141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1607 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1607  ribonuclease Z  100 
 
 
331 aa  664    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.664246 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1556  ribonuclease Z  28.08 
 
 
337 aa  107  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.312908  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1232  ribonuclease Z  30.03 
 
 
349 aa  105  8e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.407622  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1038  ribonuclease Z  29.64 
 
 
336 aa  105  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2108  ribonuclease Z  26.86 
 
 
333 aa  105  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000254019  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1403  ribonuclease Z  29.76 
 
 
338 aa  102  9e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.370155 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2736  ribonuclease Z  32.39 
 
 
321 aa  99.4  8e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1175  ribonuclease Z  27.74 
 
 
366 aa  99  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0724  ribonuclease Z  30.5 
 
 
356 aa  99  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0722047  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3742  ribonuclease Z  32.21 
 
 
335 aa  98.6  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.689963  normal  0.0371966 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3675  beta-lactamase domain protein  25.93 
 
 
335 aa  99  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.291829  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1049  ribonuclease Z  30.5 
 
 
335 aa  97.4  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0229  ribonuclease Z  29.35 
 
 
351 aa  96.7  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2162  ribonuclease Z  29.25 
 
 
338 aa  96.3  7e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0166615  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0345  ribonuclease Z  27.74 
 
 
361 aa  95.5  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00109511  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0134  ribonuclease Z  29.17 
 
 
366 aa  94  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.446772  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0188  ribonuclease Z  26.84 
 
 
361 aa  90.9  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000238332  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0245  ribonuclease Z  29.18 
 
 
343 aa  90.1  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000981412  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0020  ribonuclease Z  22.57 
 
 
326 aa  87  4e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1179  ribonuclease Z  27.83 
 
 
318 aa  86.3  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.777962 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1986  ribonuclease Z  26.25 
 
 
365 aa  82.8  0.000000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3084  ribonuclease Z  29.3 
 
 
337 aa  82.4  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0412  ribonuclease Z  24.24 
 
 
360 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.739241  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2276  ribonuclease Z  27.78 
 
 
308 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17761  metallo-beta-lactamase superfamily protein  26.37 
 
 
314 aa  80.9  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.529395  normal  0.726567 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0920  RNAse Z  26.05 
 
 
314 aa  79.3  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3611  ribonuclease Z  28.48 
 
 
314 aa  79.3  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2503  ribonuclease Z  28.48 
 
 
314 aa  79.3  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.638997 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2269  beta-lactamase domain protein  30.42 
 
 
306 aa  78.2  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0412  ribonuclease Z  24.83 
 
 
361 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4543  ribonuclease Z  26.14 
 
 
301 aa  77  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  26.64 
 
 
305 aa  76.6  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1526  ribonuclease Z  29.87 
 
 
318 aa  76.3  0.0000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00811682  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2011  ribonuclease Z  27.97 
 
 
393 aa  75.5  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1749  ribonuclease Z  25 
 
 
308 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02195  ribonuclease Z  27.45 
 
 
305 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1389  ribonuclease BN  27.45 
 
 
311 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471365  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02154  hypothetical protein  27.45 
 
 
305 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.871793  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2414  ribonuclease Z  27.45 
 
 
305 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1380  ribonuclease Z  27.45 
 
 
305 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.867836 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2647  ribonuclease Z  27.45 
 
 
305 aa  73.9  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.313305  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4210  ribonuclease Z  27.1 
 
 
307 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4274  ribonuclease Z  27.1 
 
 
307 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14031  metallo-beta-lactamase superfamily protein  24.68 
 
 
327 aa  73.6  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.694516  normal  0.113121 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3895  ribonuclease Z  27.1 
 
 
307 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3973  ribonuclease Z  26.79 
 
 
307 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3887  ribonuclease Z  27.1 
 
 
307 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4049  ribonuclease Z  27.1 
 
 
307 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4364  ribonuclease Z  27.1 
 
 
307 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4164  ribonuclease Z  27.1 
 
 
307 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2565  ribonuclease Z  27.45 
 
 
305 aa  72.8  0.000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.848275  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1914  ribonuclease Z  27.87 
 
