295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2366 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2366  hypothetical protein  100 
 
 		 268 aa  552  1e-156  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0384  hypothetical protein  76.21 
 
 		 250 aa  403  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0581145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3866  beta-lactamase domain protein  60.64 
 
 		 249 aa  298  5e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1733  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  55.02 
 
 		 250 aa  286  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1316  beta-lactamase domain-containing protein  56.64 
 
 		 256 aa  285  5e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5649  beta-lactamase domain-containing protein  52.82 
 
 		 248 aa  274  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0871  beta-lactamase-like  54.22 
 
 		 270 aa  271  7e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0941  beta-lactamase domain-containing protein  54 
 
 		 251 aa  270  1e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.504318 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1544  beta-lactamase domain-containing protein  53.57 
 
 		 252 aa  267  1e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.835895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1103  beta-lactamase domain-containing protein  53.01 
 
 		 248 aa  257  2e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.690546 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08360  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  53.51 
 
 		 271 aa  255  5e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0992  beta-lactamase domain-containing protein  55.2 
 
 		 248 aa  249  4e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7555  beta-lactamase domain protein  51.94 
 
 		 257 aa  242  6e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.731763  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29130  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  48.84 
 
 		 259 aa  233  3e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.837765 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2582  hypothetical protein  49.43 
 
 		 265 aa  225  7e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000119552  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25060  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  45.69 
 
 		 267 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2314  hypothetical protein  50.94 
 
 		 265 aa  217  1e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000980644 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1016  beta-lactamase domain protein  44.53 
 
 		 270 aa  212  3.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1324  hypothetical protein  45.8 
 
 		 262 aa  206  4e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.588841  hitchhiker  0.00279452 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0886  hypothetical protein  44.15 
 
 		 267 aa  205  7e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1059  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III  43.46 
 
 		 284 aa  204  8e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.623679  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1359  beta-lactamase domain protein  48.39 
 
 		 246 aa  204  9e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11369  hypothetical protein  43.51 
 
 		 273 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0204718  normal  0.45111 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1012  beta-lactamase domain protein  42.97 
 
 		 256 aa  195  6e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2357  beta-lactamase-like protein  44.92 
 
 		 257 aa  195  8.000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.047895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1970  beta-lactamase domain protein  45.7 
 
 		 253 aa  194  1e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3845  beta-lactamase-like protein  44.53 
 
 		 257 aa  193  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3919  beta-lactamase domain-containing protein  44.53 
 
 		 257 aa  193  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3831  beta-lactamase domain-containing protein  44.53 
 
 		 257 aa  193  3e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.196272 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2736  beta-lactamase domain protein  41.35 
 
 		 265 aa  188  8e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.234606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20060  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  43.63 
 
 		 265 aa  186  3e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.204616  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4288  beta-lactamase-like protein  44.53 
 
 		 257 aa  183  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.34656 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1685  beta-lactamase domain-containing protein  42.86 
 
 		 245 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.0000313983  hitchhiker  0.00000630033 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09930  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  41.2 
 
 		 260 aa  177  1e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.65106  normal  0.185671 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3987  beta-lactamase domain-containing protein  37.85 
 
 		 257 aa  158  7e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.706134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5275  beta-lactamase domain protein  38.34 
 
 		 263 aa  156  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0308  beta-lactamase domain-containing protein  35.86 
 
 		 262 aa  152  5e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0371  beta-lactamase domain-containing protein  36.25 
 
 		 256 aa  152  5e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.677057  normal  0.0150173 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1166  metallo-beta-lactamase family protein  36.55 
 
 		 244 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1016  hypothetical protein  36.14 
 
 		 244 aa  148  9e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1088  hypothetical protein  36.14 
 
 		 244 aa  148  9e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1003  metal-dependant hydrolase  36.14 
 
 		 244 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1247  metallo-beta-lactamase family protein  35.74 
 
 		 244 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0838  beta-lactamase domain-containing protein  34.54 
 
 		 244 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1005  beta-lactamase domain-containing protein  35.08 
 
 		 244 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1000  metal-dependant hydrolase  36.14 
 
 		 244 aa  145  6e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4186  metallo-beta-lactamase family protein  34.27 
 
 		 244 aa  145  6e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.167335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1120  metallo-beta-lactamase family protein  34.68 
 
 		 244 aa  144  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1188  hypothetical protein  34.94 
 
 		 244 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0655  beta-lactamase domain protein  32.54 
 
