174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3172 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_3172  beta-lactamase superfamily hydrolase  100 
 
 
255 aa  523  1e-147  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3244  beta-lactamase superfamily hydrolase  71.26 
 
 
255 aa  355  3.9999999999999996e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0184  beta-lactamase superfamily hydrolase  38.56 
 
 
265 aa  169  4e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1334  beta-lactamase domain protein  32.75 
 
 
263 aa  82.8  0.000000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1656  beta-lactamase domain-containing protein  30.83 
 
 
254 aa  81.6  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.171816 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2271  beta-lactamase domain protein  29.1 
 
 
243 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8808  beta-lactamase domain protein  29.21 
 
 
243 aa  69.3  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6115  beta-lactamase domain protein  28.86 
 
 
243 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0754  beta-lactamase-like  28.57 
 
 
244 aa  65.5  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0374984  normal  0.146735 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0866  beta-lactamase domain protein  29.63 
 
 
244 aa  65.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.11444  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3142  metal dependent hydrolase  27.86 
 
 
251 aa  64.7  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.961345  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3866  beta-lactamase domain protein  28.27 
 
 
249 aa  64.7  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1188  hypothetical protein  29.41 
 
 
244 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1949  beta-lactamase domain protein  28.04 
 
 
247 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.170959 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2205  beta-lactamase domain protein  33.77 
 
 
246 aa  63.2  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0789  beta-lactamase-like  28.57 
 
 
244 aa  62.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.514573 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1994  beta-lactamase domain-containing protein  26.64 
 
 
243 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0838  beta-lactamase domain-containing protein  31.48 
 
 
244 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0796  hypothetical protein  27.37 
 
 
244 aa  62  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0030667 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0713  ribonuclease Z  25.33 
 
 
314 aa  61.6  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2686  beta-lactamase domain-containing protein  25.26 
 
 
248 aa  61.2  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0241987  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3325  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 
247 aa  61.6  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.257531  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4186  metallo-beta-lactamase family protein  28.42 
 
 
244 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.167335  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1749  ribonuclease Z  26 
 
 
308 aa  61.6  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4621  Beta-lactamase-like  30.26 
 
 
244 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1247  metallo-beta-lactamase family protein  28.96 
 
 
244 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1000  metal-dependant hydrolase  28.65 
 
 
244 aa  60.5  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0941  beta-lactamase domain-containing protein  30.65 
 
 
251 aa  60.1  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0158649 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1166  metallo-beta-lactamase family protein  27.96 
 
 
244 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1016  hypothetical protein  31.21 
 
 
244 aa  59.7  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1088  hypothetical protein  31.21 
 
 
244 aa  59.7  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0153  ribonuclease Z  23.33 
 
 
310 aa  58.9  0.00000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.585164  normal  0.015686 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1805  ribonuclease Z  32.89 
 
 
319 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.426345  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1120  metallo-beta-lactamase family protein  27.89 
 
 
244 aa  58.5  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4033  ribonuclease Z  32.89 
 
 
319 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.299532  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1359  beta-lactamase domain protein  30.11 
 
 
246 aa  58.2  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3235  beta-lactamase domain-containing protein  27.17 
 
 
263 aa  58.2  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00328629  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2119  beta-lactamase domain protein  26.02 
 
 
256 aa  57.8  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329371  normal  0.846308 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1866  beta-lactamase domain protein  26.17 
 
 
303 aa  57.8  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2169  ribonuclease Z  31.45 
 
 
323 aa  57.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0974694  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  26.83 
 
 
308 aa  57  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1003  metal-dependant hydrolase  30.57 
 
 
244 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1005  beta-lactamase domain-containing protein  28.11 
 
 
244 aa  57  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25060  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  28 
 
 
267 aa  56.6  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1788  ribonuclease Z  26.89 
 
 
291 aa  56.6  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1839  ribonuclease Z  31.17 
 
 
321 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.885199  normal  0.0537997 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4543  ribonuclease Z  30.28 
 
 
301 aa  55.8  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0384  hypothetical protein  28.02 
 
 
250 aa  55.5  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0581145  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2866  beta-lactamase domain protein  27.55 
 
 
244 aa  55.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0907  beta-lactamase domain-containing protein  30.53 
 
 
267 aa  54.3  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0676243  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0727  ribonuclease Z  21.38 
 
