103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1765 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1765  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
285 aa  587  1e-167  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2374  beta-lactamase domain-containing protein  51.75 
 
 
280 aa  310  2e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.201878  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2125  metallo-beta-lactamase superfamily protein  52.78 
 
 
280 aa  296  2e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.539323 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2194  beta-lactamase domain-containing protein  48.43 
 
 
279 aa  278  5e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1430  beta-lactamase domain protein  45.61 
 
 
276 aa  246  4e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.394554  normal  0.142096 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1912  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  37.59 
 
 
268 aa  197  2.0000000000000003e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.385619  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1747  hypothetical protein  40.07 
 
 
271 aa  192  8e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1434  beta-lactamase domain-containing protein  32.37 
 
 
276 aa  152  5e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1747  beta-lactamase domain protein  33.96 
 
 
275 aa  150  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1155  beta-lactamase domain-containing protein  31.6 
 
 
282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0141595  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3104  beta-lactamase domain protein  30.55 
 
 
265 aa  146  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000364883  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3081  beta-lactamase domain protein  30.55 
 
 
265 aa  146  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000213505  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3162  beta-lactamase domain protein  30.55 
 
 
265 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.20789  normal  0.546421 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3145  beta-lactamase domain-containing protein  30.55 
 
 
265 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.398347 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3263  beta-lactamase domain-containing protein  30.18 
 
 
265 aa  145  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0656446  normal  0.191577 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1793  beta-lactamase domain protein  34.07 
 
 
274 aa  137  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000988324  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2078  beta-lactamase domain-containing protein  32.14 
 
 
279 aa  135  7.000000000000001e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0026  beta-lactamase domain-containing protein  31.41 
 
 
266 aa  132  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.21687 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0561  beta-lactamase domain-containing protein  32.98 
 
 
294 aa  132  9e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.624713  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1589  beta-lactamase superfamily hydrolase  31.82 
 
 
278 aa  129  8.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1952  beta-lactamase domain-containing protein  31.1 
 
 
304 aa  129  8.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1391  beta-lactamase domain-containing protein  31.8 
 
 
295 aa  128  8.000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00324967  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1430  Beta-lactamase-like  30.15 
 
 
280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000186428  normal  0.102633 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1236  beta-lactamase domain-containing protein  32.83 
 
 
275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18400  beta-lactamase domain protein  29.6 
 
 
278 aa  127  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.03744e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1437  beta-lactamase domain protein  30.77 
 
 
304 aa  123  4e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.256229  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1080  beta-lactamase domain protein  29.35 
 
 
284 aa  122  8e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000140431  normal  0.247329 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0924  beta-lactamase-like protein  29.12 
 
 
276 aa  120  3e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.425794  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0249  beta-lactamase domain protein  29.69 
 
 
280 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000647283  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0880  beta-lactamase domain-containing protein  33.21 
 
 
322 aa  119  6e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0515  beta-lactamase domain-containing protein  27.96 
 
 
284 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0268037  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1529  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
310 aa  116  3e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.823422 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0308  beta-lactamase domain-containing protein  33.58 
 
 
284 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000646424  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1960  beta-lactamase-like  31.02 
 
 
312 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1569  beta-lactamase domain-containing protein  32.01 
 
 
312 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0135813  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3123  Beta-lactamase-like  30.11 
 
 
276 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1945  beta-lactamase domain-containing protein  29.43 
 
 
278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4225  beta-lactamase domain-containing protein  29.56 
 
 
276 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.150926  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1602  hypothetical protein  31.62 
 
 
260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.737502  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0535  beta-lactamase domain protein  30 
 
 
262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1937  hypothetical protein  28.99 
 
 
280 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.413348  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0500  beta-lactamase domain protein  30 
 
 
264 aa  107  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.977246  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2897  beta-lactamase domain-containing protein  32.11 
 
 
327 aa  106  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1818  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily II-like protein  28.77 
 
 
260 aa  106  4e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0397  metallo-beta-lactamase family protein  29.06 
 
 
276 aa  105  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.257188  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0312  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 
260 aa  103  2e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.688716  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2299  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 
279 aa  103  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0906  hypothetical protein  33.86 
 
 
285 aa  102  9e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.230913  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3320  beta-lactamase domain-containing protein  31.25 
 
 
277 aa  101  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0328164  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1026  beta-lactamase domain-containing protein  28.22 
 
 
260 aa  102  1e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0891988  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1707  beta-lactamase domain protein  28.03 
 
 
283 aa  101  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.078929 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0446  beta-lactamase domain-containing protein  29.07 
 
