155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0724 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0724  ribonuclease Z  100 
 
 		 356 aa  719    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0722047  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1049  ribonuclease Z  71.17 
 
 		 335 aa  476  1e-133  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1038  ribonuclease Z  66.97 
 
 		 336 aa  457  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0245  ribonuclease Z  58.98 
 
 		 343 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000981412  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0229  ribonuclease Z  58.43 
 
 		 351 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1232  ribonuclease Z  55.76 
 
 		 349 aa  381  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.407622  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1556  ribonuclease Z  52.71 
 
 		 337 aa  372  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.312908  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2736  ribonuclease Z  53.94 
 
 		 321 aa  335  9e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2162  ribonuclease Z  46.55 
 
 		 338 aa  310  2e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0166615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1403  ribonuclease Z  44.97 
 
 		 338 aa  293  3e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.370155 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1175  ribonuclease Z  44.74 
 
 		 366 aa  287  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2108  ribonuclease Z  42.34 
 
 		 333 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000254019  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3742  ribonuclease Z  45.13 
 
 		 335 aa  278  1e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.689963  normal  0.0371966 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3084  ribonuclease Z  41.81 
 
 		 337 aa  231  2e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0020  ribonuclease Z  29.94 
 
 		 326 aa  176  4e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3675  beta-lactamase domain protein  31.08 
 
 		 335 aa  162  6e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.291829  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0412  ribonuclease Z  29.85 
 
 		 361 aa  155  7e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0345  ribonuclease Z  33.22 
 
 		 361 aa  151  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00109511  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0412  ribonuclease Z  29.85 
 
 		 360 aa  150  4e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.739241  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1716  beta-lactamase superfamily hydrolase  36.26 
 
 		 363 aa  148  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.543775 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0134  ribonuclease Z  34.15 
 
 		 366 aa  147  3e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.446772  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0188  ribonuclease Z  33.03 
 
 		 361 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000238332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1986  ribonuclease Z  28.62 
 
 		 365 aa  139  8.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1607  ribonuclease Z  30.5 
 
 		 331 aa  99  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.664246 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1776  ribonuclease Z  26.04 
 
 		 299 aa  88.6  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0641  ribonuclease Z  29.21 
 
 		 321 aa  85.5  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.56652  decreased coverage  0.00172895 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0659  ribonuclease Z  28.75 
 
 		 309 aa  81.6  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.089983  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  27.64 
 
 		 305 aa  80.9  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0076  ribonuclease Z  28.21 
 
 		 310 aa  81.3  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.887393  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1951  ribonuclease Z  25.58 
 
 		 308 aa  80.1  0.00000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00782694  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0349  ribonuclease Z  29.06 
 
 		 307 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2145  RNAse Z  29.01 
 
 		 319 aa  79.7  0.00000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.131519 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0450  ribonuclease Z  34.87 
 
 		 164 aa  79.7  0.00000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000909133  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2503  ribonuclease Z  27.42 
 
 		 314 aa  79.3  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.638997 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3611  ribonuclease Z  27.42 
 
 		 314 aa  79.3  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2403  ribonuclease Z  28.53 
 
 		 345 aa  79.3  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.335232  hitchhiker  0.0000263844 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0654  ribonuclease Z  27.94 
 
 		 307 aa  79.3  0.00000000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.296839  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2647  ribonuclease Z  26.48 
 
 		 305 aa  78.6  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.313305  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02195  ribonuclease Z  26.48 
 
 		 305 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1389  ribonuclease BN  26.48 
 
 		 311 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471365  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2414  ribonuclease Z  26.48 
 
 		 305 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1380  ribonuclease Z  26.48 
 
 		 305 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.867836 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02154  hypothetical protein  26.48 
 
 		 305 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.871793  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  24.46 
 
 		 308 aa  77  0.0000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2011  ribonuclease Z  28.66 
 
 		 393 aa  77  0.0000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1914  ribonuclease Z  27.24 
 
 		 313 aa  77  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.552811  normal  0.18224 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2565  ribonuclease Z  26.48 
 
 		 305 aa  77  0.0000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.848275  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3410  ribonuclease Z  25.78 
 
 		 311 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17761  metallo-beta-lactamase superfamily protein  26.26 
 
