145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_1373 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_1373  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
257 aa  532  1e-150  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1510  beta-lactamase domain protein  90.27 
 
 
257 aa  489  1e-137  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1628  metallo-beta-lactamase family protein  89.11 
 
 
257 aa  484  1e-136  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0787  beta-lactamase domain-containing protein  40.31 
 
 
280 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0367408 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0797  beta-lactamase domain protein  40.89 
 
 
288 aa  207  1e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0239083  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0801  beta-lactamase domain protein  40.89 
 
 
288 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0750  Beta-lactamase-like  40.96 
 
 
304 aa  205  4e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0751  beta-lactamase domain protein  39.84 
 
 
254 aa  186  4e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0809  beta-lactamase domain protein  37.65 
 
 
277 aa  170  2e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0810  hypothetical protein  37.05 
 
 
260 aa  169  4e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.960554  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0922  hypothetical protein  31.3 
 
 
258 aa  122  4e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000220742  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1330  hypothetical protein  29.13 
 
 
266 aa  118  7e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.493645  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0235  hypothetical protein  28.57 
 
 
266 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.107264  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0654  hypothetical protein  29.8 
 
 
268 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.142183  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0588  hypothetical protein  26.98 
 
 
266 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0390334 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1134  hypothetical protein  29.25 
 
 
270 aa  106  3e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.449288  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2993  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 
328 aa  105  6e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1949  beta-lactamase domain protein  25.1 
 
 
247 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.170959 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2271  beta-lactamase domain protein  23.25 
 
 
243 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1994  beta-lactamase domain-containing protein  23.58 
 
 
243 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3142  metal dependent hydrolase  26.03 
 
 
251 aa  60.1  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.961345  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2921  beta-lactamase domain protein  28.43 
 
 
251 aa  58.5  0.00000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0261886  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0859  beta-lactamase domain protein  26.27 
 
 
244 aa  57.8  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160927  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1563  Ribonuclease Z  24.65 
 
 
323 aa  56.6  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2397  metallo-beta-lactamase  25.34 
 
 
283 aa  56.2  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0210  putative hydrolase  24.1 
 
 
314 aa  56.2  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.903227  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1641  Ribonuclease Z  23.97 
 
 
322 aa  56.2  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0757  beta-lactamase superfamily hydrolase  29.44 
 
 
250 aa  55.8  0.0000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00514678  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2866  beta-lactamase domain protein  25.23 
 
 
244 aa  55.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0761  beta-lactamase domain protein  24.22 
 
 
249 aa  54.7  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2669  ribonuclease Z  24.48 
 
 
286 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0257959  normal  0.795732 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1204  hypothetical protein  23.83 
 
 
312 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.448383 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1219  hypothetical protein  23.83 
 
 
312 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.206552  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1173  putative periplasmic protein  23.83 
 
 
312 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1068  putative periplasmic protein  23.83 
 
 
312 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0399  AtsA/ElaC family protein  27.92 
 
 
258 aa  54.3  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000165635  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2849  beta-lactamase-like  43.42 
 
 
318 aa  53.9  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2269  beta-lactamase domain protein  25.45 
 
 
306 aa  53.9  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1012  beta-lactamase domain protein  24.91 
 
 
256 aa  54.3  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1184  hypothetical protein  23.83 
 
 
312 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.454462  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1261  beta-lactamase-like protein  23.68 
 
 
254 aa  53.5  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.181589  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1126  beta-lactamase domain protein  22.61 
 
 
240 aa  53.9  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0125591  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1733  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  29 
 
 
250 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12435  ribonuclease Z  24.07 
 
 
280 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0772968  normal  0.994389 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2119  beta-lactamase domain protein  26.92 
 
 
256 aa  52.8  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329371  normal  0.846308 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0838  beta-lactamase domain-containing protein  25.56 
 
 
244 aa  52.8  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2495  hydrolase protein  23.11 
 
 
320 aa  52.8  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.822335  normal  0.618343 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1159  beta-lactamase domain-containing protein  24.2 
 
 
255 aa  52.8  0.000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3235  beta-lactamase domain-containing protein  23.38 
 
 
263 aa  52.4  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00328629  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0415  beta-lactamase domain-containing protein  25.11 
 
 
237 aa  52.4  0.000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2093  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 
240 aa  52.4  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000753461  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0652  beta-lactamase domain-containing protein  25.98 
 
