125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A3162 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A3162  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 265 aa  548  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.20789  normal  0.546421 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3081  beta-lactamase domain protein  99.62 
 
 		 265 aa  545  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000213505  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3263  beta-lactamase domain-containing protein  99.25 
 
 		 265 aa  544  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0656446  normal  0.191577 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3145  beta-lactamase domain-containing protein  98.87 
 
 		 265 aa  540  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.398347 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3104  beta-lactamase domain protein  97.74 
 
 		 265 aa  536  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000364883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0026  beta-lactamase domain-containing protein  68.44 
 
 		 266 aa  397  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.21687 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1765  beta-lactamase domain protein  30.55 
 
 		 285 aa  145  6e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1434  beta-lactamase domain-containing protein  35.34 
 
 		 276 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0308  beta-lactamase domain-containing protein  34.75 
 
 		 284 aa  139  7e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000646424  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2299  beta-lactamase domain protein  35.46 
 
 		 279 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1912  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  30.37 
 
 		 268 aa  131  1.0000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.385619  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2374  beta-lactamase domain-containing protein  31.75 
 
 		 280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.201878  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2125  metallo-beta-lactamase superfamily protein  31.99 
 
 		 280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.539323 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2194  beta-lactamase domain-containing protein  32.22 
 
 		 279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1747  beta-lactamase domain protein  32.18 
 
 		 275 aa  129  6e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1747  hypothetical protein  30.38 
 
 		 271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4225  beta-lactamase domain-containing protein  34.11 
 
 		 276 aa  126  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.150926  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1080  beta-lactamase domain protein  33.46 
 
 		 284 aa  126  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000140431  normal  0.247329 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0249  beta-lactamase domain protein  32.82 
 
 		 280 aa  125  6e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000647283  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2078  beta-lactamase domain-containing protein  32.56 
 
 		 279 aa  124  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1952  beta-lactamase domain-containing protein  34.87 
 
 		 304 aa  123  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1430  beta-lactamase domain protein  32.57 
 
 		 276 aa  122  4e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.394554  normal  0.142096 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1155  beta-lactamase domain-containing protein  33.84 
 
 		 282 aa  122  5e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0141595  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1793  beta-lactamase domain protein  32.17 
 
 		 274 aa  122  9e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000988324  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1430  Beta-lactamase-like  30.54 
 
 		 280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000186428  normal  0.102633 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0535  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 262 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18400  beta-lactamase domain protein  31.23 
 
 		 278 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.03744e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1589  beta-lactamase superfamily hydrolase  30.04 
 
 		 278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1455  hypothetical protein  27.78 
 
 		 260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0495131  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1945  beta-lactamase domain-containing protein  30.65 
 
 		 278 aa  113  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3320  beta-lactamase domain-containing protein  32.21 
 
 		 277 aa  113  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0328164  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3123  Beta-lactamase-like  33.08 
 
 		 276 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0561  beta-lactamase domain-containing protein  30.5 
 
 		 294 aa  112  9e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.624713  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0515  beta-lactamase domain-containing protein  29.04 
 
 		 284 aa  112  9e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0268037  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1437  beta-lactamase domain protein  30.83 
 
 		 304 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.256229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1960  beta-lactamase-like  33.46 
 
 		 312 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0975  beta-lactamase domain-containing protein  33.2 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000479718  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1602  hypothetical protein  26.39 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.737502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1154  beta-lactamase domain-containing protein  33.2 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000123031  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1391  beta-lactamase domain-containing protein  31.78 
 
 		 295 aa  110  3e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00324967  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1026  beta-lactamase domain-containing protein  27.14 
 
 		 260 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0891988  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0924  beta-lactamase-like protein  30.6 
 
 		 276 aa  108  9.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.425794  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1236  beta-lactamase domain-containing protein  32.68 
 
 		 275 aa  107  1e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1129  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 		 272 aa  108  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000396645  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1375  beta-lactamase domain-containing protein  32.08 
 
 		 317 aa  106  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.825748  hitchhiker  0.000507675 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1168  metallo-beta-lactamase family protein  28.12 
 
 		 276 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.148902  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0999  metallo-beta-lactamase family protein  28.22 
 
 		 276 aa  104  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0149338  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1227  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 247 aa  104  2e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0312  beta-lactamase domain-containing protein  26.02 
 
 		 260 aa  103  2e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.688716  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0397  metallo-beta-lactamase family protein  31.54 
 
 		 276 aa  102  8e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.257188  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1529  beta-lactamase domain protein  32.52 
 
