159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0338 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0338  beta-lactamase-like protein  100 
 
 		 275 aa  580  1.0000000000000001e-165  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2260  beta-lactamase domain protein  46.38 
 
 		 285 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2311  beta-lactamase domain protein  46.38 
 
 		 285 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.519081 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3257  beta-lactamase domain-containing protein  46.95 
 
 		 308 aa  270  2e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2383  beta-lactamase domain-containing protein  47.33 
 
 		 320 aa  268  8.999999999999999e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2117  Beta-lactamase-like  46.07 
 
 		 298 aa  266  2.9999999999999995e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4027  beta-lactamase domain protein  45.55 
 
 		 296 aa  263  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.961759 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0550  beta-lactamase domain protein  45.79 
 
 		 278 aa  256  2e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.145975 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3638  beta-lactamase domain protein  43.48 
 
 		 309 aa  254  8e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0325098  hitchhiker  0.00134063 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1865  beta-lactamase-like  42.7 
 
 		 305 aa  252  5.000000000000001e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.523835  normal  0.165286 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2865  beta-lactamase-like  44.09 
 
 		 304 aa  247  2e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.627483  normal  0.13634 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4637  beta-lactamase-like  41.37 
 
 		 301 aa  246  2e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0877  putative phytochrome sensor protein  42.25 
 
 		 603 aa  228  6e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0810026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1811  Beta-lactamase-like  42.59 
 
 		 282 aa  217  1e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1367  putative phytochrome sensor protein  41.9 
 
 		 607 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.829477  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4119  hypothetical protein  37.36 
 
 		 284 aa  209  4e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.376643  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7099  putative hydrolase protein, beta-lactamase superfamily  37.55 
 
 		 276 aa  208  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.760297  normal  0.767931 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1047  beta-lactamase domain-containing protein  39.93 
 
 		 313 aa  207  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4587  beta-lactamase domain-containing protein  38.99 
 
 		 276 aa  204  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4970  beta-lactamase domain protein  39.31 
 
 		 301 aa  203  3e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0202653 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5603  metal dependant beta lactamase protein  36.1 
 
 		 276 aa  201  9e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4229  beta-lactamase domain protein  36.93 
 
 		 309 aa  201  9.999999999999999e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5955  beta-lactamase domain protein  38.18 
 
 		 276 aa  195  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.512599  normal  0.0645394 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6341  beta-lactamase domain protein  36.16 
 
 		 322 aa  195  9e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0627  hypothetical protein  37.79 
 
 		 305 aa  190  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4920  beta-lactamase domain protein  39.39 
 
 		 301 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4456  beta-lactamase domain-containing protein  39.39 
 
 		 349 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.616956 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3215  beta-lactamase domain-containing protein  36.69 
 
 		 295 aa  188  9e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2296  beta-lactamase domain protein  35.59 
 
 		 302 aa  185  6e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.557207 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0048  beta-lactamase domain-containing protein  37.09 
 
 		 333 aa  184  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.514639  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4228  beta-lactamase domain protein  36.97 
 
 		 283 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.470343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1985  beta-lactamase-like  36.3 
 
 		 295 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.278076  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0591  beta-lactamase domain-containing protein  36.36 
 
 		 323 aa  180  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.189752  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2334  beta-lactamase domain-containing protein  35.66 
 
 		 289 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.121842  normal  0.0743875 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1275  beta-lactamase-like  36.59 
 
 		 279 aa  175  8e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3546  hypothetical protein  35.87 
 
 		 299 aa  172  5e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.285484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02966  beta-lactamase-like protein  34.88 
 
 		 280 aa  172  5e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2700  hypothetical protein  32.73 
 
 		 301 aa  172  5.999999999999999e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0276  beta-lactamase domain-containing protein  34.18 
 
 		 308 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0537397  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6342  beta-lactamase domain protein  35.02 
 
 		 284 aa  157  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1486  metal-dependent hydrolase  31.99 
 
 		 279 aa  155  7e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1257  ElaC, metal-dependent hydrolase of the beta- lactamase superfamily  30.51 
 
 		 294 aa  150  3e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1994  metallo-beta-lactamase family protein  31.89 
 
 		 320 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0701342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2297  metal-dependent hydrolase  32.55 
 
 		 280 aa  132  6.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1541  metallo-beta-lactamase family protein  32.45 
 
 		 320 aa  130  2.0000000000000002e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3807  beta-lactamase superfamily hydrolase  30.77 
 
 		 323 aa  129  6e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200749 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0060  beta-lactamase domain protein  28.27 
 