 
247 aa  52  0.000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0681  beta-lactamase-like protein  27.51 
 
 
250 aa  51.2  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142415  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8808  beta-lactamase domain protein  23.08 
 
 
243 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6115  beta-lactamase domain protein  23.71 
 
 
243 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0921  beta-lactamase domain protein  28.33 
 
 
270 aa  51.6  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1188  hypothetical protein  23.96 
 
 
244 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2758  beta-lactamase domain protein  23.02 
 
 
321 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.332048 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1909  beta-lactamase domain-containing protein  26.51 
 
 
259 aa  50.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0640394  normal  0.612036 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0841  beta-lactamase-like protein  23.31 
 
 
257 aa  50.4  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000232036  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0985  beta-lactamase-like protein  23.31 
 
 
257 aa  50.4  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000377257  normal  0.567685 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1247  metallo-beta-lactamase family protein  24.22 
 
 
244 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1003  metal-dependant hydrolase  24.11 
 
 
244 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7555  beta-lactamase domain protein  26.63 
 
 
257 aa  50.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.731763  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07370  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily I  23.73 
 
 
266 aa  50.1  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.118565  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2355  beta-lactamase domain protein  23.02 
 
 
319 aa  50.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.104048  normal  0.172704 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1016  beta-lactamase domain protein  24.81 
 
 
270 aa  50.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1016  hypothetical protein  24.11 
 
 
244 aa  49.7  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0013  beta-lactamase domain protein  23.44 
 
 
253 aa  49.7  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.173708 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1088  hypothetical protein  24.11 
 
 
244 aa  49.7  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3155  beta-lactamase-like protein  25.73 
 
 
244 aa  49.3  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166272  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1506  beta-lactamase domain-containing protein  26.99 
 
 
253 aa  49.3  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02203  hydrolase  22.47 
 
 
334 aa  49.3  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1070  beta-lactamase domain protein  21.82 
 
 
316 aa  49.3  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1166  metallo-beta-lactamase family protein  23.21 
 
 
244 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3277  beta-lactamase domain protein  25.41 
 
 
253 aa  49.3  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1000  metal-dependant hydrolase  23.66 
 
 
244 aa  48.5  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0189  beta-lactamase domain-containing protein  23.35 
 
 
245 aa  48.5  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0908747  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1860  beta-lactamase domain protein  23.66 
 
 
297 aa  48.1  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.150092 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0621  hypothetical protein  22.89 
 
 
280 aa  48.5  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1005  beta-lactamase domain-containing protein  23.77 
 
 
244 aa  48.5  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0659  hydrolase, metal-dependent, putative  21.56 
 
 
266 aa  47.8  0.0002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1685  beta-lactamase domain-containing protein  25.88 
 
 
245 aa  47.8  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.0000313983  hitchhiker  0.00000630033 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1544  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 
252 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.835895  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2229  ribonuclease Z  22.55 
 
 
324 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.859333 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0153  ribonuclease Z  31.91 
 
 
310 aa  47.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.585164  normal  0.015686 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0371  beta-lactamase domain-containing protein  26.07 
 
 
256 aa  47.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.677057  normal  0.0150173 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1723  ribonuclease Z  39.71 
 
 
287 aa  47.8  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00214675  decreased coverage  0.00000691229 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29130  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  25.76 
 
 
259 aa  47  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.837765 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2153  beta-lactamase domain-containing protein  21.88 
 
 
262 aa  47  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.250478  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1441  beta-lactamase domain protein  23.47 
 
 
330 aa  47  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0828256  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3908  ribonuclease Z  23.65 
 
 
300 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686381  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1103  beta-lactamase domain-containing protein  26.32 
 
 
248 aa  46.6  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.690546 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0015  ribonuclease Z  30.85 
 
 
315 aa  46.6  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.134703  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1678  beta-lactamase domain-containing protein  34.85 
 
 
305 aa  46.6  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.554215  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0384  hypothetical protein  25 
 
 
250 aa  46.6  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0581145  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3004  beta-lactamase domain-containing protein  49.06 
 
 
204 aa  46.6  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.985459  normal  0.107301 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1558  sulphohydrolase/glycosulfatase, Zn-dependent hydrolase  25.62 
 
 
248 aa  46.2  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.136554  normal  0.849954 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0713  ribonuclease Z  30.85 
 
 
314 aa  46.2  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0308  beta-lactamase domain-containing protein  24.88 
 
 
262 aa  46.2  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>