67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0060 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0060  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 287 aa  587  1e-167  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1486  metal-dependent hydrolase  33.56 
 
 		 279 aa  159  4e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02966  beta-lactamase-like protein  32.29 
 
 		 280 aa  157  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1275  beta-lactamase-like  33.56 
 
 		 279 aa  148  8e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4229  beta-lactamase domain protein  31.63 
 
 		 309 aa  137  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2383  beta-lactamase domain-containing protein  36.6 
 
 		 320 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1985  beta-lactamase-like  31.75 
 
 		 295 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.278076  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4228  beta-lactamase domain protein  33.46 
 
 		 283 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.470343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0048  beta-lactamase domain-containing protein  30.63 
 
 		 333 aa  133  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.514639  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2296  beta-lactamase domain protein  32.16 
 
 		 302 aa  133  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.557207 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4119  hypothetical protein  30.14 
 
 		 284 aa  132  6.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.376643  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0877  putative phytochrome sensor protein  33.46 
 
 		 603 aa  130  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0810026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2865  beta-lactamase-like  31.68 
 
 		 304 aa  129  4.0000000000000003e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.627483  normal  0.13634 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2117  Beta-lactamase-like  32.84 
 
 		 298 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0550  beta-lactamase domain protein  31.72 
 
 		 278 aa  127  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.145975 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2334  beta-lactamase domain-containing protein  33.46 
 
 		 289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.121842  normal  0.0743875 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2311  beta-lactamase domain protein  34.55 
 
 		 285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.519081 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0627  hypothetical protein  31.85 
 
 		 305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2260  beta-lactamase domain protein  34.55 
 
 		 285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3215  beta-lactamase domain-containing protein  28.32 
 
 		 295 aa  124  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1865  beta-lactamase-like  31.37 
 
 		 305 aa  124  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.523835  normal  0.165286 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0276  beta-lactamase domain-containing protein  32.3 
 
 		 308 aa  123  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0537397  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1047  beta-lactamase domain-containing protein  32.68 
 
 		 313 aa  123  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3257  beta-lactamase domain-containing protein  30.34 
 
 		 308 aa  123  5e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4027  beta-lactamase domain protein  33.46 
 
 		 296 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.961759 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1811  Beta-lactamase-like  32.93 
 
 		 282 aa  122  7e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0338  beta-lactamase-like protein  28.27 
 
 		 275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4587  beta-lactamase domain-containing protein  28.2 
 
 		 276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4970  beta-lactamase domain protein  30.59 
 
 		 301 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0202653 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1367  putative phytochrome sensor protein  35.66 
 
 		 607 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.829477  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4637  beta-lactamase-like  30.65 
 
 		 301 aa  116  5e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5603  metal dependant beta lactamase protein  29.37 
 
 		 276 aa  116  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6342  beta-lactamase domain protein  33.72 
 
 		 284 aa  116  5e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4456  beta-lactamase domain-containing protein  30.15 
 
 		 349 aa  113  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.616956 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4920  beta-lactamase domain protein  30.2 
 
 		 301 aa  114  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1257  ElaC, metal-dependent hydrolase of the beta- lactamase superfamily  27.8 
 
 		 294 aa  113  4.0000000000000004e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0591  beta-lactamase domain-containing protein  30.6 
 
 		 323 aa  110  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.189752  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6341  beta-lactamase domain protein  28.86 
 
 		 322 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7099  putative hydrolase protein, beta-lactamase superfamily  27.17 
 
 		 276 aa  109  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.760297  normal  0.767931 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5955  beta-lactamase domain protein  28.4 
 
 		 276 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.512599  normal  0.0645394 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3638  beta-lactamase domain protein  29.81 
 
 		 309 aa  100  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0325098  hitchhiker  0.00134063 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1541  metallo-beta-lactamase family protein  27.41 
 
 		 320 aa  95.5  9e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1236  beta-lactamase superfamily hydrolase  27.43 
 
 		 320 aa  91.7  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0138314 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2297  metal-dependent hydrolase  27.87 
 
 		 280 aa  91.3  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3807  beta-lactamase superfamily hydrolase  28.93 
 
 		 323 aa  89  8e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200749 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1994  metallo-beta-lactamase family protein  28.16 
 
 		 320 aa  82  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0701342  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2700  hypothetical protein  26.91 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0700  beta-lactamase domain protein  26.74 
 
 		 270 aa  75.5  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3546  hypothetical protein  28.64 
 
 		 299 aa  69.3  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.285484  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2095  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  27.91 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0941  beta-lactamase domain-containing protein  26.59 
 
 		 251 aa  50.1  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.504318 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0053  ribonuclease Z  24.39 
 
 		 314 aa  49.7  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  24.48 
 
 		 306 aa  49.7  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6115  beta-lactamase domain protein  27.2 
 
 		 243 aa  47  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0739  ribonuclease Z  26.36 
 
 		 304 aa  45.8  0.0007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2187  ribonuclease Z  24.48 
 
 		 307 aa  45.8  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679584  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1970  beta-lactamase domain protein  27.69 
 
 		 253 aa  45.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8808  beta-lactamase domain protein  32.17 
 
 		 243 aa  45.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0652  beta-lactamase domain-containing protein  25.61 
 
 		 247 aa  44.3  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4186  metallo-beta-lactamase family protein  25 
 
 		 244 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.167335  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2014  ribonuclease Z  39.66 
 
 		 291 aa  43.9  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.426384  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4169  ribonuclease Z  34.74 
 
 		 314 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.406356  normal  0.0568624 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1166  metallo-beta-lactamase family protein  25.82 
 
 		 244 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0076  ribonuclease Z  25 
 
 		 310 aa  42.7  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.887393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1005  beta-lactamase domain-containing protein  25.41 
 
 		 244 aa  42.7  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1088  hypothetical protein  25.2 
 
 		 244 aa  42.4  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1016  hypothetical protein  25.2 
 
 		 244 aa  42.4  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>