295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5649 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5649  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 248 aa  503  9.999999999999999e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0871  beta-lactamase-like  84.34 
 
 		 270 aa  435  1e-121  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2366  hypothetical protein  52.82 
 
 		 268 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0384  hypothetical protein  52.02 
 
 		 250 aa  271  5.000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0581145  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0941  beta-lactamase domain-containing protein  52.4 
 
 		 251 aa  259  3e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.504318 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1103  beta-lactamase domain-containing protein  54.62 
 
 		 248 aa  258  4e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.690546 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1733  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  51.41 
 
 		 250 aa  252  4.0000000000000004e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1544  beta-lactamase domain-containing protein  49.6 
 
 		 252 aa  250  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.835895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3866  beta-lactamase domain protein  51 
 
 		 249 aa  249  3e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1316  beta-lactamase domain-containing protein  51.38 
 
 		 256 aa  248  9e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0992  beta-lactamase domain-containing protein  51 
 
 		 248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29130  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  46.72 
 
 		 259 aa  224  1e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.837765 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1685  beta-lactamase domain-containing protein  44.98 
 
 		 245 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.0000313983  hitchhiker  0.00000630033 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7555  beta-lactamase domain protein  46.9 
 
 		 257 aa  218  8.999999999999998e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.731763  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2357  beta-lactamase-like protein  46.64 
 
 		 257 aa  202  4e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.047895  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08360  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  43.54 
 
 		 271 aa  197  1.0000000000000001e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1012  beta-lactamase domain protein  42.25 
 
 		 256 aa  195  6e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1016  beta-lactamase domain protein  43.24 
 
 		 270 aa  193  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3845  beta-lactamase-like protein  44.27 
 
 		 257 aa  192  5e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3919  beta-lactamase domain-containing protein  44.27 
 
 		 257 aa  192  5e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3831  beta-lactamase domain-containing protein  44.27 
 
 		 257 aa  192  5e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.196272 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1970  beta-lactamase domain protein  43.7 
 
 		 253 aa  191  8e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1324  hypothetical protein  43.13 
 
 		 262 aa  191  9e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.588841  hitchhiker  0.00279452 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25060  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  41.79 
 
 		 267 aa  191  1e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0886  hypothetical protein  42.26 
 
 		 267 aa  184  8e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11369  hypothetical protein  43.87 
 
 		 273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0204718  normal  0.45111 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1359  beta-lactamase domain protein  43.78 
 
 		 246 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4288  beta-lactamase-like protein  44.66 
 
 		 257 aa  181  7e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.34656 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1059  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III  39.44 
 
 		 284 aa  181  1e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.623679  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20060  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  40.7 
 
 		 265 aa  178  8e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.204616  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2314  hypothetical protein  41.13 
 
 		 265 aa  172  5e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000980644 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2582  hypothetical protein  40 
 
 		 265 aa  171  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000119552  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2736  beta-lactamase domain protein  38.35 
 
 		 265 aa  170  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.234606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09930  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  40.4 
 
 		 260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.65106  normal  0.185671 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3987  beta-lactamase domain-containing protein  38 
 
 		 257 aa  162  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.706134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1471  beta-lactamase domain protein  35.89 
 
 		 244 aa  152  4e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0655  beta-lactamase domain protein  34.4 
 
 		 244 aa  150  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000122219  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0371  beta-lactamase domain-containing protein  34.13 
 
 		 256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.677057  normal  0.0150173 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0838  beta-lactamase domain-containing protein  33.07 
 
 		 244 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2093  beta-lactamase domain-containing protein  35.86 
 
 		 240 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000753461  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0308  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 262 aa  143  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1247  metallo-beta-lactamase family protein  33.87 
 
 		 244 aa  143  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5275  beta-lactamase domain protein  35.69 
 
 		 263 aa  144  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1016  hypothetical protein  32.41 
 
 		 244 aa  142  4e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1000  metal-dependant hydrolase  32.41 
 
 		 244 aa  142  4e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1088  hypothetical protein  32.41 
 
 		 244 aa  142  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1166  metallo-beta-lactamase family protein  33.06 
 
 		 244 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1003  metal-dependant hydrolase  32.02 
 
 		 244 aa  140  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1005  beta-lactamase domain-containing protein  32.66 
 
 		 244 aa  139  6e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4186  metallo-beta-lactamase family protein  32.02 
 
 		 244 aa  137  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.167335  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1188  hypothetical protein  32.02 
 