 		 314 aa  75.9  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.529395  normal  0.726567 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2276  ribonuclease Z  27.83 
 
 		 308 aa  75.5  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1526  ribonuclease Z  29.66 
 
 		 318 aa  74.7  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00811682  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4523  ribonuclease Z  26.6 
 
 		 315 aa  74.7  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0967083  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1179  ribonuclease Z  24.56 
 
 		 318 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.777962 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6632  beta-lactamase domain protein  25.91 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0053  ribonuclease Z  26.73 
 
 		 314 aa  73.9  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4250  ribonuclease Z  27.18 
 
 		 307 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_12268  predicted protein  26.65 
 
 		 311 aa  73.6  0.000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.812865  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2424  ribonuclease Z  25.44 
 
 		 311 aa  73.6  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.94801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0920  RNAse Z  25.93 
 
 		 314 aa  73.6  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4210  ribonuclease Z  26.54 
 
 		 307 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4274  ribonuclease Z  26.54 
 
 		 307 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3887  ribonuclease Z  27.18 
 
 		 307 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3895  ribonuclease Z  27.18 
 
 		 307 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1716  ribonuclease Z  26.94 
 
 		 316 aa  72  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0985  ribonuclease Z  27.18 
 
 		 307 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  27.86 
 
 		 306 aa  72.4  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3973  ribonuclease Z  27.18 
 
 		 307 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2187  ribonuclease Z  29.41 
 
 		 307 aa  72  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679584  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2837  ribonuclease Z  27.8 
 
 		 307 aa  72  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4049  ribonuclease Z  26.86 
 
 		 307 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4364  ribonuclease Z  26.86 
 
 		 307 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4164  ribonuclease Z  26.86 
 
 		 307 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14031  metallo-beta-lactamase superfamily protein  26.6 
 
 		 327 aa  70.5  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.694516  normal  0.113121 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1870  ribonuclease Z  27.78 
 
 		 309 aa  69.3  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0010  ribonuclease Z  28.48 
 
 		 304 aa  69.3  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2818  ribonuclease Z  25.78 
 
 		 305 aa  68.9  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.99083 
 
 
-
 
NC_002950  PG0739  ribonuclease Z  24.03 
 
 		 304 aa  68.2  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0532  ribonuclease Z  27.85 
 
 		 319 aa  68.2  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0417  ribonuclease Z  29.28 
 
 		 326 aa  68.2  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2497  ribonuclease Z  27.08 
 
 		 341 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.883053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2449  ribonuclease Z  27.18 
 
 		 305 aa  67.4  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0927  ribonuclease Z  29.05 
 
 		 305 aa  67.4  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2657  ribonuclease Z  27.18 
 
 		 305 aa  67.4  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2553  ribonuclease Z  27.18 
 
 		 305 aa  67.4  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0727  ribonuclease Z  21.91 
 
 		 322 aa  67  0.0000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.176511  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2542  ribonuclease Z  27.18 
 
 		 341 aa  66.6  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.144505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1441  beta-lactamase domain protein  36.02 
 
 		 330 aa  66.2  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0828256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0874  beta-lactamase superfamily hydrolase  28 
 
 		 309 aa  66.2  0.0000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519626 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1475  beta-lactamase superfamily hydrolase  27.8 
 
 		 318 aa  66.2  0.0000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0914  ribonuclease Z  45.88 
 
 		 307 aa  66.2  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1193  ribonuclease Z  24.31 
 
 		 309 aa  64.7  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0857  ribonuclease Z  48.05 
 
 		 309 aa  64.7  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2102  ribonuclease Z  23.49 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05331  beta-lactamase superfamily hydrolase  30.1 
 
 		 318 aa  64.7  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5044  ribonuclease Z  27.19 
 
 		 320 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.574405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1360  ribonuclease Z  23.62 
 
 		 316 aa  62.8  0.000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0966966  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4169  ribonuclease Z  29.7 
 
 		 314 aa  62.8  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.406356  normal  0.0568624 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1866  beta-lactamase domain protein  23.69 
 
 		 303 aa  62.4  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0401  ribonuclease Z  29.63 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1788  ribonuclease Z  24.34 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>