148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1049 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1049  ribonuclease Z  100 
 
 		 335 aa  670    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0724  ribonuclease Z  71.17 
 
 		 356 aa  476  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0722047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1038  ribonuclease Z  65.17 
 
 		 336 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0245  ribonuclease Z  57.66 
 
 		 343 aa  374  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000981412  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0229  ribonuclease Z  57.1 
 
 		 351 aa  373  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1556  ribonuclease Z  49.4 
 
 		 337 aa  349  4e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.312908  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1232  ribonuclease Z  54.85 
 
 		 349 aa  347  2e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.407622  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2736  ribonuclease Z  52.7 
 
 		 321 aa  309  4e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2162  ribonuclease Z  46.27 
 
 		 338 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0166615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1403  ribonuclease Z  44.78 
 
 		 338 aa  280  3e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.370155 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2108  ribonuclease Z  43.24 
 
 		 333 aa  272  6e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000254019  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1175  ribonuclease Z  44.48 
 
 		 366 aa  271  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3742  ribonuclease Z  41.14 
 
 		 335 aa  231  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.689963  normal  0.0371966 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3084  ribonuclease Z  43.45 
 
 		 337 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0020  ribonuclease Z  29.13 
 
 		 326 aa  183  5.0000000000000004e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3675  beta-lactamase domain protein  30.89 
 
 		 335 aa  161  2e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.291829  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0412  ribonuclease Z  32.52 
 
 		 361 aa  150  4e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0412  ribonuclease Z  32.72 
 
 		 360 aa  142  8e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.739241  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1716  beta-lactamase superfamily hydrolase  35.13 
 
 		 363 aa  136  5e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.543775 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0345  ribonuclease Z  31.25 
 
 		 361 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00109511  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0188  ribonuclease Z  30.91 
 
 		 361 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000238332  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0134  ribonuclease Z  30.45 
 
 		 366 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.446772  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1986  ribonuclease Z  28.61 
 
 		 365 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1607  ribonuclease Z  30.5 
 
 		 331 aa  97.4  3e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.664246 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1951  ribonuclease Z  24.44 
 
 		 308 aa  81.3  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00782694  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1914  ribonuclease Z  26.76 
 
 		 313 aa  81.3  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.552811  normal  0.18224 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0641  ribonuclease Z  26.44 
 
 		 321 aa  80.1  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.56652  decreased coverage  0.00172895 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2503  ribonuclease Z  26.03 
 
 		 314 aa  79.3  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.638997 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3611  ribonuclease Z  26.03 
 
 		 314 aa  79.3  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1776  ribonuclease Z  25.46 
 
 		 299 aa  77.8  0.0000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1179  ribonuclease Z  25.53 
 
 		 318 aa  77  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.777962 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2145  RNAse Z  27.89 
 
 		 319 aa  77  0.0000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.131519 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  25.09 
 
 		 308 aa  74.3  0.000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0739  ribonuclease Z  26.8 
 
 		 304 aa  73.6  0.000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0659  ribonuclease Z  26.45 
 
 		 309 aa  73.6  0.000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.089983  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2011  ribonuclease Z  26.89 
 
 		 393 aa  73.2  0.000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2403  ribonuclease Z  26.1 
 
 		 345 aa  72  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.335232  hitchhiker  0.0000263844 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0450  ribonuclease Z  33.33 
 
 		 164 aa  72  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000909133  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1441  beta-lactamase domain protein  35.85 
 
 		 330 aa  71.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0828256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0654  ribonuclease Z  24.21 
 
 		 307 aa  71.6  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.296839  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14031  metallo-beta-lactamase superfamily protein  25.76 
 
 		 327 aa  71.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.694516  normal  0.113121 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0076  ribonuclease Z  27.67 
 
 		 310 aa  71.2  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.887393  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4523  ribonuclease Z  25.08 
 
