117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A3104 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A3104  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
265 aa  550  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000364883  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3162  beta-lactamase domain protein  97.74 
 
 
265 aa  536  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.20789  normal  0.546421 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3081  beta-lactamase domain protein  98.11 
 
 
265 aa  540  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000213505  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3263  beta-lactamase domain-containing protein  97.74 
 
 
265 aa  538  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0656446  normal  0.191577 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3145  beta-lactamase domain-containing protein  97.36 
 
 
265 aa  535  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.398347 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0026  beta-lactamase domain-containing protein  67.68 
 
 
266 aa  396  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.21687 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1765  beta-lactamase domain protein  30.55 
 
 
285 aa  146  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0308  beta-lactamase domain-containing protein  34.36 
 
 
284 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000646424  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1434  beta-lactamase domain-containing protein  34.96 
 
 
276 aa  140  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2374  beta-lactamase domain-containing protein  32.6 
 
 
280 aa  139  6e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.201878  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2125  metallo-beta-lactamase superfamily protein  31.99 
 
 
280 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.539323 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1912  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  30.37 
 
 
268 aa  135  5e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.385619  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1080  beta-lactamase domain protein  33.46 
 
 
284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000140431  normal  0.247329 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1747  beta-lactamase domain protein  31.8 
 
 
275 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2299  beta-lactamase domain protein  34.66 
 
 
279 aa  130  3e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1747  hypothetical protein  30.89 
 
 
271 aa  130  3e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2194  beta-lactamase domain-containing protein  31.85 
 
 
279 aa  128  8.000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4225  beta-lactamase domain-containing protein  32.95 
 
 
276 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.150926  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0249  beta-lactamase domain protein  32.55 
 
 
280 aa  127  3e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000647283  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1430  beta-lactamase domain protein  32.18 
 
 
276 aa  125  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.394554  normal  0.142096 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1793  beta-lactamase domain protein  31.82 
 
 
274 aa  123  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000988324  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1155  beta-lactamase domain-containing protein  33.46 
 
 
282 aa  122  8e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0141595  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2078  beta-lactamase domain-containing protein  32.17 
 
 
279 aa  121  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1952  beta-lactamase domain-containing protein  33.73 
 
 
304 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1945  beta-lactamase domain-containing protein  30.65 
 
 
278 aa  117  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0535  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3123  Beta-lactamase-like  31.78 
 
 
276 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0561  beta-lactamase domain-containing protein  30.74 
 
 
294 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.624713  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18400  beta-lactamase domain protein  31.23 
 
 
278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.03744e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1430  Beta-lactamase-like  29.71 
 
 
280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000186428  normal  0.102633 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3320  beta-lactamase domain-containing protein  32.43 
 
 
277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0328164  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0924  beta-lactamase-like protein  30.6 
 
 
276 aa  113  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.425794  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1602  hypothetical protein  26.77 
 
 
260 aa  113  3e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.737502  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1960  beta-lactamase-like  33.46 
 
 
312 aa  112  5e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0975  beta-lactamase domain-containing protein  32.95 
 
 
255 aa  112  6e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000479718  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1154  beta-lactamase domain-containing protein  32.95 
 
 
255 aa  112  6e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000123031  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1129  beta-lactamase domain-containing protein  28.46 
 
 
272 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000396645  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0515  beta-lactamase domain-containing protein  29.78 
 
 
284 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0268037  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1375  beta-lactamase domain-containing protein  32.5 
 
 
317 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.825748  hitchhiker  0.000507675 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1589  beta-lactamase superfamily hydrolase  29.25 
 
 
278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1391  beta-lactamase domain-containing protein  31.78 
 
 
295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00324967  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1455  hypothetical protein  28.46 
 
 
260 aa  110  3e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0495131  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1437  beta-lactamase domain protein  30.45 
 
 
304 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.256229  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1236  beta-lactamase domain-containing protein  32.68 
 
 
275 aa  108  1e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1227  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
247 aa  107  2e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1026  beta-lactamase domain-containing protein  26.77 
 
 
260 aa  105  1e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0891988  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0397  metallo-beta-lactamase family protein  31.15 
 
 
276 aa  104  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.257188  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1529  beta-lactamase domain protein  31.84 
 
 
310 aa  103  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.823422 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1168  metallo-beta-lactamase family protein  28.12 
 
 
276 aa  103  4e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.148902  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0500  beta-lactamase domain protein  25.64 
 
 
264 aa  102  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.977246  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0999  metallo-beta-lactamase family protein  28.22 
 
 
276 aa  102  7e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0149338  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0312  beta-lactamase domain-containing protein  25.65 
 
