279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3513 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3513  beta-lactamase-like  100 
 
 
288 aa  588  1e-167  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0371134  hitchhiker  0.000893101 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2397  metallo-beta-lactamase  47.16 
 
 
283 aa  267  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0210  putative hydrolase  42.7 
 
 
314 aa  224  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.903227  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2495  hydrolase protein  39.43 
 
 
320 aa  188  8e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.822335  normal  0.618343 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2355  beta-lactamase domain protein  37.45 
 
 
319 aa  188  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.104048  normal  0.172704 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2758  beta-lactamase domain protein  37.45 
 
 
321 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.332048 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1068  putative periplasmic protein  36.27 
 
 
312 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1219  hypothetical protein  36.27 
 
 
312 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.206552  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1204  hypothetical protein  36.27 
 
 
312 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.448383 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1173  putative periplasmic protein  36.27 
 
 
312 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02203  hydrolase  38.71 
 
 
334 aa  177  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1184  hypothetical protein  35.92 
 
 
312 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.454462  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0855  beta-lactamase domain protein  29.21 
 
 
327 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.272669  normal  0.116171 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12435  ribonuclease Z  30.42 
 
 
280 aa  116  5e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0772968  normal  0.994389 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5998  metal-dependent hydrolase  29.82 
 
 
414 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403033  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2299  beta-lactamase domain-containing protein  31.44 
 
 
337 aa  110  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000114028  hitchhiker  0.00742291 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3906  beta-lactamase-like  30.98 
 
 
309 aa  107  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3908  ribonuclease Z  29.93 
 
 
300 aa  107  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686381  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3785  putative tRNA 3' processing RNase Z-like protein  30.56 
 
 
393 aa  104  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1722  beta-lactamase domain-containing protein  29.28 
 
 
324 aa  103  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.261159  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17980  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  30.28 
 
 
331 aa  101  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.182434  normal  0.52881 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0876  beta-lactamase-like  25.59 
 
 
328 aa  99.8  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.440271  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3902  beta-lactamase-like  29.39 
 
 
312 aa  99  9e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2669  ribonuclease Z  31.12 
 
 
286 aa  99  9e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0257959  normal  0.795732 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1563  Ribonuclease Z  31.51 
 
 
323 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1641  Ribonuclease Z  28.62 
 
 
322 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0205  hypothetical protein  27.06 
 
 
395 aa  91.7  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3506  ribonuclease Z  30.88 
 
 
285 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3578  ribonuclease Z  30.88 
 
 
285 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0515692 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3518  ribonuclease Z  30.88 
 
 
285 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1451  ribonuclease Z  26.42 
 
 
381 aa  89.4  7e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2670  ribonuclease Z  29.97 
 
 
364 aa  89  9e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.82455  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  25.98 
 
 
308 aa  87.4  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3142  metal dependent hydrolase  25 
 
 
251 aa  85.9  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.961345  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  28.67 
 
 
305 aa  85.1  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0182  beta-lactamase-like protein  27.21 
 
 
381 aa  85.1  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.530565  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2705  putative hydrolase  28.68 
 
 
280 aa  85.1  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2102  ribonuclease Z  29.79 
 
 
305 aa  81.6  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0429  ribonuclease Z  27.24 
 
 
318 aa  80.1  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0401  ribonuclease Z  27.24 
 
 
305 aa  80.1  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0430  ribonuclease Z  27.24 
 
 
318 aa  79.7  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1970  beta-lactamase domain protein  28.37 
 
 
253 aa  78.6  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3634  ribonuclease Z  27.91 
 
 
319 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13830  hypothetical protein  24.23 
 
 
375 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.491323  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1104  beta-lactamase domain-containing protein  31.18 
 
 
249 aa  78.2  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.342626 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4033  ribonuclease Z  27.12 
 
 
319 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.299532  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1805  ribonuclease Z  27 
 
 
319 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.426345  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0859  beta-lactamase domain protein  29.21 
 
 
244 aa  76.6  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160927  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4169  ribonuclease Z  26.51 
 
 
314 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.406356  normal  0.0568624 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3155  beta-lactamase-like protein  26.77 
 
 
244 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166272  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3238  beta-lactamase domain protein  25.76 
 
