48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1589 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1589  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  491  9.999999999999999e-139  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0909868  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1841  beta-lactamase superfamily hydrolase  30.47 
 
 		 241 aa  87.4  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0184  beta-lactamase superfamily hydrolase  25 
 
 		 265 aa  59.3  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1162  beta-lactamase domain-containing protein  22.35 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2093  beta-lactamase domain-containing protein  28.4 
 
 		 240 aa  54.3  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000753461  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0739  ribonuclease Z  31.58 
 
 		 304 aa  52.8  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2866  beta-lactamase domain protein  21.32 
 
 		 244 aa  52  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0789  beta-lactamase-like  26.06 
 
 		 244 aa  52  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.514573 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0859  beta-lactamase domain protein  21.78 
 
 		 244 aa  51.6  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160927  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2119  beta-lactamase domain protein  21.98 
 
 		 256 aa  51.2  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329371  normal  0.846308 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6632  beta-lactamase domain protein  21.74 
 
 		 302 aa  51.6  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2299  beta-lactamase domain-containing protein  23.49 
 
 		 337 aa  51.6  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000114028  hitchhiker  0.00742291 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0757  beta-lactamase superfamily hydrolase  22.82 
 
 		 250 aa  50.1  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00514678  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0754  beta-lactamase-like  27.78 
 
 		 244 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0374984  normal  0.146735 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1994  beta-lactamase domain-containing protein  31.88 
 
 		 243 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11850  predicted protein  25 
 
 		 285 aa  49.3  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1544  beta-lactamase domain-containing protein  22.12 
 
 		 252 aa  49.3  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.835895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0563  beta-lactamase domain-containing protein  26.09 
 
 		 248 aa  49.3  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1451  ribonuclease Z  26.53 
 
 		 381 aa  48.5  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0153  ribonuclease Z  26.11 
 
 		 310 aa  48.5  0.00009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.585164  normal  0.015686 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1910  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 248 aa  48.1  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.405245  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0727  ribonuclease Z  24.53 
 
 		 322 aa  47.8  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.176511  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4621  Beta-lactamase-like  24.74 
 
 		 244 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4543  ribonuclease Z  29.79 
 
 		 301 aa  47.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2271  beta-lactamase domain protein  30.43 
 
 		 243 aa  47  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1749  ribonuclease Z  26.11 
 
 		 308 aa  46.6  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0588  beta-lactamase domain-containing protein  22.29 
 
 		 254 aa  46.2  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280528  normal  0.0107204 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6115  beta-lactamase domain protein  22.1 
 
 		 243 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8808  beta-lactamase domain protein  22.1 
 
 		 243 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0399  AtsA/ElaC family protein  25.73 
 
 		 258 aa  45.4  0.0008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000165635  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1949  beta-lactamase domain protein  22.67 
 
 		 247 aa  45.4  0.0009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.170959 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0713  ribonuclease Z  24.2 
 
 		 314 aa  44.7  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1914  ribonuclease Z  27.83 
 
 		 313 aa  45.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.552811  normal  0.18224 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3374  beta-lactamase domain-containing protein  29.69 
 
 		 255 aa  44.3  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285355  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1531  beta-lactamase domain-containing protein  25.64 
 
 		 235 aa  44.3  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0655  beta-lactamase domain protein  24.85 
 
 		 244 aa  43.9  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000122219  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0866  beta-lactamase domain protein  26.09 
 
 		 244 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.11444  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10313  ribonuclease Z  26.85 
 
 		 301 aa  43.5  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02203  hydrolase  24.69 
 
 		 334 aa  43.5  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1210  ribonuclease Z  29.21 
 
 		 309 aa  43.1  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1144  beta-lactamase domain-containing protein  32.47 
 
 		 256 aa  42.7  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0495  hypothetical protein  25.75 
 
 		 235 aa  42.7  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.78198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1407  beta-lactamase domain protein  26.45 
 
 		 253 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.923239 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3129  adenosylcobinamide kinase  33.9 
 
 		 507 aa  42.4  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.654981 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0015  ribonuclease Z  28.26 
 
 		 315 aa  42.4  0.006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.134703  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1003  metal-dependant hydrolase  34.29 
 
 		 244 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1765  beta-lactamase domain-containing protein  24.26 
 
 		 235 aa  42.4  0.008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000290014 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3906  beta-lactamase-like  22.28 
 
 		 309 aa  41.6  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>