293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3374 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3374  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
255 aa  520  1e-147  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285355  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0588  beta-lactamase domain-containing protein  44.05 
 
 
254 aa  185  5e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280528  normal  0.0107204 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1162  beta-lactamase domain-containing protein  43.25 
 
 
257 aa  184  9e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0339  beta-lactamase domain protein  41.46 
 
 
255 aa  170  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00080407  normal  0.0194254 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1229  beta-lactamase-like protein  34.02 
 
 
251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0681  beta-lactamase-like protein  28.34 
 
 
250 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142415  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3142  metal dependent hydrolase  28.91 
 
 
251 aa  100  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.961345  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1910  beta-lactamase domain protein  32.03 
 
 
248 aa  100  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.405245  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0941  beta-lactamase domain-containing protein  34.24 
 
 
251 aa  97.4  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0158649 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2119  beta-lactamase domain protein  29.18 
 
 
256 aa  94.7  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329371  normal  0.846308 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12435  ribonuclease Z  29.56 
 
 
280 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0772968  normal  0.994389 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1016  beta-lactamase domain protein  32.82 
 
 
270 aa  89.7  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3908  ribonuclease Z  28.21 
 
 
300 aa  89  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686381  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2669  ribonuclease Z  28.21 
 
 
286 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0257959  normal  0.795732 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  24.81 
 
 
308 aa  87  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3235  beta-lactamase domain-containing protein  28.29 
 
 
263 aa  87  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00328629  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0859  beta-lactamase domain protein  28.06 
 
 
244 aa  86.3  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160927  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1563  Ribonuclease Z  25.27 
 
 
323 aa  86.3  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3987  beta-lactamase domain-containing protein  32.58 
 
 
257 aa  84.7  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.706134  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1641  Ribonuclease Z  24.19 
 
 
322 aa  83.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  25.76 
 
 
305 aa  82.8  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2205  beta-lactamase domain protein  31.76 
 
 
246 aa  82.4  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  25.93 
 
 
306 aa  82.4  0.000000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1710  beta-lactamase domain-containing protein  33.84 
 
 
235 aa  82  0.000000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.635275  normal  0.117581 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2866  beta-lactamase domain protein  26.1 
 
 
244 aa  81.6  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14031  metallo-beta-lactamase superfamily protein  26.4 
 
 
327 aa  79.7  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.694516  normal  0.113121 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1159  beta-lactamase domain-containing protein  26.1 
 
 
255 aa  79.3  0.00000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0819  beta-lactamase domain-containing protein  33.79 
 
 
256 aa  77.4  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0761  beta-lactamase domain protein  30.53 
 
 
249 aa  77  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2102  ribonuclease Z  24 
 
 
305 aa  77  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0920  RNAse Z  25 
 
 
314 aa  76.3  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0429  ribonuclease Z  24.42 
 
 
318 aa  76.3  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0415  beta-lactamase domain-containing protein  28.22 
 
 
237 aa  76.3  0.0000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17761  metallo-beta-lactamase superfamily protein  25 
 
 
314 aa  76.3  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.529395  normal  0.726567 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3506  ribonuclease Z  30.26 
 
 
285 aa  75.9  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3578  ribonuclease Z  30.26 
 
 
285 aa  75.9  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0515692 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3518  ribonuclease Z  30.26 
 
 
285 aa  75.9  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2670  ribonuclease Z  26.71 
 
 
364 aa  75.5  0.0000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.82455  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0401  ribonuclease Z  26.2 
 
 
305 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1860  beta-lactamase domain protein  26.02 
 
 
297 aa  73.9  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.150092 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0430  ribonuclease Z  25.56 
 
 
318 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2299  beta-lactamase domain-containing protein  27.14 
 
 
337 aa  73.9  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000114028  hitchhiker  0.00742291 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7555  beta-lactamase domain protein  30.43 
 
 
257 aa  73.6  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.731763  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2424  ribonuclease Z  26.28 
 
 
311 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.94801  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0308  beta-lactamase domain-containing protein  30.22 
 
 
262 aa  73.2  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0495  hypothetical protein  32.31 
 
 
235 aa  72.8  0.000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.78198  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0349  ribonuclease Z  27.56 
 
 
307 aa  72.8  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0371  beta-lactamase domain-containing protein  29.85 
 