 		 310 aa  100  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.823422 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0500  beta-lactamase domain protein  26.74 
 
 		 264 aa  100  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.977246  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1937  hypothetical protein  29.53 
 
 		 280 aa  97.8  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.413348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0880  beta-lactamase domain-containing protein  32.24 
 
 		 322 aa  96.3  5e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0446  beta-lactamase domain-containing protein  29.41 
 
 		 267 aa  96.3  5e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.986653  hitchhiker  0.00213721 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3934  beta-lactamase domain-containing protein  28.1 
 
 		 372 aa  95.5  8e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  0.104471 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3463  beta-lactamase domain protein  30.98 
 
 		 276 aa  95.5  8e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00409832  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4302  beta-lactamase domain protein  28.1 
 
 		 372 aa  95.5  8e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.852512  normal  0.0730193 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1707  beta-lactamase domain protein  30.28 
 
 		 283 aa  95.1  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.078929 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1271  beta-lactamase domain-containing protein  30.89 
 
 		 272 aa  94.7  1e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1569  beta-lactamase domain-containing protein  31.43 
 
 		 312 aa  94.7  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0135813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1818  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily II-like protein  28.16 
 
 		 260 aa  94  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5934  beta-lactamase domain-containing protein  28.52 
 
 		 372 aa  94  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.87219 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0149  hypothetical protein  27.57 
 
 		 282 aa  93.2  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1138  hypothetical protein  28.3 
 
 		 276 aa  92.8  5e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2186  beta-lactamase domain-containing protein  27.87 
 
 		 281 aa  91.7  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0906  hypothetical protein  29.17 
 
 		 285 aa  90.9  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.230913  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1064  beta-lactamase domain protein  28.43 
 
 		 372 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.393014  normal  0.0622516 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2897  beta-lactamase domain-containing protein  29.8 
 
 		 327 aa  89.7  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0446  beta-lactamase domain-containing protein  28.37 
 
 		 278 aa  87.4  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000263498  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7304  beta-lactamase domain protein  28.35 
 
 		 403 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0023  metallo-beta-lactamase superfamily protein  28.69 
 
 		 281 aa  87  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7499  beta-lactamase domain protein  25.78 
 
 		 356 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0186  beta-lactamase domain-containing protein  28.09 
 
 		 403 aa  84  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.69512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0782  beta-lactamase domain protein  27.24 
 
 		 380 aa  81.3  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0662639 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3932  beta-lactamase domain protein  30.23 
 
 		 276 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0238376 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0072  beta-lactamase-like protein  28.3 
 
 		 347 aa  79  0.00000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0773  beta-lactamase domain protein  27.73 
 
 		 237 aa  78.2  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1890  beta-lactamase domain-containing protein  26.64 
 
 		 218 aa  77.8  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3848  beta-lactamase domain protein  30.37 
 
 		 276 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.5057  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4116  beta-lactamase-like protein  27.05 
 
 		 369 aa  75.1  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.712365  normal  0.318917 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2076  beta-lactamase-like protein  26.89 
 
 		 218 aa  73.2  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1140  beta-lactamase domain protein  28.17 
 
 		 229 aa  71.2  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.636062  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5036  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase  25.94 
 
 		 409 aa  70.5  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.29289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1077  metallo-beta-lactamase superfamily protein  27.23 
 
 		 220 aa  64.7  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10608  metallo-beta-lactamase superfamily protein (AFU_orthologue; AFUA_3G07630)  32.77 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0970  beta-lactamase domain-containing protein  26.75 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000889609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1937  beta-lactamase domain-containing protein  25.11 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0791  beta-lactamase domain-containing protein  25.74 
 
 		 330 aa  54.7  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00778966  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1774  beta-lactamase domain-containing protein  27.07 
 
 		 221 aa  52.4  0.000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02038  beta-lactamase domain protein  22.73 
 
 		 454 aa  51.6  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44454  predicted protein  24.23 
 
 		 447 aa  50.1  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3890  zinc metallohydrolase  38.24 
 
 		 317 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.489775  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4159  hypothetical protein  38.24 
 
 		 317 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0991  hypothetical protein  38.24 
 
 		 317 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3882  Zn-dependent hydrolase  38.24 
 
 		 317 aa  48.1  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4245  hypothetical protein  38.24 
 
 		 317 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  35.24 
 
 		 492 aa  46.6  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4206  metallo-beta-lactamase domain-containing protein  36.76 
 
 		 317 aa  47  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0197  beta-lactamase domain-containing protein  38.24 
 
 		 422 aa  46.6  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.904798  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>