129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5603 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5603  metal dependant beta lactamase protein  100 
 
 		 276 aa  575  1.0000000000000001e-163  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7099  putative hydrolase protein, beta-lactamase superfamily  62.32 
 
 		 276 aa  394  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.760297  normal  0.767931 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5955  beta-lactamase domain protein  61.96 
 
 		 276 aa  371  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.512599  normal  0.0645394 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4587  beta-lactamase domain-containing protein  54.35 
 
 		 276 aa  330  2e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4027  beta-lactamase domain protein  42.86 
 
 		 296 aa  235  7e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.961759 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2311  beta-lactamase domain protein  41.09 
 
 		 285 aa  229  4e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.519081 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2260  beta-lactamase domain protein  41.09 
 
 		 285 aa  229  4e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4970  beta-lactamase domain protein  41.48 
 
 		 301 aa  222  4e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0202653 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1047  beta-lactamase domain-containing protein  42.11 
 
 		 313 aa  221  9e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4637  beta-lactamase-like  41.2 
 
 		 301 aa  216  2e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2383  beta-lactamase domain-containing protein  39.29 
 
 		 320 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2334  beta-lactamase domain-containing protein  39.48 
 
 		 289 aa  214  9e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.121842  normal  0.0743875 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0550  beta-lactamase domain protein  37.5 
 
 		 278 aa  214  9.999999999999999e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.145975 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3257  beta-lactamase domain-containing protein  38.91 
 
 		 308 aa  213  2.9999999999999995e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4456  beta-lactamase domain-containing protein  41.48 
 
 		 349 aa  210  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.616956 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4920  beta-lactamase domain protein  41.48 
 
 		 301 aa  210  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2117  Beta-lactamase-like  38.91 
 
 		 298 aa  209  5e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1865  beta-lactamase-like  37.86 
 
 		 305 aa  208  7e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.523835  normal  0.165286 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1811  Beta-lactamase-like  40.89 
 
 		 282 aa  204  9e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0276  beta-lactamase domain-containing protein  38.35 
 
 		 308 aa  204  9e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0537397  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0338  beta-lactamase-like protein  36.1 
 
 		 275 aa  201  9e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2865  beta-lactamase-like  35.92 
 
 		 304 aa  191  8e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.627483  normal  0.13634 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3638  beta-lactamase domain protein  36.75 
 
 		 309 aa  179  4e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0325098  hitchhiker  0.00134063 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4119  hypothetical protein  33.94 
 
 		 284 aa  160  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.376643  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2296  beta-lactamase domain protein  34.01 
 
 		 302 aa  158  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.557207 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4229  beta-lactamase domain protein  35.31 
 
 		 309 aa  154  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1486  metal-dependent hydrolase  35.43 
 
 		 279 aa  151  1e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0591  beta-lactamase domain-containing protein  32.55 
 
 		 323 aa  147  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.189752  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0048  beta-lactamase domain-containing protein  30.62 
 
 		 333 aa  144  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.514639  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02966  beta-lactamase-like protein  35.06 
 
 		 280 aa  144  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0627  hypothetical protein  30.07 
 
 		 305 aa  138  8.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0877  putative phytochrome sensor protein  31.73 
 
 		 603 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0810026  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1541  metallo-beta-lactamase family protein  32.44 
 
 		 320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1275  beta-lactamase-like  31.82 
 
 		 279 aa  132  5e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1985  beta-lactamase-like  31.21 
 
 		 295 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.278076  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2700  hypothetical protein  28.83 
 
 		 301 aa  130  3e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3215  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 		 295 aa  128  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1257  ElaC, metal-dependent hydrolase of the beta- lactamase superfamily  28.72 
 
 		 294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1367  putative phytochrome sensor protein  31.35 
 
 		 607 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.829477  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6341  beta-lactamase domain protein  30.87 
 
 		 322 aa  127  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6342  beta-lactamase domain protein  30.4 
 
 		 284 aa  119  4.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4228  beta-lactamase domain protein  30.8 
 
 		 283 aa  116  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.470343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3546  hypothetical protein  28.47 
 
 		 299 aa  115  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.285484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0060  beta-lactamase domain protein  29.37 
 
 		 287 aa  116  5e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1994  metallo-beta-lactamase family protein  29.18 
 
 		 320 aa  110  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0701342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2297  metal-dependent hydrolase  30.2 
 
 		 280 aa  109  6e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3807  beta-lactamase superfamily hydrolase  27.83 
 
 		 323 aa  107  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200749 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1236  beta-lactamase superfamily hydrolase  27.27 
 
