152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2108 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2108  ribonuclease Z  100 
 
 		 333 aa  688    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000254019  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1038  ribonuclease Z  43.41 
 
 		 336 aa  292  5e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0724  ribonuclease Z  42.34 
 
 		 356 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0722047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1232  ribonuclease Z  44.58 
 
 		 349 aa  280  3e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.407622  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1556  ribonuclease Z  43.24 
 
 		 337 aa  279  4e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.312908  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1049  ribonuclease Z  43.24 
 
 		 335 aa  272  6e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0245  ribonuclease Z  40.96 
 
 		 343 aa  256  5e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000981412  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0229  ribonuclease Z  40.48 
 
 		 351 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1403  ribonuclease Z  40.42 
 
 		 338 aa  246  4e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.370155 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2736  ribonuclease Z  41.9 
 
 		 321 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1175  ribonuclease Z  39.34 
 
 		 366 aa  240  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2162  ribonuclease Z  37.54 
 
 		 338 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0166615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3742  ribonuclease Z  40.18 
 
 		 335 aa  239  5e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.689963  normal  0.0371966 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3084  ribonuclease Z  39.88 
 
 		 337 aa  207  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0020  ribonuclease Z  29.57 
 
 		 326 aa  162  7e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3675  beta-lactamase domain protein  26.01 
 
 		 335 aa  147  3e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.291829  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1716  beta-lactamase superfamily hydrolase  30.71 
 
 		 363 aa  134  3e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.543775 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0188  ribonuclease Z  32.01 
 
 		 361 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000238332  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0412  ribonuclease Z  26.65 
 
 		 361 aa  126  5e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0412  ribonuclease Z  26.42 
 
 		 360 aa  125  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.739241  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0134  ribonuclease Z  29.54 
 
 		 366 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.446772  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0345  ribonuclease Z  27.46 
 
 		 361 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00109511  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1986  ribonuclease Z  26.65 
 
 		 365 aa  115  8.999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1607  ribonuclease Z  26.86 
 
 		 331 aa  105  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.664246 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1070  beta-lactamase domain protein  33.52 
 
 		 316 aa  85.1  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  25.57 
 
 		 305 aa  80.5  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1526  ribonuclease Z  29.81 
 
 		 318 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00811682  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2011  ribonuclease Z  25.74 
 
 		 393 aa  77  0.0000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3611  ribonuclease Z  25.94 
 
 		 314 aa  75.9  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2503  ribonuclease Z  25.94 
 
 		 314 aa  75.9  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.638997 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2276  ribonuclease Z  25.79 
 
 		 308 aa  75.1  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1951  ribonuclease Z  24 
 
 		 308 aa  75.1  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00782694  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2187  ribonuclease Z  25.55 
 
 		 307 aa  75.1  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679584  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2145  RNAse Z  25.87 
 
 		 319 aa  74.3  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.131519 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0641  ribonuclease Z  26.28 
 
 		 321 aa  74.3  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.56652  decreased coverage  0.00172895 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0927  ribonuclease Z  26.09 
 
 		 305 aa  73.2  0.000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0349  ribonuclease Z  25.32 
 
 		 307 aa  72.8  0.000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2229  ribonuclease Z  31.6 
 
 		 324 aa  72.8  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.859333 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15501  metallo-beta-lactamase superfamily protein  25.08 
 
 		 312 aa  71.2  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  24.92 
 
 		 306 aa  69.7  0.00000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6632  beta-lactamase domain protein  27.02 
 
 		 302 aa  69.3  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0076  ribonuclease Z  26.52 
 
 		 310 aa  68.9  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.887393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1441  beta-lactamase domain protein  25.42 
 
 		 330 aa  68.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0828256  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0739  ribonuclease Z  24.26 
 
 		 304 aa  67.8  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0659  ribonuclease Z  24.41 
 
 		 309 aa  67.4  0.0000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.089983  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1716  ribonuclease Z  24.18 
 