 		 244 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000122219  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1471  beta-lactamase domain protein  34.69 
 
 		 244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0761  beta-lactamase domain protein  32.41 
 
 		 249 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2205  beta-lactamase domain protein  35.2 
 
 		 246 aa  125  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1909  beta-lactamase domain-containing protein  35.25 
 
 		 259 aa  124  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0640394  normal  0.612036 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2251  beta-lactamase-like  34.78 
 
 		 273 aa  124  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.174345  normal  0.0139422 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2093  beta-lactamase domain-containing protein  32.55 
 
 		 240 aa  119  7e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000753461  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3235  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 263 aa  118  9e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00328629  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0757  beta-lactamase superfamily hydrolase  30.68 
 
 		 250 aa  115  1.0000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00514678  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3155  beta-lactamase-like protein  29.57 
 
 		 244 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166272  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1126  beta-lactamase domain protein  29.66 
 
 		 240 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0125591  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0399  AtsA/ElaC family protein  30.32 
 
 		 258 aa  105  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000165635  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2686  beta-lactamase domain-containing protein  33.91 
 
 		 248 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0241987  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3962  beta-lactamase domain-containing protein  33.09 
 
 		 285 aa  99.4  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.17682  normal  0.145859 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3623  beta-lactamase domain protein  27.24 
 
 		 253 aa  97.4  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00997339  normal  0.648861 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1229  beta-lactamase-like protein  33.47 
 
 		 251 aa  95.1  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1506  beta-lactamase domain-containing protein  32.3 
 
 		 253 aa  93.6  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0681  beta-lactamase-like protein  27.49 
 
 		 250 aa  92  8e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142415  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0441  beta-lactamase domain protein  27.97 
 
 		 259 aa  90.9  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1641  Ribonuclease Z  29.35 
 
 		 322 aa  89.4  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1563  Ribonuclease Z  29.35 
 
 		 323 aa  89  7e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3325  beta-lactamase domain-containing protein  32.74 
 
 		 247 aa  89  7e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.257531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0941  beta-lactamase domain-containing protein  30.77 
 
 		 251 aa  89  8e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158649 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2119  beta-lactamase domain protein  31.62 
 
 		 256 aa  87  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329371  normal  0.846308 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0652  beta-lactamase domain-containing protein  29.63 
 
 		 247 aa  85.5  9e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2866  beta-lactamase domain protein  29.39 
 
 		 244 aa  84  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2921  beta-lactamase domain protein  30.23 
 
 		 251 aa  83.2  0.000000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0261886  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0415  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 237 aa  79.7  0.00000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0859  beta-lactamase domain protein  27.76 
 
 		 244 aa  79.3  0.00000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160927  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37507  predicted protein  29.6 
 
 		 447 aa  78.6  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00696771 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0076  ribonuclease Z  27.96 
 
 		 310 aa  76.3  0.0000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.887393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1334  beta-lactamase domain protein  30.64 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  24.14 
 
 		 305 aa  75.5  0.0000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1949  beta-lactamase domain protein  29 
 
 		 247 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.170959 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1994  beta-lactamase domain-containing protein  29.07 
 
 		 243 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2271  beta-lactamase domain protein  29.07 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0866  beta-lactamase domain protein  29.09 
 
 		 244 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.11444  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3908  ribonuclease Z  30.95 
 
 		 300 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2397  metallo-beta-lactamase  26.98 
 
 		 283 aa  73.6  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4621  Beta-lactamase-like  29.07 
 
 		 244 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0789  beta-lactamase-like  27.75 
 
 		 244 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.514573 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1070  beta-lactamase domain protein  26.26 
 
 		 316 aa  71.2  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1710  beta-lactamase domain-containing protein  31.05 
 
 		 235 aa  71.2  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.635275  normal  0.117581 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1159  beta-lactamase domain-containing protein  31.22 
 
 		 255 aa  70.5  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0754  beta-lactamase-like  25.99 
 
 		 244 aa  69.7  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0374984  normal  0.146735 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2849  beta-lactamase-like  27.18 
 
 		 318 aa  69.3  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  21.05 
 
 		 308 aa  69.3  0.00000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8808  beta-lactamase domain protein  30.51 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1870  ribonuclease Z  25.83 
 
 		 309 aa  68.6  0.00000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1973  ribonuclease Z  24.76 
 
 		 313 aa  68.2  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.32417 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3142  metal dependent hydrolase  28.71 
 
 		 251 aa  67.8  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.961345  normal  0.361163 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>