 
267 aa  100  2e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.986653  hitchhiker  0.00213721 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1375  beta-lactamase domain-containing protein  28.15 
 
 
317 aa  98.6  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.825748  hitchhiker  0.000507675 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0149  hypothetical protein  29.35 
 
 
282 aa  97.1  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1455  hypothetical protein  27.97 
 
 
260 aa  97.1  3e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0495131  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0975  beta-lactamase domain-containing protein  30.71 
 
 
255 aa  96.7  4e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000479718  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1154  beta-lactamase domain-containing protein  30.71 
 
 
255 aa  96.7  4e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000123031  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1138  hypothetical protein  28.01 
 
 
276 aa  94.7  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0446  beta-lactamase domain-containing protein  25.96 
 
 
278 aa  95.1  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000263498  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0186  beta-lactamase domain-containing protein  28.41 
 
 
403 aa  93.2  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.69512  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3463  beta-lactamase domain protein  28.37 
 
 
276 aa  93.2  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00409832  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0782  beta-lactamase domain protein  31.15 
 
 
380 aa  92.4  7e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0662639 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1129  beta-lactamase domain-containing protein  28.09 
 
 
272 aa  90.5  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000396645  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7304  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 
403 aa  89  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1168  metallo-beta-lactamase family protein  25.77 
 
 
276 aa  87.8  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.148902  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0999  metallo-beta-lactamase family protein  25.09 
 
 
276 aa  87  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0149338  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3934  beta-lactamase domain-containing protein  28.06 
 
 
372 aa  85.5  8e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  0.104471 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4302  beta-lactamase domain protein  28.06 
 
 
372 aa  85.5  8e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.852512  normal  0.0730193 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7499  beta-lactamase domain protein  26.97 
 
 
356 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1227  beta-lactamase domain-containing protein  31.66 
 
 
247 aa  82.4  0.000000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0072  beta-lactamase-like protein  25.98 
 
 
347 aa  81.6  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4116  beta-lactamase-like protein  26.01 
 
 
369 aa  79.3  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.712365  normal  0.318917 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1064  beta-lactamase domain protein  27.5 
 
 
372 aa  79  0.00000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.393014  normal  0.0622516 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5934  beta-lactamase domain-containing protein  27.44 
 
 
372 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.87219 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0023  metallo-beta-lactamase superfamily protein  25.42 
 
 
281 aa  77.4  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2186  beta-lactamase domain-containing protein  26.21 
 
 
281 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3932  beta-lactamase domain protein  29.8 
 
 
276 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0238376 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44454  predicted protein  25.44 
 
 
447 aa  75.1  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3848  beta-lactamase domain protein  29.92 
 
 
276 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.5057  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1271  beta-lactamase domain-containing protein  25.09 
 
 
272 aa  71.2  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0773  beta-lactamase domain protein  24.62 
 
 
237 aa  71.2  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2076  beta-lactamase-like protein  26.24 
 
 
218 aa  70.1  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0791  beta-lactamase domain-containing protein  26.09 
 
 
330 aa  68.9  0.00000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00778966  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1077  metallo-beta-lactamase superfamily protein  24.56 
 
 
220 aa  66.2  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5036  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase  25 
 
 
409 aa  65.5  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.29289  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1140  beta-lactamase domain protein  27.48 
 
 
229 aa  65.5  0.0000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.636062  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1890  beta-lactamase domain-containing protein  26.97 
 
 
218 aa  64.3  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1937  beta-lactamase domain-containing protein  24.78 
 
 
212 aa  60.1  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10608  metallo-beta-lactamase superfamily protein (AFU_orthologue; AFUA_3G07630)  30 
 
 
212 aa  58.5  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1774  beta-lactamase domain-containing protein  26.29 
 
 
221 aa  56.6  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0970  beta-lactamase domain-containing protein  27.2 
 
 
228 aa  53.1  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000889609  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02038  beta-lactamase domain protein  26.37 
 
 
454 aa  51.6  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2827  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  41.79 
 
 
767 aa  46.6  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0829289 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06610  hypothetical protein  24.26 
 
 
256 aa  44.3  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.211154  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1867  beta-lactamase domain protein  35.94 
 
 
477 aa  44.3  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0121854 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1768  hypothetical protein  36.59 
 
 
763 aa  44.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.44185  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2040  hypothetical protein  40 
 
 
763 aa  43.9  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0415  beta-lactamase domain-containing protein  34.78 
 
 
237 aa  43.1  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1944  Beta-lactamase-like  35.48 
 
 
261 aa  43.1  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2623  metallo-beta-lactamase family protein  36.67 
 
 
451 aa  42.7  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>