 		 287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1236  beta-lactamase superfamily hydrolase  31.22 
 
 		 320 aa  104  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0138314 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14031  metallo-beta-lactamase superfamily protein  23.35 
 
 		 327 aa  70.1  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.694516  normal  0.113121 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2095  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  25.91 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0700  beta-lactamase domain protein  24.58 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4543  ribonuclease Z  24.49 
 
 		 301 aa  66.6  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2011  ribonuclease Z  23.12 
 
 		 393 aa  64.7  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0532  ribonuclease Z  22.78 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17761  metallo-beta-lactamase superfamily protein  22.73 
 
 		 314 aa  63.2  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.529395  normal  0.726567 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  21.41 
 
 		 308 aa  62.4  0.000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0920  RNAse Z  22.42 
 
 		 314 aa  61.6  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  21.94 
 
 		 306 aa  62  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0540  Ribonuclease Z  23.62 
 
 		 307 aa  62  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4523  ribonuclease Z  24.92 
 
 		 315 aa  61.2  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0967083  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0495  hypothetical protein  28.33 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.78198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6115  beta-lactamase domain protein  25.49 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15101  metallo-beta-lactamase superfamily protein  25 
 
 		 312 aa  60.1  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2187  ribonuclease Z  22.58 
 
 		 307 aa  59.3  0.00000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679584  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1870  ribonuclease Z  22.22 
 
 		 309 aa  59.3  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2145  RNAse Z  23.08 
 
 		 319 aa  58.5  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.131519 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2403  ribonuclease Z  23.13 
 
 		 345 aa  57.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.335232  hitchhiker  0.0000263844 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2102  ribonuclease Z  26.23 
 
 		 305 aa  58.2  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1710  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.635275  normal  0.117581 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  23.31 
 
 		 305 aa  57  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15351  metallo-beta-lactamase superfamily protein  22.02 
 
 		 312 aa  57.4  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8808  beta-lactamase domain protein  25.5 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2503  ribonuclease Z  23.96 
 
 		 314 aa  55.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.638997 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3611  ribonuclease Z  23.96 
 
 		 314 aa  55.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1765  beta-lactamase domain-containing protein  27.86 
 
 		 235 aa  55.1  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000290014 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05331  beta-lactamase superfamily hydrolase  23.62 
 
 		 318 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0588  beta-lactamase domain-containing protein  27.32 
 
 		 254 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280528  normal  0.0107204 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1016  beta-lactamase domain protein  26.75 
 
 		 270 aa  53.9  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1973  ribonuclease Z  22.36 
 
 		 313 aa  53.9  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.32417 
 
 
-
 
NC_002950  PG0739  ribonuclease Z  22.09 
 
 		 304 aa  53.5  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0339  beta-lactamase domain protein  29.55 
 
 		 255 aa  53.5  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00080407  normal  0.0194254 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15501  metallo-beta-lactamase superfamily protein  22.53 
 
 		 312 aa  53.1  0.000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0652  beta-lactamase domain-containing protein  22.34 
 
 		 247 aa  53.1  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1558  sulphohydrolase/glycosulfatase, Zn-dependent hydrolase  25.82 
 
 		 248 aa  52.8  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.136554  normal  0.849954 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0417  ribonuclease Z  33 
 
 		 326 aa  52  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0641  ribonuclease Z  21.95 
 
 		 321 aa  51.6  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.56652  decreased coverage  0.00172895 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0053  ribonuclease Z  20.32 
 
 		 314 aa  51.6  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1204  hypothetical protein  21.5 
 
 		 312 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.448383 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1219  hypothetical protein  21.5 
 
 		 312 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.206552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1173  putative periplasmic protein  21.5 
 
 		 312 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1563  Ribonuclease Z  25.24 
 
 		 323 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1068  putative periplasmic protein  21.5 
 
 		 312 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1184  hypothetical protein  21.5 
 
 		 312 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.454462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0874  beta-lactamase superfamily hydrolase  23.89 
 
 		 309 aa  51.2  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519626 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1475  beta-lactamase superfamily hydrolase  22.52 
 
 		 318 aa  51.2  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1641  Ribonuclease Z  24.27 
 
 		 322 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0076  ribonuclease Z  31.19 
 
 		 310 aa  51.2  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.887393  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1951  ribonuclease Z  21.14 
 
 		 308 aa  50.8  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00782694  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2582  beta-lactamase domain protein  25.33 
 
 		 239 aa  50.4  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2670  ribonuclease Z  27.05 
 
 		 364 aa  50.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.82455  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>