 		 244 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1120  metallo-beta-lactamase family protein  31.62 
 
 		 244 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0761  beta-lactamase domain protein  32.67 
 
 		 249 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3155  beta-lactamase-like protein  33.46 
 
 		 244 aa  136  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166272  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0757  beta-lactamase superfamily hydrolase  34.44 
 
 		 250 aa  127  1.0000000000000001e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00514678  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2205  beta-lactamase domain protein  35.74 
 
 		 246 aa  126  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2686  beta-lactamase domain-containing protein  35.97 
 
 		 248 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0241987  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0399  AtsA/ElaC family protein  37.1 
 
 		 258 aa  125  5e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000165635  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3235  beta-lactamase domain-containing protein  33.98 
 
 		 263 aa  123  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00328629  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2251  beta-lactamase-like  33.45 
 
 		 273 aa  119  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.174345  normal  0.0139422 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1909  beta-lactamase domain-containing protein  32.57 
 
 		 259 aa  117  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0640394  normal  0.612036 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1506  beta-lactamase domain-containing protein  36.02 
 
 		 253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3623  beta-lactamase domain protein  31.4 
 
 		 253 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00997339  normal  0.648861 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1126  beta-lactamase domain protein  27.67 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0125591  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3962  beta-lactamase domain-containing protein  32.97 
 
 		 285 aa  95.9  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.17682  normal  0.145859 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0652  beta-lactamase domain-containing protein  31.96 
 
 		 247 aa  94.4  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1229  beta-lactamase-like protein  32.55 
 
 		 251 aa  91.7  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1526  ribonuclease Z  29.59 
 
 		 318 aa  87.8  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00811682  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0441  beta-lactamase domain protein  26.34 
 
 		 259 aa  88.2  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3325  beta-lactamase domain-containing protein  30.74 
 
 		 247 aa  85.5  7e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.257531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0789  beta-lactamase-like  29 
 
 		 244 aa  82.4  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.514573 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0754  beta-lactamase-like  29 
 
 		 244 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0374984  normal  0.146735 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37507  predicted protein  29.32 
 
 		 447 aa  80.9  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00696771 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1070  beta-lactamase domain protein  26.94 
 
 		 316 aa  79.7  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4621  Beta-lactamase-like  30.74 
 
 		 244 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0681  beta-lactamase-like protein  27.34 
 
 		 250 aa  79  0.00000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142415  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  27.06 
 
 		 306 aa  79  0.00000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1159  beta-lactamase domain-containing protein  33.48 
 
 		 255 aa  78.6  0.00000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1765  beta-lactamase domain-containing protein  30.04 
 
 		 235 aa  78.6  0.00000000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000290014 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0941  beta-lactamase domain-containing protein  30.83 
 
 		 251 aa  78.2  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158649 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2397  metallo-beta-lactamase  29.64 
 
 		 283 aa  77.8  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0866  beta-lactamase domain protein  27.27 
 
 		 244 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.11444  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2119  beta-lactamase domain protein  30.11 
 
 		 256 aa  77  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329371  normal  0.846308 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0415  beta-lactamase domain-containing protein  34.26 
 
 		 237 aa  77  0.0000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12435  ribonuclease Z  29.3 
 
 		 280 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0772968  normal  0.994389 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0857  ribonuclease Z  27.15 
 
 		 309 aa  76.3  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5799  ribonuclease Z  25.94 
 
 		 304 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0914  ribonuclease Z  27.42 
 
 		 307 aa  75.9  0.0000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1710  beta-lactamase domain-containing protein  32.3 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.635275  normal  0.117581 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2187  ribonuclease Z  25.9 
 
 		 307 aa  73.9  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679584  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1579  beta-lactamase domain protein  28.09 
 
 		 252 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2849  beta-lactamase-like  30.27 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2866  beta-lactamase domain protein  28.85 
 
 		 244 aa  71.6  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1860  beta-lactamase domain protein  28.1 
 
 		 297 aa  70.5  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.150092 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1641  Ribonuclease Z  28.4 
 
 		 322 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1563  Ribonuclease Z  28 
 
 		 323 aa  70.5  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2229  ribonuclease Z  26.44 
 
 		 324 aa  69.3  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.859333 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2634  beta-lactamase domain protein  30.41 
 
 		 252 aa  68.9  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70234 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1334  beta-lactamase domain protein  28.74 
 
 		 263 aa  68.9  0.00000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6115  beta-lactamase domain protein  28.14 
 
 		 243 aa  68.6  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>