123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0312 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0312  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
260 aa  522  1e-147  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.688716  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1026  beta-lactamase domain-containing protein  91.92 
 
 
260 aa  494  1e-139  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0891988  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1602  hypothetical protein  85.38 
 
 
260 aa  464  9.999999999999999e-131  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.737502  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1455  hypothetical protein  63.08 
 
 
260 aa  358  5e-98  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0495131  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0515  beta-lactamase domain-containing protein  45.61 
 
 
284 aa  245  6e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0268037  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1155  beta-lactamase domain-containing protein  29.2 
 
 
282 aa  139  3e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0141595  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1818  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily II-like protein  32.95 
 
 
260 aa  138  8.999999999999999e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1793  beta-lactamase domain protein  32.62 
 
 
274 aa  137  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000988324  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0561  beta-lactamase domain-containing protein  31.21 
 
 
294 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.624713  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0924  beta-lactamase-like protein  32.56 
 
 
276 aa  129  4.0000000000000003e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.425794  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1434  beta-lactamase domain-containing protein  29.67 
 
 
276 aa  123  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0535  beta-lactamase domain protein  29.34 
 
 
262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1430  Beta-lactamase-like  29.59 
 
 
280 aa  117  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000186428  normal  0.102633 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2194  beta-lactamase domain-containing protein  30.18 
 
 
279 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1937  hypothetical protein  28.12 
 
 
280 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.413348  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3123  Beta-lactamase-like  28.52 
 
 
276 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1080  beta-lactamase domain protein  28.19 
 
 
284 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000140431  normal  0.247329 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18400  beta-lactamase domain protein  30.91 
 
 
278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.03744e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1129  beta-lactamase domain-containing protein  29.08 
 
 
272 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000396645  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1227  beta-lactamase domain-containing protein  30.2 
 
 
247 aa  112  5e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2125  metallo-beta-lactamase superfamily protein  29.82 
 
 
280 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.539323 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1747  hypothetical protein  28.52 
 
 
271 aa  112  9e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2374  beta-lactamase domain-containing protein  31.27 
 
 
280 aa  111  9e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.201878  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1430  beta-lactamase domain protein  29.56 
 
 
276 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.394554  normal  0.142096 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0308  beta-lactamase domain-containing protein  29.56 
 
 
284 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000646424  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0249  beta-lactamase domain protein  28.24 
 
 
280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000647283  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0500  beta-lactamase domain protein  29.6 
 
 
264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.977246  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1747  beta-lactamase domain protein  27.44 
 
 
275 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4225  beta-lactamase domain-containing protein  26.64 
 
 
276 aa  109  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.150926  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1952  beta-lactamase domain-containing protein  30.2 
 
 
304 aa  108  7.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1912  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  30.28 
 
 
268 aa  108  9.000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.385619  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1589  beta-lactamase superfamily hydrolase  27.8 
 
 
278 aa  108  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1529  beta-lactamase domain protein  28.19 
 
 
310 aa  107  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.823422 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0975  beta-lactamase domain-containing protein  28.46 
 
 
255 aa  105  5e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000479718  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1154  beta-lactamase domain-containing protein  28.46 
 
 
255 aa  105  5e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000123031  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2299  beta-lactamase domain protein  29.64 
 
 
279 aa  105  9e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2078  beta-lactamase domain-containing protein  26.16 
 
 
279 aa  104  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1391  beta-lactamase domain-containing protein  27.51 
 
 
295 aa  104  1e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00324967  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1437  beta-lactamase domain protein  25.55 
 
 
304 aa  104  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.256229  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1945  beta-lactamase domain-containing protein  26.09 
 
 
278 aa  103  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1765  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 
285 aa  103  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3162  beta-lactamase domain protein  26.02 
 
 
265 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.20789  normal  0.546421 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0026  beta-lactamase domain-containing protein  27.89 
 
 
266 aa  103  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.21687 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3081  beta-lactamase domain protein  26.02 
 
 
265 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000213505  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3320  beta-lactamase domain-containing protein  26.69 
 
 
277 aa  102  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0328164  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2897  beta-lactamase domain-containing protein  27.84 
 
 
327 aa  102  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3463  beta-lactamase domain protein  26.45 
 
 
276 aa  102  7e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00409832  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3263  beta-lactamase domain-containing protein  25.65 
 
 
265 aa  102  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0656446  normal  0.191577 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3104  beta-lactamase domain protein  25.65 
 
 
265 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000364883  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3145  beta-lactamase domain-containing protein  25.28 
 
 
265 aa  99.4  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.398347 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0446  beta-lactamase domain-containing protein  28.67 
 
 
267 aa  99  6e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.986653  hitchhiker  0.00213721 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0397  metallo-beta-lactamase family protein  26.82 
 