 		 316 aa  66.6  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4210  ribonuclease Z  25.55 
 
 		 307 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4274  ribonuclease Z  25.55 
 
 		 307 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15351  metallo-beta-lactamase superfamily protein  25.42 
 
 		 312 aa  65.1  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2102  ribonuclease Z  22.57 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3973  ribonuclease Z  24.53 
 
 		 307 aa  63.9  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3895  ribonuclease Z  24.53 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4250  ribonuclease Z  24.84 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0985  ribonuclease Z  24.84 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3887  ribonuclease Z  24.53 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1179  ribonuclease Z  26.65 
 
 		 318 aa  62.8  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.777962 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1210  ribonuclease Z  24.15 
 
 		 309 aa  62.4  0.000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  22.05 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4049  ribonuclease Z  24.53 
 
 		 307 aa  62.4  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4364  ribonuclease Z  24.53 
 
 		 307 aa  62.4  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4164  ribonuclease Z  24.53 
 
 		 307 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2403  ribonuclease Z  26.11 
 
 		 345 aa  61.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.335232  hitchhiker  0.0000263844 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0532  ribonuclease Z  24.64 
 
 		 319 aa  61.6  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15101  metallo-beta-lactamase superfamily protein  23.91 
 
 		 312 aa  61.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1561  ribonuclease Z  24.44 
 
 		 306 aa  61.6  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1592  ribonuclease Z  24.44 
 
 		 306 aa  61.6  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359546  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_12268  predicted protein  25.48 
 
 		 311 aa  60.8  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.812865  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0914  ribonuclease Z  29.38 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16162  predicted protein  25.78 
 
 		 284 aa  60.5  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2067  ribonuclease Z  38.74 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000376833 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1973  ribonuclease Z  22.56 
 
 		 313 aa  60.5  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.32417 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1447  RNAse Z  25.59 
 
 		 312 aa  60.1  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2269  beta-lactamase domain protein  27.93 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1066  AtsA/ElaC family protein  23.47 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.583999  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0450  ribonuclease Z  28.17 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000909133  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0857  ribonuclease Z  39.13 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10313  ribonuclease Z  22.52 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1914  ribonuclease Z  23.49 
 
 		 313 aa  58.5  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.552811  normal  0.18224 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0654  ribonuclease Z  24.12 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.296839  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0647  ribonuclease Z  28.2 
 
 		 313 aa  58.5  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.834913  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5799  ribonuclease Z  27.96 
 
 		 304 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08200  ribonuclease Z  37.11 
 
 		 306 aa  58.9  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.444748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0920  RNAse Z  22.87 
 
 		 314 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17761  metallo-beta-lactamase superfamily protein  22.68 
 
 		 314 aa  57.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.529395  normal  0.726567 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1554  ribonuclease Z  26.02 
 
 		 317 aa  57.8  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0417  ribonuclease Z  26.84 
 
 		 326 aa  57.8  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14031  metallo-beta-lactamase superfamily protein  23.72 
 
 		 327 aa  57.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.694516  normal  0.113121 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2837  ribonuclease Z  24.03 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2497  ribonuclease Z  24.54 
 
 		 341 aa  57  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.883053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2553  ribonuclease Z  24.54 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2449  ribonuclease Z  24.54 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2657  ribonuclease Z  24.54 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02195  ribonuclease Z  23.72 
 
 		 305 aa  56.2  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0010  ribonuclease Z  24.81 
 
 		 304 aa  56.2  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2414  ribonuclease Z  23.72 
 
 		 305 aa  56.2  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02154  hypothetical protein  23.72 
 
 		 305 aa  56.2  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.871793  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1380  ribonuclease Z  23.72 
 
 		 305 aa  56.2  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.867836 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2542  ribonuclease Z  24.54 
 
 		 341 aa  56.2  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.144505  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1389  ribonuclease BN  23.72 
 
 		 311 aa  56.2  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471365  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11850  predicted protein  26.44 
 
 		 285 aa  56.2  0.0000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>