84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1275 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1275  beta-lactamase-like  100 
 
 		 279 aa  585  1e-166  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02966  beta-lactamase-like protein  66.06 
 
 		 280 aa  392  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1486  metal-dependent hydrolase  36.88 
 
 		 279 aa  192  8e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0877  putative phytochrome sensor protein  40.82 
 
 		 603 aa  191  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0810026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4229  beta-lactamase domain protein  34.62 
 
 		 309 aa  178  7e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1367  putative phytochrome sensor protein  39.45 
 
 		 607 aa  178  9e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.829477  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0338  beta-lactamase-like protein  36.59 
 
 		 275 aa  175  8e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4119  hypothetical protein  36.24 
 
 		 284 aa  166  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.376643  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2311  beta-lactamase domain protein  35.29 
 
 		 285 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.519081 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2260  beta-lactamase domain protein  35.29 
 
 		 285 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1541  metallo-beta-lactamase family protein  32.41 
 
 		 320 aa  165  9e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0550  beta-lactamase domain protein  35.94 
 
 		 278 aa  165  9e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.145975 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4027  beta-lactamase domain protein  36.24 
 
 		 296 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.961759 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1865  beta-lactamase-like  34.72 
 
 		 305 aa  160  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.523835  normal  0.165286 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3638  beta-lactamase domain protein  36.92 
 
 		 309 aa  159  4e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0325098  hitchhiker  0.00134063 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3257  beta-lactamase domain-containing protein  38.31 
 
 		 308 aa  159  6e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1257  ElaC, metal-dependent hydrolase of the beta- lactamase superfamily  31.19 
 
 		 294 aa  158  8e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0048  beta-lactamase domain-containing protein  35.56 
 
 		 333 aa  157  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.514639  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2117  Beta-lactamase-like  34.72 
 
 		 298 aa  155  8e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3215  beta-lactamase domain-containing protein  32.77 
 
 		 295 aa  154  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4228  beta-lactamase domain protein  33.79 
 
 		 283 aa  153  2.9999999999999998e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.470343  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7099  putative hydrolase protein, beta-lactamase superfamily  34.21 
 
 		 276 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.760297  normal  0.767931 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4637  beta-lactamase-like  33.22 
 
 		 301 aa  151  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6342  beta-lactamase domain protein  34.48 
 
 		 284 aa  149  4e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2383  beta-lactamase domain-containing protein  34.98 
 
 		 320 aa  149  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0060  beta-lactamase domain protein  33.56 
 
 		 287 aa  148  8e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5955  beta-lactamase domain protein  35.94 
 
 		 276 aa  148  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.512599  normal  0.0645394 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2865  beta-lactamase-like  32.26 
 
 		 304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.627483  normal  0.13634 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1811  Beta-lactamase-like  36.21 
 
 		 282 aa  142  6e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1985  beta-lactamase-like  34.2 
 
 		 295 aa  142  7e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.278076  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6341  beta-lactamase domain protein  29.93 
 
 		 322 aa  137  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0591  beta-lactamase domain-containing protein  33 
 
 		 323 aa  137  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.189752  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2296  beta-lactamase domain protein  28.95 
 
 		 302 aa  133  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.557207 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4587  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 276 aa  133  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5603  metal dependant beta lactamase protein  31.82 
 
 		 276 aa  132  5e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0627  hypothetical protein  36.19 
 
 		 305 aa  130  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1994  metallo-beta-lactamase family protein  33.46 
 
 		 320 aa  124  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0701342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1236  beta-lactamase superfamily hydrolase  32.95 
 
 		 320 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0138314 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2297  metal-dependent hydrolase  29.97 
 
 		 280 aa  121  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2334  beta-lactamase domain-containing protein  30.11 
 
 		 289 aa  115  6e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.121842  normal  0.0743875 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4970  beta-lactamase domain protein  29.43 
 
 		 301 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0202653 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0276  beta-lactamase domain-containing protein  29.71 
 
 		 308 aa  109  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0537397  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3807  beta-lactamase superfamily hydrolase  32.37 
 
 		 323 aa  109  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200749 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4456  beta-lactamase domain-containing protein  30.36 
 
 		 349 aa  108  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.616956 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4920  beta-lactamase domain protein  30.14 
 
 		 301 aa  108  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1047  beta-lactamase domain-containing protein  29.59 
 
 		 313 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2700  hypothetical protein  31.14 
 
 		 301 aa  96.7  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3546  hypothetical protein  30.1 
 
 		 299 aa  92.4  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.285484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0652  beta-lactamase domain-containing protein  27.31 
 
 		 247 aa  66.6  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0700  beta-lactamase domain protein  24 
 
 		 270 aa  65.5  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2095  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  22.44 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1870  ribonuclease Z  23.3 
 
 		 309 aa  52.4  0.000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0941  beta-lactamase domain-containing protein  25.35 
 
 		 251 aa  50.8  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.504318 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0076  ribonuclease Z  23.66 
 
 		 310 aa  49.7  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.887393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0838  beta-lactamase domain-containing protein  27.57 
 
 		 244 aa  49.3  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  23.03 
 
 		 306 aa  48.9  0.00009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0761  beta-lactamase domain protein  25.96 
 
 		 249 aa  48.9  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4186  metallo-beta-lactamase family protein  24.6 
 
 		 244 aa  47  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.167335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2187  ribonuclease Z  23.65 
 
 		 307 aa  47  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679584  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1247  metallo-beta-lactamase family protein  25.61 
 
 		 244 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1188  hypothetical protein  24.08 
 
 		 244 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1005  beta-lactamase domain-containing protein  26.02 
 
 		 244 aa  46.2  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1016  hypothetical protein  26.02 
 
 		 244 aa  45.8  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2782  beta-lactamase domain protein  24.36 
 
 		 258 aa  45.8  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.492368 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1088  hypothetical protein  26.02 
 
 		 244 aa  45.8  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1120  metallo-beta-lactamase family protein  25.2 
 
 		 244 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1003  metal-dependant hydrolase  26.02 
 
 		 244 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1716  ribonuclease Z  21.54 
 
 		 316 aa  45.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1012  beta-lactamase domain protein  23.84 
 
 		 256 aa  44.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1000  metal-dependant hydrolase  25.61 
 
 		 244 aa  44.3  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1579  beta-lactamase domain protein  25.35 
 
 		 252 aa  44.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2119  beta-lactamase domain protein  24.57 
 
 		 256 aa  44.7  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329371  normal  0.846308 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0512  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  27.98 
 
 		 260 aa  43.5  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1166  metallo-beta-lactamase family protein  25.41 
 
 		 244 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2634  beta-lactamase domain protein  24.66 
 
 		 252 aa  43.9  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70234 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1973  ribonuclease Z  33.33 
 
 		 313 aa  43.5  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.32417 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0796  hypothetical protein  26.64 
 
 		 244 aa  43.1  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030667 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0053  ribonuclease Z  21.98 
 
 		 314 aa  43.1  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0984  cyclic-AMP phosphodiesterase  37.5 
 
 		 254 aa  43.1  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6632  beta-lactamase domain protein  25.28 
 
 		 302 aa  43.1  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2337  beta-lactamase-like  26.54 
 
 		 240 aa  42.7  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0189  beta-lactamase domain-containing protein  25.24 
 
 		 245 aa  42.7  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0908747  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0871  beta-lactamase-like  23.29 
 
 		 270 aa  42.4  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0927  ribonuclease Z  29.82 
 
 		 305 aa  42  0.01  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>