197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1407 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1407  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
253 aa  524  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.923239 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1470  metal-dependent hydrolase  49.61 
 
 
254 aa  278  5e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.518111  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0708  metallo-beta-lactamase family protein  49.61 
 
 
254 aa  276  2e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.211267  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2899  hypothetical protein  52.36 
 
 
255 aa  274  8e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3041  hypothetical protein  51.97 
 
 
255 aa  274  1.0000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0563  beta-lactamase domain-containing protein  24.58 
 
 
248 aa  73.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3913  beta-lactamase domain-containing protein  29.35 
 
 
283 aa  66.2  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02450  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.65 
 
 
228 aa  65.1  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8808  beta-lactamase domain protein  23.32 
 
 
243 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2866  beta-lactamase domain protein  39.44 
 
 
244 aa  59.7  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6115  beta-lactamase domain protein  23.32 
 
 
243 aa  59.3  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0681  beta-lactamase-like protein  25 
 
 
250 aa  57.8  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142415  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0859  beta-lactamase domain protein  38.03 
 
 
244 aa  57  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160927  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0796  hypothetical protein  35.29 
 
 
244 aa  56.6  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0030667 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2271  beta-lactamase domain protein  22.27 
 
 
243 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0851  beta-lactamase domain protein  26.8 
 
 
255 aa  56.6  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1949  beta-lactamase domain protein  23.05 
 
 
247 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.170959 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0076  ribonuclease Z  23.2 
 
 
310 aa  55.5  0.0000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.887393  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2119  beta-lactamase domain protein  38.89 
 
 
256 aa  54.7  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329371  normal  0.846308 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2921  beta-lactamase domain protein  43.66 
 
 
251 aa  54.7  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0261886  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0727  ribonuclease Z  35.79 
 
 
322 aa  54.7  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.176511  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3142  metal dependent hydrolase  40.85 
 
 
251 aa  54.3  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.961345  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0754  beta-lactamase-like  22.22 
 
 
244 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0374984  normal  0.146735 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10313  ribonuclease Z  34.07 
 
 
301 aa  53.5  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1334  beta-lactamase domain protein  34.07 
 
 
263 aa  52.4  0.000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3325  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
247 aa  52.4  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.257531  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0789  beta-lactamase-like  34.94 
 
 
244 aa  52.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.514573 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1162  beta-lactamase domain-containing protein  21.07 
 
 
257 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6698  beta-lactamase domain protein  36.11 
 
 
310 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.386764  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0401  ribonuclease Z  21.46 
 
 
305 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0866  beta-lactamase domain protein  23.92 
 
 
244 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.11444  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0184  beta-lactamase superfamily hydrolase  35.14 
 
 
265 aa  50.1  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1914  ribonuclease Z  37.78 
 
 
313 aa  50.1  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.552811  normal  0.18224 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3410  ribonuclease Z  24.35 
 
 
311 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109803  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3172  beta-lactamase superfamily hydrolase  31.13 
 
 
255 aa  50.1  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2397  metallo-beta-lactamase  23.76 
 
 
283 aa  49.3  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1383  ribonuclease Z  30.49 
 
 
287 aa  49.7  0.00005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.409103  normal  0.0217204 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4543  ribonuclease Z  36.26 
 
 
301 aa  49.7  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1723  ribonuclease Z  34.15 
 
 
287 aa  49.3  0.00005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00214675  decreased coverage  0.00000691229 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0588  beta-lactamase domain-containing protein  20.69 
 
 
254 aa  49.3  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280528  normal  0.0107204 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1641  Ribonuclease Z  21.69 
 
 
322 aa  49.7  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2503  ribonuclease Z  35.21 
 
 
314 aa  49.3  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.638997 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2647  ribonuclease Z  24.35 
 
 
305 aa  49.3  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.313305  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1159  beta-lactamase domain-containing protein  39.44 
 
 
255 aa  49.3  0.00006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3611  ribonuclease Z  35.21 
 
 
314 aa  49.3  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3634  ribonuclease Z  30.23 
 
 
319 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1100  hypothetical protein  29 
 
 
252 aa  48.9  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.947825  normal  0.67239 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2276  ribonuclease Z  37.5 
 
 
308 aa  49.3  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1994  beta-lactamase domain-containing protein  23.32 
 
