96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3123 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3123  Beta-lactamase-like  100 
 
 		 276 aa  556  1e-158  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0397  metallo-beta-lactamase family protein  74.64 
 
 		 276 aa  426  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.257188  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4225  beta-lactamase domain-containing protein  72.83 
 
 		 276 aa  424  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.150926  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3463  beta-lactamase domain protein  64.13 
 
 		 276 aa  370  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00409832  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3320  beta-lactamase domain-containing protein  57.76 
 
 		 277 aa  321  7e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0328164  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3932  beta-lactamase domain protein  61.59 
 
 		 276 aa  312  3.9999999999999997e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0238376 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3848  beta-lactamase domain protein  62.68 
 
 		 276 aa  301  1e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.5057  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2078  beta-lactamase domain-containing protein  46.07 
 
 		 279 aa  243  3e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1945  beta-lactamase domain-containing protein  44.24 
 
 		 278 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1434  beta-lactamase domain-containing protein  40.36 
 
 		 276 aa  219  3e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0924  beta-lactamase-like protein  41.24 
 
 		 276 aa  208  7e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.425794  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1793  beta-lactamase domain protein  42.18 
 
 		 274 aa  206  2e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000988324  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1747  beta-lactamase domain protein  40.66 
 
 		 275 aa  203  2e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1155  beta-lactamase domain-containing protein  42.34 
 
 		 282 aa  195  8.000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0141595  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1430  Beta-lactamase-like  41.35 
 
 		 280 aa  184  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000186428  normal  0.102633 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1080  beta-lactamase domain protein  37.68 
 
 		 284 aa  178  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000140431  normal  0.247329 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0249  beta-lactamase domain protein  37.87 
 
 		 280 aa  175  8e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000647283  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1952  beta-lactamase domain-containing protein  35.16 
 
 		 304 aa  172  6.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0308  beta-lactamase domain-containing protein  38.28 
 
 		 284 aa  169  5e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000646424  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1937  hypothetical protein  36.68 
 
 		 280 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.413348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1589  beta-lactamase superfamily hydrolase  36.5 
 
 		 278 aa  163  3e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2299  beta-lactamase domain protein  36.26 
 
 		 279 aa  163  3e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1529  beta-lactamase domain protein  37.5 
 
 		 310 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.823422 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1236  beta-lactamase domain-containing protein  38.19 
 
 		 275 aa  146  5e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0561  beta-lactamase domain-containing protein  37.37 
 
 		 294 aa  145  8.000000000000001e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.624713  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1707  beta-lactamase domain protein  35.87 
 
 		 283 aa  142  4e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.078929 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1437  beta-lactamase domain protein  36.36 
 
 		 304 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.256229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18400  beta-lactamase domain protein  33.21 
 
 		 278 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.03744e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1375  beta-lactamase domain-containing protein  37.8 
 
 		 317 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.825748  hitchhiker  0.000507675 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1818  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily II-like protein  38.18 
 
 		 260 aa  138  8.999999999999999e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2897  beta-lactamase domain-containing protein  35.69 
 
 		 327 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0880  beta-lactamase domain-containing protein  37.74 
 
 		 322 aa  136  3.0000000000000003e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1569  beta-lactamase domain-containing protein  34.15 
 
 		 312 aa  135  7.000000000000001e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0135813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1960  beta-lactamase-like  32.7 
 
 		 312 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0906  hypothetical protein  32.39 
 
 		 285 aa  132  9e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.230913  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1391  beta-lactamase domain-containing protein  33.57 
 
 		 295 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00324967  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0535  beta-lactamase domain protein  30.52 
 
 		 262 aa  128  9.000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1912  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  30.77 
 
 		 268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.385619  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1747  hypothetical protein  31.64 
 
 		 271 aa  126  5e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1138  hypothetical protein  28.4 
 
 		 276 aa  125  9e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1129  beta-lactamase domain-containing protein  29.32 
 
 		 272 aa  123  4e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000396645  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1430  beta-lactamase domain protein  33.09 
 
 		 276 aa  122  5e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.394554  normal  0.142096 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0975  beta-lactamase domain-containing protein  32.85 
 
 		 255 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000479718  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1154  beta-lactamase domain-containing protein  32.85 
 
 		 255 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000123031  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1602  hypothetical protein  30.69 
 
 		 260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.737502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0446  beta-lactamase domain-containing protein  31.07 
 
 		 267 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.986653  hitchhiker  0.00213721 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3104  beta-lactamase domain protein  31.78 
 