 
256 aa  72  0.000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.677057  normal  0.0150173 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1316  beta-lactamase domain-containing protein  27.61 
 
 
256 aa  72  0.000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1188  hypothetical protein  25 
 
 
244 aa  72  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6115  beta-lactamase domain protein  28.51 
 
 
243 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2366  hypothetical protein  26.04 
 
 
268 aa  71.2  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2271  beta-lactamase domain protein  28.89 
 
 
243 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1909  beta-lactamase domain-containing protein  28.47 
 
 
259 aa  71.2  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0640394  normal  0.612036 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3410  ribonuclease Z  25.91 
 
 
311 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109803  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02195  ribonuclease Z  26.1 
 
 
305 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1120  metallo-beta-lactamase family protein  23.94 
 
 
244 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1441  beta-lactamase domain protein  25.93 
 
 
330 aa  70.5  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0828256  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2011  ribonuclease Z  30.62 
 
 
393 aa  70.9  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02154  hypothetical protein  26.1 
 
 
305 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.871793  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2414  ribonuclease Z  26.1 
 
 
305 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2276  ribonuclease Z  26.81 
 
 
308 aa  71.2  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0855  beta-lactamase domain protein  25.6 
 
 
327 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.272669  normal  0.116171 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1380  ribonuclease Z  26.1 
 
 
305 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.867836 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1870  ribonuclease Z  24.09 
 
 
309 aa  70.9  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3623  beta-lactamase domain protein  27.31 
 
 
253 aa  70.9  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00997339  normal  0.648861 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8808  beta-lactamase domain protein  28.51 
 
 
243 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1166  metallo-beta-lactamase family protein  24.32 
 
 
244 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4186  metallo-beta-lactamase family protein  24.62 
 
 
244 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.167335  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1000  metal-dependant hydrolase  24.32 
 
 
244 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2497  ribonuclease Z  28.16 
 
 
341 aa  70.1  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.883053  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1656  beta-lactamase domain-containing protein  27.23 
 
 
254 aa  70.5  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.171816 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6632  beta-lactamase domain protein  26.2 
 
 
302 aa  70.5  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1389  ribonuclease BN  26.37 
 
 
311 aa  69.7  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471365  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1016  hypothetical protein  24.32 
 
 
244 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2553  ribonuclease Z  28.16 
 
 
305 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1088  hypothetical protein  24.32 
 
 
244 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2647  ribonuclease Z  26.57 
 
 
305 aa  69.7  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.313305  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2657  ribonuclease Z  28.16 
 
 
305 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2449  ribonuclease Z  28.16 
 
 
305 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2542  ribonuclease Z  28.16 
 
 
341 aa  69.7  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.144505  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1765  beta-lactamase domain-containing protein  31.47 
 
 
235 aa  69.7  0.00000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000290014 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1994  beta-lactamase domain-containing protein  28.44 
 
 
243 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0076  ribonuclease Z  24.92 
 
 
310 aa  69.7  0.00000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.887393  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2565  ribonuclease Z  26.1 
 
 
305 aa  69.7  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.848275  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29130  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  29.39 
 
 
259 aa  69.3  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.837765 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4523  ribonuclease Z  26.07 
 
 
315 aa  69.3  0.00000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0967083  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1247  metallo-beta-lactamase family protein  25 
 
 
244 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1003  metal-dependant hydrolase  23.94 
 
 
244 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1531  beta-lactamase domain-containing protein  32.24 
 
 
235 aa  68.9  0.00000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1949  beta-lactamase domain protein  30.13 
 
 
247 aa  68.6  0.00000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.170959 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2355  beta-lactamase domain protein  24.19 
 
 
319 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.104048  normal  0.172704 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3902  beta-lactamase-like  24.64 
 
 
312 aa  68.6  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0153  ribonuclease Z  23.96 
 
 
310 aa  68.2  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.585164  normal  0.015686 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1749  ribonuclease Z  23.81 
 
 
308 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2758  beta-lactamase domain protein  24.55 
 
 
321 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.332048 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2187  ribonuclease Z  24.08 
 
 
307 aa  67.8  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679584  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1005  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 
244 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1526  ribonuclease Z  24.49 
 
 
318 aa  67  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00811682  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11369  hypothetical protein  27.63 
 
 
273 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0204718  normal  0.45111 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>