141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0627 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0627  hypothetical protein  100 
 
 
305 aa  639    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0048  beta-lactamase domain-containing protein  60.6 
 
 
333 aa  391  1e-108  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.514639  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0338  beta-lactamase-like protein  37.42 
 
 
275 aa  201  9.999999999999999e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0591  beta-lactamase domain-containing protein  40.66 
 
 
323 aa  199  3.9999999999999996e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.189752  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1865  beta-lactamase-like  37.75 
 
 
305 aa  199  5e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.523835  normal  0.165286 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2383  beta-lactamase domain-containing protein  38.89 
 
 
320 aa  199  7e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2311  beta-lactamase domain protein  38.21 
 
 
285 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.519081 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2260  beta-lactamase domain protein  38.21 
 
 
285 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4637  beta-lactamase-like  37.87 
 
 
301 aa  193  4e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3638  beta-lactamase domain protein  39.87 
 
 
309 aa  192  5e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0325098  hitchhiker  0.00134063 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4027  beta-lactamase domain protein  37.75 
 
 
296 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.961759 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2117  Beta-lactamase-like  36.09 
 
 
298 aa  189  4e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3257  beta-lactamase domain-containing protein  38.54 
 
 
308 aa  188  7e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4119  hypothetical protein  34.44 
 
 
284 aa  184  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.376643  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2865  beta-lactamase-like  34.54 
 
 
304 aa  181  1e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.627483  normal  0.13634 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0877  putative phytochrome sensor protein  35.46 
 
 
603 aa  166  4e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0810026  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4229  beta-lactamase domain protein  32.34 
 
 
309 aa  160  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4587  beta-lactamase domain-containing protein  34.21 
 
 
276 aa  158  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205047  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0550  beta-lactamase domain protein  32.89 
 
 
278 aa  158  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.145975 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1367  putative phytochrome sensor protein  36.56 
 
 
607 aa  157  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.829477  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1811  Beta-lactamase-like  34.22 
 
 
282 aa  156  4e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4970  beta-lactamase domain protein  31.91 
 
 
301 aa  153  4e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0202653 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7099  putative hydrolase protein, beta-lactamase superfamily  32.34 
 
 
276 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.760297  normal  0.767931 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5603  metal dependant beta lactamase protein  30.07 
 
 
276 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3215  beta-lactamase domain-containing protein  32.89 
 
 
295 aa  144  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1275  beta-lactamase-like  35.67 
 
 
279 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02966  beta-lactamase-like protein  33.75 
 
 
280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0276  beta-lactamase domain-containing protein  31.06 
 
 
308 aa  139  7e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0537397  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4228  beta-lactamase domain protein  34.7 
 
 
283 aa  138  8.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.470343  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1047  beta-lactamase domain-containing protein  31.31 
 
 
313 aa  137  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5955  beta-lactamase domain protein  32.34 
 
 
276 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.512599  normal  0.0645394 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2296  beta-lactamase domain protein  30.77 
 
 
302 aa  137  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.557207 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4456  beta-lactamase domain-containing protein  31.58 
 
 
349 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.616956 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4920  beta-lactamase domain protein  31.58 
 
 
301 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2334  beta-lactamase domain-containing protein  31.13 
 
 
289 aa  135  8e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.121842  normal  0.0743875 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1985  beta-lactamase-like  34.31 
 
 
295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.278076  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2700  hypothetical protein  29.22 
 
 
301 aa  132  1.0000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1541  metallo-beta-lactamase family protein  32.41 
 
 
320 aa  130  2.0000000000000002e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3546  hypothetical protein  31.39 
 
 
299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.285484  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0060  beta-lactamase domain protein  31.85 
 
 
287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6341  beta-lactamase domain protein  30.35 
 
 
322 aa  129  6e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6342  beta-lactamase domain protein  32.76 
 
 
284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1486  metal-dependent hydrolase  29.69 
 
 
279 aa  119  9e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1994  metallo-beta-lactamase family protein  29.91 
 
 
320 aa  118  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0701342  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1257  ElaC, metal-dependent hydrolase of the beta- lactamase superfamily  28.38 
 
 
294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3807  beta-lactamase superfamily hydrolase  30 
 
 
323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0200749 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2297  metal-dependent hydrolase  28.66 
 
 
280 aa  100  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1236  beta-lactamase superfamily hydrolase  28.82 
 