 
322 aa  53.9  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.176511  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3987  beta-lactamase domain-containing protein  28.3 
 
 
257 aa  53.9  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.706134  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2736  beta-lactamase domain protein  28.4 
 
 
265 aa  53.5  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.234606  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0859  beta-lactamase domain protein  27.44 
 
 
244 aa  53.1  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160927  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0738  ribonuclease Z  25.79 
 
 
304 aa  52  0.000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2187  ribonuclease Z  29.81 
 
 
307 aa  52  0.000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679584  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2014  ribonuclease Z  26.72 
 
 
291 aa  52  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.426384  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2366  hypothetical protein  27.87 
 
 
268 aa  51.6  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1720  beta-lactamase-like  36.84 
 
 
373 aa  51.6  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.869413  normal  0.797394 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1808  ribonuclease Z  40.98 
 
 
354 aa  51.2  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0346445  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0015  ribonuclease Z  21.79 
 
 
315 aa  51.6  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.134703  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1530  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  29.68 
 
 
561 aa  50.4  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.712095 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0681  beta-lactamase-like protein  24.73 
 
 
250 aa  50.4  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142415  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2102  ribonuclease Z  21.77 
 
 
305 aa  50.8  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10313  ribonuclease Z  25.33 
 
 
301 aa  50.8  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0941  beta-lactamase domain-containing protein  27.32 
 
 
251 aa  50.8  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.504318 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3634  ribonuclease Z  30.87 
 
 
319 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1733  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  27.09 
 
 
250 aa  50.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  22.14 
 
 
305 aa  50.1  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1563  Ribonuclease Z  39.74 
 
 
323 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1453  beta-lactamase domain-containing protein  26.62 
 
 
563 aa  50.1  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1641  Ribonuclease Z  37.23 
 
 
322 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0432  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  28.03 
 
 
260 aa  49.7  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0467  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  28.03 
 
 
260 aa  49.7  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.169568  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7858  beta-lactamase domain protein  25.33 
 
 
561 aa  50.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.627673 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1407  beta-lactamase domain protein  31.13 
 
 
253 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.923239 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0655  beta-lactamase domain protein  25.49 
 
 
244 aa  49.7  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000122219  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3155  beta-lactamase-like protein  26.95 
 
 
244 aa  49.7  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166272  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2093  beta-lactamase domain-containing protein  24.05 
 
 
240 aa  49.7  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000753461  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0540  PhnP protein  24.87 
 
 
253 aa  49.3  0.00006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.14987  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0415  beta-lactamase domain-containing protein  31.72 
 
 
237 aa  49.3  0.00006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0886  hypothetical protein  23.62 
 
 
267 aa  48.9  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0417  ribonuclease Z  29.75 
 
 
326 aa  49.3  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1104  beta-lactamase domain-containing protein  27.59 
 
 
249 aa  48.9  0.00007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.342626 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  29.08 
 
 
306 aa  48.9  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0563  beta-lactamase domain-containing protein  26.04 
 
 
248 aa  48.9  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5649  beta-lactamase domain-containing protein  25.91 
 
 
248 aa  48.9  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1914  ribonuclease Z  28.23 
 
 
313 aa  48.5  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.552811  normal  0.18224 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15501  metallo-beta-lactamase superfamily protein  20.41 
 
 
312 aa  48.5  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0647  ribonuclease Z  26.71 
 
 
313 aa  48.5  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.834913  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0350  ribonuclease Z  39.06 
 
 
304 aa  48.5  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0031  beta-lactamase domain protein  27.43 
 
 
262 aa  47.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.208776  normal  0.175633 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0399  AtsA/ElaC family protein  22.58 
 
 
258 aa  47.4  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000165635  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0871  beta-lactamase-like  25.43 
 
 
270 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1765  beta-lactamase domain-containing protein  25.29 
 
 
235 aa  47.8  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000290014 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15351  metallo-beta-lactamase superfamily protein  21.33 
 
 
312 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4250  ribonuclease Z  23.78 
 
 
307 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4169  ribonuclease Z  30.7 
 
 
314 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.406356  normal  0.0568624 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1470  metal-dependent hydrolase  23.5 
 
 
254 aa  47.8  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.518111  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0708  metallo-beta-lactamase family protein  24.79 
 
 
254 aa  47.4  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.211267  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>