119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_10848 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011672  PHATRDRAFT_10848  predicted protein  100 
 
 
261 aa  530  1e-149  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_3120  predicted protein  42.74 
 
 
241 aa  198  7e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11563  predicted protein  41 
 
 
238 aa  191  1e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.684972  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_5235  predicted protein  35.41 
 
 
263 aa  171  1e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.540131  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04987  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit (PKA regulatory subunit) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O59922]  32.12 
 
 
412 aa  141  9.999999999999999e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.599779  normal  0.51731 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05510  cAMP-dependent protein kinase inhibitor, putative  30.91 
 
 
482 aa  140  3e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82287  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit (PKA regulatory subunit)  31.33 
 
 
441 aa  120  1.9999999999999998e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.770378 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_12211  predicted protein  33.16 
 
 
528 aa  98.2  1e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12655  predicted protein  25.77 
 
 
260 aa  89.7  4e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2593  cyclic nucleotide-binding protein  23.36 
 
 
707 aa  62.8  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000223415 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2230  hypothetical protein  37.96 
 
 
356 aa  62  0.000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00323716 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5417  cyclic nucleotide-binding protein  27.78 
 
 
419 aa  62  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0881735  normal  0.0681678 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3368  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.91 
 
 
503 aa  58.9  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00879958  normal  0.135189 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4167  cyclic nucleotide-binding protein  31.78 
 
 
570 aa  58.9  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3152  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24 
 
 
487 aa  53.9  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.833452  normal  0.47191 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27248  predicted protein  24 
 
 
680 aa  53.5  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.2735 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29662  predicted protein  24 
 
 
680 aa  53.5  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.226582  normal  0.0425728 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4520  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.2 
 
 
236 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4796  cyclic nucleotide-binding (cNMP-bd) protein  28.89 
 
 
263 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370555  unclonable  0.0000216721 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0664  cyclic nucleotide-binding  31.43 
 
 
449 aa  51.6  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0101822  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36130  cAMP-binding protein  27.59 
 
 
224 aa  52  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.758224 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0496  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.97 
 
 
129 aa  51.2  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3370  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 
425 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0343  cyclic nucleotide-binding protein  26.72 
 
 
811 aa  51.2  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0783507  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3727  cyclic nucleotide-binding protein  28.99 
 
 
167 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00887093 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12584  glutamine-transport ATP-binding protein ABC transporter glnQ  34.29 
 
 
330 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.516819 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2732  cyclic nucleotide-binding protein  33.33 
 
 
425 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4020  cyclic nucleotide-binding  26.89 
 
 
367 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109231  normal  0.727114 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.61 
 
 
226 aa  50.1  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4388  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.43 
 
 
225 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0617  cyclic nucleotide-binding protein  32.56 
 
 
577 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340501  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0253  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.09 
 
 
224 aa  49.7  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4601  cyclic nucleotide-binding protein  31.07 
 
 
154 aa  49.3  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.930738 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1793  cyclic nucleotide-binding protein  21.88 
 
 
1171 aa  49.3  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.18567  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3539  cyclic nucleotide-binding protein  25.45 
 
 
857 aa  49.3  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0290793  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5210  cyclic nucleotide-binding protein  29.82 
 
 
355 aa  49.3  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.465426  normal  0.688608 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3019  cyclic nucleotide-binding protein  30.48 
 
 
149 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.852704  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4405  cyclic nucleotide-binding protein  30.56 
 
 
148 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3546  cyclic nucleotide-binding  29.27 
 
 
124 aa  48.1  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.194157 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3345  cyclic nucleotide-binding protein  22.37 
 
 
417 aa  48.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.254717  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4944  cyclic nucleotide-binding protein  28.16 
 
 
454 aa  48.5  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658137  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0998  cyclic nucleotide-binding protein  30 
 
 
265 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000000222196  unclonable  1.0277600000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.93 
 
 
225 aa  48.5  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0301  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  23.87 
 
 
858 aa  48.1  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2624  cyclic nucleotide-binding protein  21.34 
 
 
1177 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10073  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  34.52 
 
 
330 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0512571 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0505  cyclic nucleotide-binding protein  24.58 
 
 
224 aa  47.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.287437  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3804  MscS Mechanosensitive ion channel  26.13 
 