 
323 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14031  metallo-beta-lactamase superfamily protein  24.66 
 
 
327 aa  73.2  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.694516  normal  0.113121 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1860  beta-lactamase domain protein  26.46 
 
 
297 aa  72.4  0.000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.150092 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2866  beta-lactamase domain protein  26.46 
 
 
244 aa  72.4  0.000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2014  ribonuclease Z  24.36 
 
 
291 aa  70.9  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.426384  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2119  beta-lactamase domain protein  27.64 
 
 
256 aa  70.9  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329371  normal  0.846308 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2657  ribonuclease Z  27.84 
 
 
305 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2553  ribonuclease Z  27.84 
 
 
305 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2449  ribonuclease Z  27.84 
 
 
305 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17761  metallo-beta-lactamase superfamily protein  26.12 
 
 
314 aa  70.1  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.529395  normal  0.726567 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2542  ribonuclease Z  27.84 
 
 
341 aa  70.1  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.144505  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  25.47 
 
 
306 aa  69.7  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2497  ribonuclease Z  27.84 
 
 
341 aa  69.7  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.883053  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1839  ribonuclease Z  27.49 
 
 
321 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.885199  normal  0.0537997 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3410  ribonuclease Z  25.49 
 
 
311 aa  68.9  0.00000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109803  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1179  ribonuclease Z  25.68 
 
 
318 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.777962 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0920  RNAse Z  26.12 
 
 
314 aa  68.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02195  ribonuclease Z  25.49 
 
 
305 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1389  ribonuclease BN  27.41 
 
 
311 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471365  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2647  ribonuclease Z  27.41 
 
 
305 aa  67.8  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.313305  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1788  ribonuclease Z  26.37 
 
 
291 aa  67.8  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02154  hypothetical protein  25.49 
 
 
305 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.871793  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2414  ribonuclease Z  25.49 
 
 
305 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1380  ribonuclease Z  25.49 
 
 
305 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.867836 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2187  ribonuclease Z  25 
 
 
307 aa  67.8  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679584  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0339  beta-lactamase domain protein  30.5 
 
 
255 aa  67  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00080407  normal  0.0194254 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2205  beta-lactamase domain protein  30.59 
 
 
246 aa  67  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2565  ribonuclease Z  27.41 
 
 
305 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.848275  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1012  beta-lactamase domain protein  30.86 
 
 
256 aa  67  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0532  ribonuclease Z  25.6 
 
 
319 aa  66.6  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0308  beta-lactamase domain-containing protein  31.25 
 
 
262 aa  67  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2424  ribonuclease Z  27.03 
 
 
311 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.94801  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1159  beta-lactamase domain-containing protein  29.8 
 
 
255 aa  66.2  0.0000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1016  beta-lactamase domain protein  27.62 
 
 
270 aa  65.9  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7555  beta-lactamase domain protein  28.63 
 
 
257 aa  65.9  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.731763  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1229  beta-lactamase-like protein  24.15 
 
 
251 aa  65.9  0.0000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2145  RNAse Z  25.69 
 
 
319 aa  65.5  0.0000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.131519 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1126  beta-lactamase domain protein  26.51 
 
 
240 aa  65.5  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0125591  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2011  ribonuclease Z  24.57 
 
 
393 aa  64.3  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0371  beta-lactamase domain-containing protein  27.06 
 
 
256 aa  64.7  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.677057  normal  0.0150173 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1866  beta-lactamase domain protein  23.46 
 
 
303 aa  64.3  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1561  ribonuclease Z  24.56 
 
 
306 aa  63.9  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1592  ribonuclease Z  24.56 
 
 
306 aa  63.9  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359546  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0819  beta-lactamase domain-containing protein  26.23 
 
 
256 aa  63.5  0.000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1066  AtsA/ElaC family protein  23.31 
 
 
306 aa  63.2  0.000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.583999  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3866  beta-lactamase domain protein  29.82 
 
 
249 aa  62.8  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0655  beta-lactamase domain protein  26.98 
 
 
244 aa  62.8  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000122219  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1016  hypothetical protein  25.36 
 
 
244 aa  62.4  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1088  hypothetical protein  25.36 
 
 
244 aa  62.4  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2169  ribonuclease Z  26.4 
 
 
323 aa  62.4  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0974694  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>