 
320 aa  99.8  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0138314 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15351  metallo-beta-lactamase superfamily protein  22.19 
 
 
312 aa  72  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15501  metallo-beta-lactamase superfamily protein  22.55 
 
 
312 aa  70.5  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1870  ribonuclease Z  25.85 
 
 
309 aa  67.4  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0641  ribonuclease Z  25.3 
 
 
321 aa  65.5  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.56652  decreased coverage  0.00172895 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15101  metallo-beta-lactamase superfamily protein  23.95 
 
 
312 aa  64.7  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0920  RNAse Z  27.8 
 
 
314 aa  64.3  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  23.55 
 
 
308 aa  63.2  0.000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1447  RNAse Z  21.66 
 
 
312 aa  62.4  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2145  RNAse Z  25.07 
 
 
319 aa  60.8  0.00000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.131519 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17761  metallo-beta-lactamase superfamily protein  27.08 
 
 
314 aa  60.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.529395  normal  0.726567 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0532  ribonuclease Z  24.05 
 
 
319 aa  60.1  0.00000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2187  ribonuclease Z  25 
 
 
307 aa  60.5  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679584  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2095  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  23.86 
 
 
243 aa  60.1  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2837  ribonuclease Z  23.25 
 
 
307 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0349  ribonuclease Z  25.1 
 
 
307 aa  59.3  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1788  ribonuclease Z  22.79 
 
 
291 aa  58.5  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0053  ribonuclease Z  23.55 
 
 
314 aa  58.5  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1475  beta-lactamase superfamily hydrolase  25 
 
 
318 aa  58.2  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1776  ribonuclease Z  22.49 
 
 
299 aa  57.8  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14031  metallo-beta-lactamase superfamily protein  23.01 
 
 
327 aa  57.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.694516  normal  0.113121 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2011  ribonuclease Z  21.89 
 
 
393 aa  56.2  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2503  ribonuclease Z  34.75 
 
 
314 aa  55.8  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.638997 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5044  ribonuclease Z  26.98 
 
 
320 aa  55.8  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.574405  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3611  ribonuclease Z  34.75 
 
 
314 aa  55.8  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2403  ribonuclease Z  33.9 
 
 
345 aa  55.8  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.335232  hitchhiker  0.0000263844 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1451  ribonuclease Z  22.96 
 
 
381 aa  55.5  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3973  ribonuclease Z  23.57 
 
 
307 aa  55.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4250  ribonuclease Z  21.23 
 
 
307 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4210  ribonuclease Z  21.85 
 
 
307 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1641  Ribonuclease Z  24.83 
 
 
322 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0652  beta-lactamase domain-containing protein  26.06 
 
 
247 aa  53.9  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4274  ribonuclease Z  21.85 
 
 
307 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0985  ribonuclease Z  21.3 
 
 
307 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2014  ribonuclease Z  22.57 
 
 
291 aa  53.9  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.426384  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4049  ribonuclease Z  22.15 
 
 
307 aa  53.9  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3887  ribonuclease Z  22.15 
 
 
307 aa  53.9  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3895  ribonuclease Z  22.15 
 
 
307 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4364  ribonuclease Z  22.15 
 
 
307 aa  53.9  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05331  beta-lactamase superfamily hydrolase  23.44 
 
 
318 aa  53.5  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4164  ribonuclease Z  22.15 
 
 
307 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0941  beta-lactamase domain-containing protein  26.19 
 
 
251 aa  53.1  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.504318 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2102  ribonuclease Z  24.53 
 
 
305 aa  52.8  0.000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1012  beta-lactamase domain protein  24.68 
 
 
256 aa  52  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1365  hypothetical protein  25.51 
 
 
312 aa  51.6  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000739768  hitchhiker  0.0000000312864 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1678  beta-lactamase domain-containing protein  22.8 
 
 
305 aa  51.2  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.554215  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1563  Ribonuclease Z  23.93 
 
 
323 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2276  ribonuclease Z  24.7 
 
 
308 aa  50.1  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1179  ribonuclease Z  34.78 
 
 
318 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.777962 
 
 
-
 
NC_002950  PG0739  ribonuclease Z  23.55 
 
 
304 aa  49.3  0.00007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1716  ribonuclease Z  23.59 
 
 
316 aa  49.7  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1173  putative periplasmic protein  25.32 
 
 
312 aa  49.7  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1068  putative periplasmic protein  25.32 
 
 
312 aa  49.7  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>