 
243 aa  48.9  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0654  ribonuclease Z  33.33 
 
 
307 aa  48.9  0.00008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.296839  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_12268  predicted protein  34.83 
 
 
311 aa  48.9  0.00009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.812865  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02195  ribonuclease Z  24.35 
 
 
305 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1749  ribonuclease Z  34.44 
 
 
308 aa  48.5  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2565  ribonuclease Z  24.35 
 
 
305 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.848275  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2414  ribonuclease Z  24.35 
 
 
305 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02154  hypothetical protein  24.35 
 
 
305 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.871793  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1563  Ribonuclease Z  21.31 
 
 
323 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0429  ribonuclease Z  21.46 
 
 
318 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4523  ribonuclease Z  35.21 
 
 
315 aa  48.5  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0967083  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  30.86 
 
 
306 aa  48.5  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1380  ribonuclease Z  24.35 
 
 
305 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.867836 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0430  ribonuclease Z  21.46 
 
 
318 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3908  ribonuclease Z  24.02 
 
 
300 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686381  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1103  RNAse Z  31.71 
 
 
287 aa  48.5  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1805  ribonuclease Z  23.81 
 
 
319 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.426345  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2187  ribonuclease Z  25.25 
 
 
307 aa  48.1  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679584  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0153  ribonuclease Z  32.98 
 
 
310 aa  48.5  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.585164  normal  0.015686 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1389  ribonuclease BN  24.35 
 
 
311 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471365  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4033  ribonuclease Z  29.07 
 
 
319 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.299532  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0349  ribonuclease Z  36.11 
 
 
307 aa  47.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1839  ribonuclease Z  32.39 
 
 
321 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.885199  normal  0.0537997 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3244  beta-lactamase superfamily hydrolase  30.3 
 
 
255 aa  47.4  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51250  hypothetical protein  34.62 
 
 
252 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000188489 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1193  ribonuclease Z  31.52 
 
 
309 aa  47.4  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0015  ribonuclease Z  34.44 
 
 
315 aa  47.4  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.134703  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3238  metallo-beta-lactamase  36.23 
 
 
277 aa  47.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.192264  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5044  ribonuclease Z  32.39 
 
 
320 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.574405  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0647  ribonuclease Z  31.94 
 
 
313 aa  47  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.834913  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1139  Beta-lactamase-like  36.49 
 
 
257 aa  47  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000269692  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0841  beta-lactamase-like protein  36.49 
 
 
257 aa  46.6  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000232036  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0985  beta-lactamase-like protein  36.49 
 
 
257 aa  46.6  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000377257  normal  0.567685 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4928  beta-lactamase-like protein  20.9 
 
 
308 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5016  beta-lactamase domain-containing protein  20.9 
 
 
308 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.348107  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5309  beta-lactamase domain-containing protein  21.54 
 
 
308 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0713  ribonuclease Z  32.22 
 
 
314 aa  47  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2424  ribonuclease Z  23.83 
 
 
311 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.94801  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1335  beta-lactamase domain-containing protein  43.4 
 
 
258 aa  46.6  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5263  beta-lactamase domain protein  36.11 
 
 
326 aa  46.2  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000854827 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1910  beta-lactamase domain protein  24.88 
 
 
248 aa  46.2  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.405245  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1179  ribonuclease Z  32.39 
 
 
318 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.777962 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0641  ribonuclease Z  30.99 
 
 
321 aa  46.2  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.56652  decreased coverage  0.00172895 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15101  metallo-beta-lactamase superfamily protein  32.39 
 
 
312 aa  46.2  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0186  beta-lactamase domain-containing protein  34.72 
 
 
228 aa  46.2  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000106094  normal  0.0583426 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5731  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
310 aa  45.8  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194082  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6025  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
310 aa  45.8  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.706578  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5781  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
310 aa  45.8  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1210  ribonuclease Z  28.26 
 
 
309 aa  45.8  0.0007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1447  RNAse Z  30.99 
 
 
312 aa  45.8  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2949  beta-lactamase domain-containing protein  29.17 
 
 
304 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.161977  normal  0.098851 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15351  metallo-beta-lactamase superfamily protein  30.99 
 
 
312 aa  45.8  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>