 
276 aa  96.7  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.257188  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0880  beta-lactamase domain-containing protein  26.88 
 
 
322 aa  94.4  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1569  beta-lactamase domain-containing protein  27.13 
 
 
312 aa  94.4  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0135813  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1271  beta-lactamase domain-containing protein  25.76 
 
 
272 aa  92.4  7e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0186  beta-lactamase domain-containing protein  25.56 
 
 
403 aa  89.4  6e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.69512  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4116  beta-lactamase-like protein  25.88 
 
 
369 aa  86.7  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.712365  normal  0.318917 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1960  beta-lactamase-like  26.3 
 
 
312 aa  86.7  4e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0999  metallo-beta-lactamase family protein  30.34 
 
 
276 aa  86.3  5e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0149338  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1168  metallo-beta-lactamase family protein  30.34 
 
 
276 aa  85.9  6e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.148902  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1236  beta-lactamase domain-containing protein  27.1 
 
 
275 aa  85.9  6e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3932  beta-lactamase domain protein  27.34 
 
 
276 aa  85.9  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0238376 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0149  hypothetical protein  27.82 
 
 
282 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1375  beta-lactamase domain-containing protein  25.73 
 
 
317 aa  84  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.825748  hitchhiker  0.000507675 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3934  beta-lactamase domain-containing protein  26.59 
 
 
372 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  0.104471 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3848  beta-lactamase domain protein  27.9 
 
 
276 aa  84  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.5057  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4302  beta-lactamase domain protein  26.59 
 
 
372 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.852512  normal  0.0730193 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1937  beta-lactamase domain-containing protein  22.56 
 
 
212 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1064  beta-lactamase domain protein  25.4 
 
 
372 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.393014  normal  0.0622516 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1707  beta-lactamase domain protein  25.09 
 
 
283 aa  79.3  0.00000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.078929 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1890  beta-lactamase domain-containing protein  27.61 
 
 
218 aa  79  0.00000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5934  beta-lactamase domain-containing protein  26.29 
 
 
372 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.87219 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0023  metallo-beta-lactamase superfamily protein  27.01 
 
 
281 aa  76.6  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7499  beta-lactamase domain protein  26.58 
 
 
356 aa  75.9  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0072  beta-lactamase-like protein  24.49 
 
 
347 aa  75.1  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0773  beta-lactamase domain protein  25.83 
 
 
237 aa  74.7  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2076  beta-lactamase-like protein  27.13 
 
 
218 aa  73.2  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7304  beta-lactamase domain protein  22.13 
 
 
403 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1138  hypothetical protein  27.64 
 
 
276 aa  72.8  0.000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0782  beta-lactamase domain protein  25.94 
 
 
380 aa  72.4  0.000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0662639 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0906  hypothetical protein  27.04 
 
 
285 aa  72  0.000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.230913  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0446  beta-lactamase domain-containing protein  28.14 
 
 
278 aa  72  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000263498  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5036  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase  21.9 
 
 
409 aa  69.7  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.29289  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1077  metallo-beta-lactamase superfamily protein  25.11 
 
 
220 aa  68.9  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2186  beta-lactamase domain-containing protein  25.82 
 
 
281 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10608  metallo-beta-lactamase superfamily protein (AFU_orthologue; AFUA_3G07630)  34.43 
 
 
212 aa  68.9  0.00000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0791  beta-lactamase domain-containing protein  26.89 
 
 
330 aa  68.2  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00778966  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44454  predicted protein  24.91 
 
 
447 aa  61.2  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0970  beta-lactamase domain-containing protein  25.49 
 
 
228 aa  59.7  0.00000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000889609  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1774  beta-lactamase domain-containing protein  22.54 
 
 
221 aa  56.6  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1140  beta-lactamase domain protein  25.61 
 
 
229 aa  55.5  0.0000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.636062  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2443  hypothetical protein  29.06 
 
 
285 aa  50.1  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19030  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  25.95 
 
 
278 aa  48.1  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.936146  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02038  beta-lactamase domain protein  22.55 
 
 
454 aa  48.1  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3212  metallo-beta-lactamase family protein  31.33 
 
 
275 aa  46.6  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3190  metallo-beta-lactamase family protein  31.33 
 
 
274 aa  46.6  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.418134  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3465  metallo-beta-lactamase family protein  31.33 
 
 
274 aa  46.6  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4682  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3108  beta-lactamase domain-containing protein  32.53 
 
 
276 aa  46.6  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00377228  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0509  metallo-beta-lactamase family protein  27.02 
 
 
385 aa  46.2  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.16796 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1828  metallo-beta-lactamase family protein  31.33 
 
 
274 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.197317  normal  0.1554 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>