 
260 aa  100  2e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.688716  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0446  beta-lactamase domain-containing protein  29.78 
 
 
267 aa  100  2e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.986653  hitchhiker  0.00213721 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3934  beta-lactamase domain-containing protein  27.18 
 
 
372 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  0.104471 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4302  beta-lactamase domain protein  27.18 
 
 
372 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.852512  normal  0.0730193 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3463  beta-lactamase domain protein  30.59 
 
 
276 aa  97.8  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00409832  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1271  beta-lactamase domain-containing protein  30.5 
 
 
272 aa  95.9  6e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0906  hypothetical protein  29.43 
 
 
285 aa  95.5  8e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.230913  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0149  hypothetical protein  29.41 
 
 
282 aa  95.1  9e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1818  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily II-like protein  28.16 
 
 
260 aa  95.1  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2897  beta-lactamase domain-containing protein  30.49 
 
 
327 aa  94.7  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1569  beta-lactamase domain-containing protein  31.02 
 
 
312 aa  94  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0135813  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1707  beta-lactamase domain protein  30.28 
 
 
283 aa  94.4  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.078929 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5934  beta-lactamase domain-containing protein  26.76 
 
 
372 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.87219 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1937  hypothetical protein  28.74 
 
 
280 aa  93.6  3e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.413348  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1064  beta-lactamase domain protein  27 
 
 
372 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.393014  normal  0.0622516 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1138  hypothetical protein  29.18 
 
 
276 aa  93.2  4e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2186  beta-lactamase domain-containing protein  27.76 
 
 
281 aa  92  8e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0880  beta-lactamase domain-containing protein  31.87 
 
 
322 aa  91.3  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7304  beta-lactamase domain protein  27.97 
 
 
403 aa  89.4  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0446  beta-lactamase domain-containing protein  28.62 
 
 
278 aa  87.8  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000263498  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0023  metallo-beta-lactamase superfamily protein  28.16 
 
 
281 aa  87.8  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7499  beta-lactamase domain protein  25.78 
 
 
356 aa  87  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0186  beta-lactamase domain-containing protein  27.72 
 
 
403 aa  83.6  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.69512  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3932  beta-lactamase domain protein  30.23 
 
 
276 aa  82  0.000000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0238376 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3848  beta-lactamase domain protein  30.37 
 
 
276 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.5057  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0072  beta-lactamase-like protein  28.68 
 
 
347 aa  77.8  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0773  beta-lactamase domain protein  27.27 
 
 
237 aa  77.8  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1890  beta-lactamase domain-containing protein  26.23 
 
 
218 aa  75.9  0.0000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4116  beta-lactamase-like protein  25.87 
 
 
369 aa  75.9  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.712365  normal  0.318917 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0782  beta-lactamase domain protein  26.07 
 
 
380 aa  75.9  0.0000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0662639 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5036  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase  25.66 
 
 
409 aa  73.6  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.29289  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1140  beta-lactamase domain protein  27.78 
 
 
229 aa  70.1  0.00000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.636062  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2076  beta-lactamase-like protein  25.94 
 
 
218 aa  68.9  0.00000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1077  metallo-beta-lactamase superfamily protein  26.76 
 
 
220 aa  65.1  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0970  beta-lactamase domain-containing protein  27.16 
 
 
228 aa  62  0.000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000889609  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10608  metallo-beta-lactamase superfamily protein (AFU_orthologue; AFUA_3G07630)  31.93 
 
 
212 aa  57.8  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0791  beta-lactamase domain-containing protein  25.74 
 
 
330 aa  55.8  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00778966  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1937  beta-lactamase domain-containing protein  24.66 
 
 
212 aa  55.5  0.0000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1774  beta-lactamase domain-containing protein  27.07 
 
 
221 aa  53.1  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02038  beta-lactamase domain protein  22.45 
 
 
454 aa  51.6  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44454  predicted protein  25 
 
 
447 aa  47.4  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3890  zinc metallohydrolase  36.76 
 
 
317 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.489775  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0991  hypothetical protein  36.76 
 
 
317 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4159  hypothetical protein  36.76 
 
 
317 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3882  Zn-dependent hydrolase  36.76 
 
 
317 aa  46.2  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4206  metallo-beta-lactamase domain-containing protein  35.29 
 
 
317 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3041  hypothetical protein  31.71 
 
 
255 aa  45.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2899  hypothetical protein  31.71 
 
 
255 aa  45.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0626  beta-lactamase domain-containing protein  36.76 
 
 
422 aa  44.7  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>