 
313 aa  72  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.552811  normal  0.18224 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0349  ribonuclease Z  27.36 
 
 
307 aa  72.4  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2424  ribonuclease Z  27.45 
 
 
311 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.94801  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4523  ribonuclease Z  29.13 
 
 
315 aa  71.2  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0967083  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0641  ribonuclease Z  25.96 
 
 
321 aa  71.2  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.56652  decreased coverage  0.00172895 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15351  metallo-beta-lactamase superfamily protein  22.15 
 
 
312 aa  71.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0713  ribonuclease Z  23.93 
 
 
314 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0153  ribonuclease Z  23.4 
 
 
310 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.585164  normal  0.015686 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3410  ribonuclease Z  26.8 
 
 
311 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109803  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4250  ribonuclease Z  26.79 
 
 
307 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0985  ribonuclease Z  26.79 
 
 
307 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0417  ribonuclease Z  31.07 
 
 
326 aa  70.5  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0532  ribonuclease Z  27.71 
 
 
319 aa  69.7  0.00000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15101  metallo-beta-lactamase superfamily protein  23.05 
 
 
312 aa  69.7  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1193  ribonuclease Z  23.51 
 
 
309 aa  69.3  0.00000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0659  ribonuclease Z  26.69 
 
 
309 aa  69.3  0.00000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.089983  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05331  beta-lactamase superfamily hydrolase  27.62 
 
 
318 aa  68.9  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0625  ribonuclease Z  24.76 
 
 
304 aa  68.2  0.0000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2403  ribonuclease Z  26.3 
 
 
345 aa  67.8  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.335232  hitchhiker  0.0000263844 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0654  ribonuclease Z  25.66 
 
 
307 aa  68.2  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.296839  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5044  ribonuclease Z  28.12 
 
 
320 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.574405  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1447  RNAse Z  22.76 
 
 
312 aa  67.4  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2102  ribonuclease Z  25.84 
 
 
305 aa  67.4  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1951  ribonuclease Z  24.75 
 
 
308 aa  67  0.0000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00782694  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1210  ribonuclease Z  24.59 
 
 
309 aa  67  0.0000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0927  ribonuclease Z  27.08 
 
 
305 aa  67  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5799  ribonuclease Z  30.36 
 
 
304 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  22.48 
 
 
308 aa  65.5  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15501  metallo-beta-lactamase superfamily protein  21.82 
 
 
312 aa  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0727  ribonuclease Z  22.11 
 
 
322 aa  65.5  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.176511  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3197  ribonuclease Z  29.41 
 
 
328 aa  64.7  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2145  RNAse Z  36.18 
 
 
319 aa  63.5  0.000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.131519 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0015  ribonuclease Z  21.68 
 
 
315 aa  63.2  0.000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.134703  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0647  ribonuclease Z  28.71 
 
 
313 aa  63.2  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.834913  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10313  ribonuclease Z  25 
 
 
301 aa  62.8  0.000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2497  ribonuclease Z  24.59 
 
 
341 aa  62.8  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.883053  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2553  ribonuclease Z  24.59 
 
 
305 aa  62.8  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2449  ribonuclease Z  24.59 
 
 
305 aa  62.8  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2657  ribonuclease Z  24.59 
 
 
305 aa  62.8  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1441  beta-lactamase domain protein  31.34 
 
 
330 aa  62.4  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0828256  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1071  beta-lactamase superfamily hydrolase  25.09 
 
 
325 aa  62  0.00000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.116207  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2672  beta-lactamase domain protein  28.53 
 
 
320 aa  62.4  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.162319 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2542  ribonuclease Z  24.59 
 
 
341 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.144505  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2837  ribonuclease Z  25.42 
 
 
307 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2187  ribonuclease Z  26.47 
 
 
307 aa  60.8  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679584  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2229  ribonuclease Z  32.42 
 
 
324 aa  60.5  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.859333 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0010  ribonuclease Z  26.23 
 
 
304 aa  59.7  0.00000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1365  hypothetical protein  26.21 
 
 
312 aa  59.7  0.00000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000739768  hitchhiker  0.0000000312864 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1070  beta-lactamase domain protein  27.72 
 
 
316 aa  59.3  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>