 		 320 aa  94.7  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0138314 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0700  beta-lactamase domain protein  26.67 
 
 		 270 aa  74.3  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2095  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  26.05 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  23.25 
 
 		 308 aa  65.9  0.0000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1970  beta-lactamase domain protein  28.83 
 
 		 253 aa  65.1  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0652  beta-lactamase domain-containing protein  24.82 
 
 		 247 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2542  ribonuclease Z  24.38 
 
 		 341 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.144505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2497  ribonuclease Z  24.38 
 
 		 341 aa  56.6  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.883053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1641  Ribonuclease Z  25.6 
 
 		 322 aa  56.2  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2553  ribonuclease Z  24.38 
 
 		 305 aa  55.8  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2449  ribonuclease Z  24.38 
 
 		 305 aa  55.8  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2657  ribonuclease Z  24.38 
 
 		 305 aa  55.8  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02195  ribonuclease Z  24.3 
 
 		 305 aa  55.8  0.0000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1389  ribonuclease BN  24.3 
 
 		 311 aa  55.8  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471365  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09930  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  27.27 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.65106  normal  0.185671 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0654  ribonuclease Z  22.57 
 
 		 307 aa  55.8  0.0000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.296839  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2414  ribonuclease Z  24.3 
 
 		 305 aa  55.8  0.0000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1380  ribonuclease Z  24.3 
 
 		 305 aa  55.8  0.0000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.867836 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02154  hypothetical protein  24.3 
 
 		 305 aa  55.8  0.0000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.871793  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0053  ribonuclease Z  23.84 
 
 		 314 aa  55.5  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0659  ribonuclease Z  23.59 
 
 		 309 aa  55.5  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.089983  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2647  ribonuclease Z  24.3 
 
 		 305 aa  55.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.313305  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1563  Ribonuclease Z  25 
 
 		 323 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1951  ribonuclease Z  20.07 
 
 		 308 aa  54.7  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00782694  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1613  ribonuclease Z  21.95 
 
 		 316 aa  54.7  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2565  ribonuclease Z  24.3 
 
 		 305 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.848275  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3410  ribonuclease Z  23.94 
 
 		 311 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1716  ribonuclease Z  21.91 
 
 		 316 aa  53.1  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1360  ribonuclease Z  21.95 
 
 		 316 aa  52  0.000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0966966  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1870  ribonuclease Z  22.49 
 
 		 309 aa  52  0.000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0076  ribonuclease Z  24.28 
 
 		 310 aa  52.4  0.000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.887393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0920  RNAse Z  21.82 
 
 		 314 aa  51.6  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1558  sulphohydrolase/glycosulfatase, Zn-dependent hydrolase  26.64 
 
 		 248 aa  52  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.136554  normal  0.849954 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2424  ribonuclease Z  23.59 
 
 		 311 aa  52  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.94801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17761  metallo-beta-lactamase superfamily protein  21.52 
 
 		 314 aa  50.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.529395  normal  0.726567 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0563  beta-lactamase domain-containing protein  25.37 
 
 		 248 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14031  metallo-beta-lactamase superfamily protein  21.95 
 
 		 327 aa  50.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.694516  normal  0.113121 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2397  metallo-beta-lactamase  24.18 
 
 		 283 aa  49.3  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15501  metallo-beta-lactamase superfamily protein  22.07 
 
 		 312 aa  48.9  0.00008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0532  ribonuclease Z  31.11 
 
 		 319 aa  47.4  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2011  ribonuclease Z  28.57 
 
 		 393 aa  48.1  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2102  ribonuclease Z  21.39 
 
 		 305 aa  47.8  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0927  ribonuclease Z  25.87 
 
 		 305 aa  47.8  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15351  metallo-beta-lactamase superfamily protein  22.37 
 
 		 312 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1210  ribonuclease Z  20.79 
 
 		 309 aa  47  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3197  ribonuclease Z  25.64 
 
 		 328 aa  47  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  22.57 
 
 		 306 aa  47.4  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1441  beta-lactamase domain protein  23.75 
 
 		 330 aa  47.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0828256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  23.89 
 
 		 305 aa  46.6  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1973  ribonuclease Z  25.86 
 
 		 313 aa  45.8  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.32417 
 
 
-
 
NC_002950  PG0739  ribonuclease Z  27.17 
 
 		 304 aa  45.1  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2818  ribonuclease Z  23.91 
 
 		 305 aa  44.7  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.99083 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3973  ribonuclease Z  22.67 
 
 		 307 aa  44.7  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>