 		 315 aa  70.5  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0967083  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10313  ribonuclease Z  26 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0010  ribonuclease Z  27.76 
 
 		 304 aa  70.1  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2102  ribonuclease Z  24.37 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17761  metallo-beta-lactamase superfamily protein  25.56 
 
 		 314 aa  67.8  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.529395  normal  0.726567 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  25 
 
 		 306 aa  66.6  0.0000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0920  RNAse Z  24.76 
 
 		 314 aa  66.2  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02195  ribonuclease Z  24.65 
 
 		 305 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1389  ribonuclease BN  24.65 
 
 		 311 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471365  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02154  hypothetical protein  24.65 
 
 		 305 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.871793  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0927  ribonuclease Z  26.37 
 
 		 305 aa  65.9  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6632  beta-lactamase domain protein  23.64 
 
 		 302 aa  65.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2414  ribonuclease Z  24.65 
 
 		 305 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1380  ribonuclease Z  24.65 
 
 		 305 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.867836 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2647  ribonuclease Z  24.65 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.313305  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  23.33 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1554  ribonuclease Z  28.71 
 
 		 317 aa  64.7  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_12268  predicted protein  23.75 
 
 		 311 aa  65.1  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.812865  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2565  ribonuclease Z  24.65 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.848275  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1526  ribonuclease Z  34.66 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00811682  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0874  beta-lactamase superfamily hydrolase  25.58 
 
 		 309 aa  62.8  0.000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519626 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0532  ribonuclease Z  26.69 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0349  ribonuclease Z  27.3 
 
 		 307 aa  62.8  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4250  ribonuclease Z  25 
 
 		 307 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3410  ribonuclease Z  23.96 
 
 		 311 aa  62.8  0.000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0985  ribonuclease Z  25 
 
 		 307 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1716  ribonuclease Z  23.93 
 
 		 316 aa  61.6  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0053  ribonuclease Z  25.71 
 
 		 314 aa  61.2  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15351  metallo-beta-lactamase superfamily protein  22.33 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0727  ribonuclease Z  20.8 
 
 		 322 aa  60.8  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.176511  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4210  ribonuclease Z  25.67 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4049  ribonuclease Z  25.67 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3887  ribonuclease Z  25.67 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3895  ribonuclease Z  26 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4274  ribonuclease Z  25.67 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4364  ribonuclease Z  25.67 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4164  ribonuclease Z  25.67 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2187  ribonuclease Z  25.86 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679584  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2424  ribonuclease Z  23.61 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.94801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2657  ribonuclease Z  24.55 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1070  beta-lactamase domain protein  31.55 
 
 		 316 aa  60.1  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2497  ribonuclease Z  24.55 
 
 		 341 aa  60.1  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.883053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2553  ribonuclease Z  24.55 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2449  ribonuclease Z  24.55 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0782  ribonuclease Z  21.04 
 
 		 319 aa  59.7  0.00000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2672  beta-lactamase domain protein  25.34 
 
 		 320 aa  59.7  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.162319 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2542  ribonuclease Z  24.55 
 
 		 341 aa  59.3  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.144505  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2276  ribonuclease Z  25.56 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3973  ribonuclease Z  25.67 
 
 		 307 aa  59.3  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0417  ribonuclease Z  26.4 
 
 		 326 aa  57.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1193  ribonuclease Z  24.01 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1870  ribonuclease Z  25.33 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1365  hypothetical protein  26.35 
 
 		 312 aa  57  0.0000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000739768  hitchhiker  0.0000000312864 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2837  ribonuclease Z  24.27 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0625  ribonuclease Z  22.61 
 
 		 304 aa  56.2  0.0000007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15101  metallo-beta-lactamase superfamily protein  23.1 
 
 		 312 aa  55.8  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1210  ribonuclease Z  22.76 
 
 		 309 aa  55.8  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1475  beta-lactamase superfamily hydrolase  23.96 
 
 		 318 aa  55.5  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>