 
495 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0841  cyclic nucleotide-binding protein  28.44 
 
 
160 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62260  hypothetical protein  29 
 
 
265 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000560596  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4027  cyclic nucleotide-binding protein  27.93 
 
 
413 aa  47  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2946  cyclic nucleotide-binding protein  27.59 
 
 
369 aa  47  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.360561  normal  0.390891 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3689  cyclic nucleotide-binding protein  28.7 
 
 
454 aa  47  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120597  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.59 
 
 
224 aa  47.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0772  cyclic nucleotide-binding protein  25.64 
 
 
164 aa  47  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3032  Crp family transcriptional regulator  31.18 
 
 
224 aa  46.2  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0461942  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2504  cyclic nucleotide-binding protein  26.55 
 
 
628 aa  45.8  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3852  cyclic nucleotide-binding protein  28.43 
 
 
713 aa  45.8  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.108661  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10105  hypothetical protein  28.57 
 
 
504 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3932  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.58 
 
 
224 aa  45.4  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.571672  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2514  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.74 
 
 
231 aa  45.1  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.619242 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4818  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.45 
 
 
224 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4904  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.45 
 
 
224 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5205  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.45 
 
 
224 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  hitchhiker  0.000819508 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1371  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.45 
 
 
224 aa  44.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0955358 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30628  predicted protein  26.46 
 
 
1085 aa  45.1  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0178  cyclic nucleotide-binding protein  29.25 
 
 
138 aa  45.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.220978  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  26.67 
 
 
243 aa  45.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0590  cyclic nucleotide-binding protein  25.58 
 
 
801 aa  45.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.120802  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3166  cyclic nucleotide-binding protein  25.77 
 
 
482 aa  45.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00363184  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5420  hypothetical protein  28 
 
 
265 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00117771  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3170  cyclic nucleotide-binding protein  29.57 
 
 
785 aa  45.4  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0158223  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0840  cyclic nucleotide-binding protein  31.17 
 
 
350 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.126759 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1494  cyclic nucleotide-binding protein  36.26 
 
 
119 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00548568  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1513  cyclic nucleotide-binding protein  31.25 
 
 
308 aa  44.3  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00604424  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5435  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.45 
 
 
224 aa  44.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2918  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.61 
 
 
226 aa  44.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172063  normal  0.392966 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_4561  predicted protein  26.96 
 
 
121 aa  44.3  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0295097 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2894  cyclic nucleotide-binding protein  25.77 
 
 
482 aa  43.9  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00660929  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3910  cyclic nucleotide-binding protein  30.21 
 
 
167 aa  44.3  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.34683  normal  0.175845 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4351  cyclic nucleotide-binding protein  26.32 
 
 
948 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2519  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  23.38 
 
 
492 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.806579  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0718  cyclic nucleotide-binding  23.2 
 
 
747 aa  43.5  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00567448  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0079  hypothetical protein  26.61 
 
 
169 aa  43.5  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.26747 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13268  transmembrane transport protein  29.29 
 
 
1048 aa  43.9  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.321047 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  23.32 
 
 
226 aa  43.9  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  26.88 
 
 
637 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1573  cyclic nucleotide-binding  25 
 
 
158 aa  43.5  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.490025  hitchhiker  0.00990577 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2323  CRP/FNR family transcriptional regulator  25 
 
 
233 aa  43.5  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00053006  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13707  Cpr/FNR family transcriptional regulator  24.55 
 
 
224 aa  43.5  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0333343 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0049  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.17 
 
 
252 aa  43.5  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.422683  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2712  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  21.47 
 
 
507 aa  43.5  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0470198  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2911  cyclic nucleotide-binding protein  22.98 
 
 
1124 aa  43.1  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.965385  normal  0.0176228 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3713  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  31.71 
 
 
613 aa  43.5  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000235103  unclonable  0.0000000288509 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1108  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.57 
 
 
1075 aa  43.5  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000733786  normal  0.267995 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04510  cyclic nucleotide-binding domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G03170)  27.36 
 
 
923 aa  43.1  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3249  cyclic nucleotide-binding protein  32.56 
 
 
171 aa  43.1  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4460  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.87 
 
 
171 aa  42.7  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.86 
 
 
225 aa  42.7  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7131  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.78 
 
 
155 aa  43.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.331754 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>