 		 265 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000364883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3145  beta-lactamase domain-containing protein  33.08 
 
 		 265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.398347 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3081  beta-lactamase domain protein  33.08 
 
 		 265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000213505  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3263  beta-lactamase domain-containing protein  33.08 
 
 		 265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0656446  normal  0.191577 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2374  beta-lactamase domain-containing protein  30.22 
 
 		 280 aa  113  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.201878  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1026  beta-lactamase domain-containing protein  28.52 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0891988  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0312  beta-lactamase domain-containing protein  28.52 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.688716  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3162  beta-lactamase domain protein  33.08 
 
 		 265 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.20789  normal  0.546421 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2125  metallo-beta-lactamase superfamily protein  29.64 
 
 		 280 aa  112  5e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.539323 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1765  beta-lactamase domain protein  30.11 
 
 		 285 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2186  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 		 281 aa  110  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0515  beta-lactamase domain-containing protein  26.01 
 
 		 284 aa  110  3e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0268037  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0026  beta-lactamase domain-containing protein  33.05 
 
 		 266 aa  108  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.21687 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0500  beta-lactamase domain protein  30.15 
 
 		 264 aa  107  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.977246  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0446  beta-lactamase domain-containing protein  29.18 
 
 		 278 aa  106  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000263498  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2194  beta-lactamase domain-containing protein  32.21 
 
 		 279 aa  104  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0023  metallo-beta-lactamase superfamily protein  27.8 
 
 		 281 aa  102  6e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1455  hypothetical protein  27.03 
 
 		 260 aa  98.2  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0495131  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0149  hypothetical protein  27.21 
 
 		 282 aa  97.4  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1271  beta-lactamase domain-containing protein  28.67 
 
 		 272 aa  96.7  3e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10608  metallo-beta-lactamase superfamily protein (AFU_orthologue; AFUA_3G07630)  35.14 
 
 		 212 aa  87.8  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0773  beta-lactamase domain protein  26.47 
 
 		 237 aa  84.3  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0999  metallo-beta-lactamase family protein  25.89 
 
 		 276 aa  83.6  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0149338  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1890  beta-lactamase domain-containing protein  27.54 
 
 		 218 aa  84  0.000000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1168  metallo-beta-lactamase family protein  25.8 
 
 		 276 aa  82.8  0.000000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.148902  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5036  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase  30.36 
 
 		 409 aa  82.4  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.29289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3934  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 		 372 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  0.104471 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4302  beta-lactamase domain protein  27.27 
 
 		 372 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.852512  normal  0.0730193 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5934  beta-lactamase domain-containing protein  26.14 
 
 		 372 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.87219 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1077  metallo-beta-lactamase superfamily protein  27.17 
 
 		 220 aa  79  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0782  beta-lactamase domain protein  26.84 
 
 		 380 aa  78.6  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0662639 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1227  beta-lactamase domain-containing protein  26.59 
 
 		 247 aa  77.8  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7304  beta-lactamase domain protein  29.41 
 
 		 403 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44454  predicted protein  29.2 
 
 		 447 aa  75.9  0.0000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7499  beta-lactamase domain protein  27.3 
 
 		 356 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1064  beta-lactamase domain protein  25.77 
 
 		 372 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.393014  normal  0.0622516 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0186  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 		 403 aa  72.4  0.000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.69512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2076  beta-lactamase-like protein  26.64 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1937  beta-lactamase domain-containing protein  29.8 
 
 		 212 aa  68.6  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0072  beta-lactamase-like protein  25.7 
 
 		 347 aa  63.9  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1140  beta-lactamase domain protein  23.91 
 
 		 229 aa  62  0.000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.636062  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1774  beta-lactamase domain-containing protein  28.14 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4116  beta-lactamase-like protein  25.79 
 
 		 369 aa  58.9  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.712365  normal  0.318917 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0970  beta-lactamase domain-containing protein  23.86 
 
 		 228 aa  58.5  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000889609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02038  beta-lactamase domain protein  24.84 
 
 		 454 aa  56.2  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0918  metallo-beta-lactamase family protein  23.41 
 
 		 384 aa  47  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2136  metallo-beta-lactamase family protein  24 
 
 		 386 aa  46.6  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3149  metallo-beta-lactamase family protein  33.33 
 
 		 391 aa  45.8  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0567281  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3609  metallo-beta-lactamase family protein  31.11 
 
 		 391 aa  45.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0862663 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0509  metallo-beta-lactamase family protein  23.6 
 
 		 385 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.16796 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>