57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC06610 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006685  CNC06610  hypothetical protein  100 
 
 
256 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.211154  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10608  metallo-beta-lactamase superfamily protein (AFU_orthologue; AFUA_3G07630)  31.14 
 
 
212 aa  89.4  5e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44454  predicted protein  30.47 
 
 
447 aa  79.7  0.00000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0880  beta-lactamase domain-containing protein  26.92 
 
 
322 aa  75.1  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1960  beta-lactamase-like  25.66 
 
 
312 aa  70.1  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1569  beta-lactamase domain-containing protein  25.29 
 
 
312 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0135813  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18400  beta-lactamase domain protein  24.21 
 
 
278 aa  66.2  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.03744e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1434  beta-lactamase domain-containing protein  27.31 
 
 
276 aa  66.6  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0249  beta-lactamase domain protein  29.55 
 
 
280 aa  65.9  0.0000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000647283  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1529  beta-lactamase domain protein  26.62 
 
 
310 aa  65.9  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.823422 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1747  beta-lactamase domain protein  25.1 
 
 
275 aa  64.3  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0308  beta-lactamase domain-containing protein  27.31 
 
 
284 aa  63.2  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000646424  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1080  beta-lactamase domain protein  24.39 
 
 
284 aa  60.1  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000140431  normal  0.247329 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1437  beta-lactamase domain protein  23.66 
 
 
304 aa  58.9  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.256229  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0446  beta-lactamase domain-containing protein  26.72 
 
 
267 aa  57.8  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.986653  hitchhiker  0.00213721 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1227  beta-lactamase domain-containing protein  23.55 
 
 
247 aa  56.6  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2299  beta-lactamase domain protein  28.05 
 
 
279 aa  56.6  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1793  beta-lactamase domain protein  24.81 
 
 
274 aa  56.2  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000988324  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0561  beta-lactamase domain-containing protein  26.1 
 
 
294 aa  54.7  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.624713  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1589  beta-lactamase superfamily hydrolase  28 
 
 
278 aa  55.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7499  beta-lactamase domain protein  23.66 
 
 
356 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2897  beta-lactamase domain-containing protein  25.38 
 
 
327 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0500  beta-lactamase domain protein  25.86 
 
 
264 aa  53.5  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.977246  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0906  hypothetical protein  25.52 
 
 
285 aa  52.8  0.000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.230913  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5036  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase  26.16 
 
 
409 aa  51.6  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.29289  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1430  Beta-lactamase-like  22.57 
 
 
280 aa  51.2  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000186428  normal  0.102633 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0782  beta-lactamase domain protein  27.98 
 
 
380 aa  51.2  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0662639 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1765  beta-lactamase domain protein  24.26 
 
 
285 aa  50.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1236  beta-lactamase domain-containing protein  27.16 
 
 
275 aa  49.3  0.00006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0446  beta-lactamase domain-containing protein  23.95 
 
 
278 aa  48.9  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000263498  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0186  beta-lactamase domain-containing protein  30.53 
 
 
403 aa  48.9  0.00009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.69512  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3463  beta-lactamase domain protein  25 
 
 
276 aa  47  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00409832  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0535  beta-lactamase domain protein  22.17 
 
 
262 aa  47.4  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0970  beta-lactamase domain-containing protein  27.91 
 
 
228 aa  46.6  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000889609  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0026  beta-lactamase domain-containing protein  25.75 
 
 
266 aa  46.6  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.21687 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1952  beta-lactamase domain-containing protein  25.77 
 
 
304 aa  46.2  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0924  beta-lactamase-like protein  22.31 
 
 
276 aa  45.4  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.425794  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2194  beta-lactamase domain-containing protein  23.11 
 
 
279 aa  45.4  0.0009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1818  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily II-like protein  25.85 
 
 
260 aa  45.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1391  beta-lactamase domain-containing protein  26.32 
 
 
295 aa  45.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00324967  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7304  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
403 aa  44.7  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1155  beta-lactamase domain-containing protein  25.1 
 
 
282 aa  44.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0141595  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1945  beta-lactamase domain-containing protein  25.3 
 
 
278 aa  44.3  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0515  beta-lactamase domain-containing protein  28.36 
 
 
284 aa  44.3  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0268037  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0312  beta-lactamase domain-containing protein  30.3 
 
 
260 aa  43.5  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.688716  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1064  beta-lactamase domain protein  28.26 
 
 
372 aa  43.9  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.393014  normal  0.0622516 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2186  beta-lactamase domain-containing protein  24.58 
 
 
281 aa  43.5  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3104  beta-lactamase domain protein  25.5 
 
 
265 aa  43.5  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000364883  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4302  beta-lactamase domain protein  29.35 
 
 
372 aa  42.7  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.852512  normal  0.0730193 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3263  beta-lactamase domain-containing protein  26.69 
 
 
265 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0656446  normal  0.191577 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3934  beta-lactamase domain-containing protein  29.35 
 
 
372 aa  43.1  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  0.104471 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1937  hypothetical protein  28.11 
 
 
280 aa  42.7  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.413348  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4116  beta-lactamase-like protein  26.5 
 
 
369 aa  42.4  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.712365  normal  0.318917 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0149  hypothetical protein  23.98 
 
 
282 aa  42.4  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1602  hypothetical protein  26.67 
 
 
260 aa  42.4  0.008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.737502  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1026  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 
260 aa  42  0.009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0891988  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5934  beta-lactamase domain-containing protein  29.35 
 
 
372 aa  42  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.87219 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>