein  33.57 
 
 
276 aa  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.5057  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1912  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  28.27 
 
 
268 aa  103  3e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.385619  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2374  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 
280 aa  102  9e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.201878  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10608  metallo-beta-lactamase superfamily protein (AFU_orthologue; AFUA_3G07630)  34.32 
 
 
212 aa  101  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1455  hypothetical protein  26.39 
 
 
260 aa  101  2e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0495131  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0446  beta-lactamase domain-containing protein  28.88 
 
 
267 aa  100  4e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.986653  hitchhiker  0.00213721 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0026  beta-lactamase domain-containing protein  27.59 
 
 
266 aa  99.8  5e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.21687 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1430  beta-lactamase domain protein  30.3 
 
 
276 aa  99.4  6e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.394554  normal  0.142096 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1818  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily II-like protein  32.75 
 
 
260 aa  96.3  5e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0500  beta-lactamase domain protein  28.52 
 
 
264 aa  94.4  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.977246  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1227  beta-lactamase domain-containing protein  26.49 
 
 
247 aa  92.8  6e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0999  metallo-beta-lactamase family protein  28.03 
 
 
276 aa  90.1  5e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0149338  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0446  beta-lactamase domain-containing protein  26.55 
 
 
278 aa  90.1  5e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000263498  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1168  metallo-beta-lactamase family protein  27.27 
 
 
276 aa  87.8  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.148902  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1138  hypothetical protein  26.47 
 
 
276 aa  85.9  8e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0975  beta-lactamase domain-containing protein  31.2 
 
 
255 aa  85.1  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000479718  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1154  beta-lactamase domain-containing protein  31.2 
 
 
255 aa  85.1  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000123031  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0023  metallo-beta-lactamase superfamily protein  27.24 
 
 
281 aa  85.1  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1129  beta-lactamase domain-containing protein  25.9 
 
 
272 aa  84.3  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000396645  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1707  beta-lactamase domain protein  29.25 
 
 
283 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.078929 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1271  beta-lactamase domain-containing protein  26.88 
 
 
272 aa  77.4  0.0000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2186  beta-lactamase domain-containing protein  26.71 
 
 
281 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0149  hypothetical protein  24.22 
 
 
282 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3149  metallo-beta-lactamase family protein  26.77 
 
 
391 aa  71.6  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0567281  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3609  metallo-beta-lactamase family protein  25.77 
 
 
391 aa  69.3  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0862663 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0509  metallo-beta-lactamase family protein  24.51 
 
 
385 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.16796 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2459  dihydropteroate synthase  50.88 
 
 
78 aa  67.8  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000366314  normal  0.040304 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1616  metallo-beta-lactamase family protein  24.51 
 
 
385 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00374588  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0791  beta-lactamase domain-containing protein  25.84 
 
 
330 aa  64.3  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00778966  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1722  metallo-beta-lactamase family protein  24.8 
 
 
382 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0918  metallo-beta-lactamase family protein  23.37 
 
 
384 aa  62  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2136  metallo-beta-lactamase family protein  26.07 
 
 
386 aa  60.5  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0970  beta-lactamase domain-containing protein  25.7 
 
 
228 aa  60.1  0.00000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000889609  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1890  beta-lactamase domain-containing protein  24.91 
 
 
218 aa  59.7  0.00000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0773  beta-lactamase domain protein  23.68 
 
 
237 aa  55.1  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06610  hypothetical protein  22.53 
 
 
256 aa  53.9  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.211154  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2076  beta-lactamase-like protein  25.4 
 
 
218 aa  52.4  0.000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1140  beta-lactamase domain protein  20.14 
 
 
229 aa  52.4  0.000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.636062  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1077  metallo-beta-lactamase superfamily protein  27.27 
 
 
220 aa  51.6  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2374  beta-lactamase-like  24.51 
 
 
320 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.26413  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02038  beta-lactamase domain protein  25.23 
 
 
454 aa  49.7  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>